Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
Identyfikatory RNF216
, CAHH, TRIAD3, U7I1, UBCE7IP1, ZIN, białko palca serdecznego 216
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Ligaza białkowa ubikwitynowa E3 RNF216 jest enzymem kodowanym u ludzi przez gen RNF216 .
Gen ten koduje białko cytoplazmatyczne, które specyficznie kolokalizuje i oddziałuje z kinazą białkową serynowo/treoninową, białkiem oddziałującym z receptorem (RIP). Domeny palca cynkowego kodowanego białka są wymagane do jego interakcji z RIP i do hamowania szlaków aktywacji NF-kappa B indukowanych TNF i IL1. Kodowane białko może również działