Cyklaza RNA-3'-fosforanowa
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| cyklazy RNA-3′-fosforanowej | |||||||||
| nr WE | 6.5.1.4 | ||||||||
| nr CAS | 85638-41-1 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
W enzymologii cyklaza RNA-3′-fosforanowa ( EC 6.5.1.4 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną
- ATP + RNA 3'-końcowy fosforan AMP + difosforan + RNA końcowy-2', 3'-cykliczny fosforan
Zatem dwoma substratami tego enzymu są ATP i 3'-końcowy-fosforan RNA, podczas gdy jego 3 produkty to AMP , difosforan i 2',3'-końcowy-fosforan RNA.
Enzym ten należy do rodziny ligaz , w szczególności tych tworzących wiązania fosforowo-estrowe. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to RNA-3'-fosforan: ligaza RNA (cyklizująca, tworząca AMP) . Enzym ten jest również nazywany cyklazą RNA .
Studia strukturalne
Od 2010 roku rozwiązano trzy struktury dla tej klasy enzymów, z kodami dostępu PDB i , (nieadenylowane ) i (adenylowane).
Dalsza lektura
- Filipowicz W, Konarska M, Gross HJ, Shatkin AJ (1983). „Aktywność 3'-końcowej cyklazy fosforanowej RNA i ligacja RNA w ekstrakcie komórkowym HeLa” . Kwasy nukleinowe Res . 11 (5): 1405–18. doi : 10.1093/nar/11.5.1405 . PMC 325805 . PMID 6828385 .
- Reinberg D, Arenas J, Hurwitz J (1985). „Enzymatyczna konwersja łańcuchów RNA zakończonych 3'-fosforanem do 2', 3'-cyklicznych pochodnych fosforanowych” . J. Biol. chemia . 260 (10): 6088–97. doi : 10.1016/S0021-9258(18)88941-4 . PMID 2581947 .
- ^ Filipowicz, W. (2016). „RNA 3'-końcowe cyklazy fosforanowe i białka cyklazopodobne” . Postępy Biochemii . 62 (3): 327–334. doi : 10.18388/pb.2016_32 . PMID 28132487 . S2CID 36153563 .
- ^ Palma, Gottfried J.; Billy, Eric; Filipowicz, Witold; Włodawer, Aleksander (2000). „Struktura krystaliczna 3'-końcowej cyklazy fosforanowej RNA, wszechobecnego enzymu o niezwykłej topologii” . Struktura . 8 (1): 13–23. doi : 10.1016/S0969-2126(00)00076-9 . PMID 10673421 .
Kategorie: