Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
DHX9
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, DDX9, LKP, NDH2, NDHII, RHA, RNA Helikaza A, DEAH-box helicase 9, DExH-box helicase 9
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
ATP-zależna helikaza RNA A ( RHA ; znana również jako DHX9, LKP i NDHI) jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen DHX9 .
Funkcjonować
Helikazy pudełkowe DEAD / DEAH są białkami i są domniemanymi helikazami RNA . Są zaangażowane w szereg procesów komórkowych obejmujących zmianę drugorzędowej struktury RNA, takich jak inicjacja translacji, splicing jądrowy i mitochondrialny oraz składanie rybosomów i spliceosomów. Na podstawie wzorców ich rozmieszczenia uważa się, że niektórzy członkowie tej rodziny biorą udział w embriogenezie, spermatogenezie oraz wzroście i podziale komórkowym. Ten gen koduje białko DEAD box z aktywnością helikazy RNA. Może uczestniczyć w topieniu hybryd DNA:RNA, takich jak te, które występują podczas transkrypcji, i może odgrywać rolę w ekspresji genów sprzężonych z X. Zawiera 2 kopie dwuniciowej domeny wiążącej RNA, domenę rdzeniową DEXH i kasetę RGG. Domeny wiążące RNA i kaseta RGG wpływają i regulują aktywność helikazy RNA. The DHX9 znajduje się na długim ramieniu q chromosomu 1 .
Interakcje
Wykazano, że DHX9 wchodzi w interakcje z:
Dalsza lektura
Lee CG, Hurwitz J (marzec 1992). „Nowa helikaza RNA wyizolowana z komórek HeLa, która katalitycznie przemieszcza się w kierunku 3 'do 5'” . Journal of Biological Chemistry . 267 (7): 4398–407. doi : 10.1016/S0021-9258(18)42849-9 . PMID 1537828 .
Lee CG, Zamore PD, Green MR, Hurwitz J (czerwiec 1993). „Aktywność wyżarzania RNA jest nierozerwalnie związana z U2AF” . Journal of Biological Chemistry . 268 (18): 13472-8. doi : 10.1016/S0021-9258(19)38673-9 . PMID 7685763 .
Abdelhaleem MM, Hameed S, Klassen D, Greenberg AH (marzec 1996). „Leukofizyna: cząsteczka związana z helikazą A RNA zidentyfikowana w ziarnistościach i pęcherzykach cytotoksycznych komórek T” . Journal of Immunology . 156 (6): 2026–35. PMID 8690889 .
Nakajima T, Uchida C, Anderson SF, Lee CG, Hurwitz J, Parvin JD, Montminy M (wrzesień 1997). „Helikaza RNA A pośredniczy w asocjacji CBP z polimerazą RNA II” . komórka . 90 (6): 1107–12. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80376-1 . PMID 9323138 . S2CID 16819946 .
Loor G, Zhang SJ, Zhang P, Toomey NL, Lee MY (grudzień 1997). „Identyfikacja replikacji DNA i białek cyklu komórkowego, które oddziałują z PCNA” . Badania kwasów nukleinowych . 25 (24): 5041–6. doi : 10.1093/nar/25.24.5041 . PMC 147130 . PMID 9396813 .
Lee CG, Eki T, Okumura K, da Costa Soares V, Hurwitz J (luty 1998). „Analiza molekularna cDNA i genomowego DNA kodującego mysią helikazę RNA A”. Genomika . 47 (3): 365–71. doi : 10.1006/geno.1997.5139 . PMID 9480750 .
Anderson SF, Schlegel BP, Nakajima T, Wolpin ES, Parvin JD (lipiec 1998). „Białko BRCA1 jest połączone z kompleksem holoenzymu polimerazy RNA II poprzez helikazę RNA A” . Genetyka przyrody . 19 (3): 254-6. doi : 10.1038/930 . PMID 9662397 . S2CID 10953768 .
Lee CG, da Costa Soares V, Newberger C, Manova K, Lacy E, Hurwitz J (listopad 1998). „Helikaza A RNA jest niezbędna do normalnej gastrulacji” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (23): 13709–13. Bibcode : 1998PNAS...9513709L . doi : 10.1073/pnas.95.23.13709 . PMC 24884 . PMID 9811865 .
Li J, Tang H, Mullen TM, Westberg C, Reddy TR, Rose DW, Wong-Staal F (styczeń 1999). „Rola helikazy RNA A w potranskrypcyjnej regulacji wirusa HIV typu 1” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 96 (2): 709–14. Bibcode : 1999PNAS...96..709L . doi : 10.1073/pnas.96.2.709 . PMC 15201 . PMID 9892698 .
Tang H, McDonald D, Middlesworth T, Hope TJ, Wong-Staal F (maj 1999). „Koniec karboksylowy helikazy A RNA zawiera dwukierunkową domenę transportu jądrowego” . Biologia molekularna i komórkowa . 19 (5): 3540–50. doi : 10.1128/mcb.19.5.3540 . PMC84146 . _ PMID 10207077 .
Westberg C, Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (lipiec 2000). „Nowe białko wahadłowe wiąże się z helikazą A RNA i aktywuje retrowirusowy konstytutywny element transportowy” . Journal of Biological Chemistry . 275 (28): 21396–401. doi : 10.1074/jbc.M909887199 . PMID 10748171 .
Tang H, Wong-Staal F (październik 2000). „Specyficzna interakcja między helikazą RNA A i Tap, dwoma białkami komórkowymi, które wiążą się z konstytutywnym elementem transportowym retrowirusa typu D” . Journal of Biological Chemistry . 275 (42): 32694–700. doi : 10.1074/jbc.M003933200 . PMID 10924507 .
Lee CG, Eki T, Okumura K, Nogami M, Soares Vda C, Murakami Y, Hanaoka F, Hurwitz J (styczeń 1999). „Gen ludzkiej helikazy RNA A (DDX9) odwzorowuje locus podatności na raka prostaty na prążku chromosomu 1q25 i jego pseudogenie (DDX9P) odpowiednio na 13q22”. Genetyka komórek somatycznych i molekularnych . 25 (1): 33–9. doi : 10.1023/B:SCAM.0000007138.44216.3a . PMID 10925702 . S2CID 29684315 .
Reddy TR, Tang H, Xu W, Wong-Staal F (lipiec 2000). „Sam68, helikaza RNA A i Tap współpracują w posttranskrypcyjnej regulacji ludzkiego wirusa niedoboru odporności i retrowirusowego mRNA typu D” . Onkogen . 19 (32): 3570–5. doi : 10.1038/sj.onc.1203676 . PMID 10951562 .
Pellizzoni L, Charroux B, Rappsilber J, Mann M, Dreyfuss G (styczeń 2001). „Funkcjonalna interakcja między kompleksem neuronów ruchowych przetrwania a polimerazą RNA II” . Journal of Cell Biology . 152 (1): 75–85. doi : 10.1083/jcb.152.1.75 . PMC 2193649 . PMID 11149922 .
Takasaki Y, Kogure T, Takeuchi K, Kaneda K, Yano T, Hirokawa K, Hirose S, Shirai T, Hashimoto H (kwiecień 2001). „Reaktywność mysich przeciwciał monoklonalnych przeciw antygenowi jądrowemu komórek (PCNA) i ludzkich autoprzeciwciał na wielobiałkowe kompleksy PCNA zaangażowane w proliferację komórek” . Journal of Immunology . 166 (7): 4780–7. doi : 10.4049/jimmunol.166.7.4780 . PMID 11254741 .
Yang JP, Tang H, Reddy TR, Wong-Staal F (sierpień 2001). „Mapowanie domen funkcjonalnych HAP95, białka, które wiąże helikazę A RNA i aktywuje konstytutywny element transportowy retrowirusów typu D” . Journal of Biological Chemistry . 276 (33): 30694–700. doi : 10.1074/jbc.M102809200 . PMID 11402034 .
Aratani S, Fujii R, Oishi T, Fujita H, Amano T, Ohshima T, Hagiwara M, Fukamizu A, Nakajima T (lipiec 2001). „Podwójne role helikazy RNA A w transkrypcji zależnej od CREB” . Biologia molekularna i komórkowa . 21 (14): 4460–9. doi : 10.1128/MCB.21.14.4460-4469.2001 . PMC87106 . _ PMID 11416126 .
Galeria PDB
1uil : Dwuniciowy motyw wiążący RNA hipotetycznego białka BAB28848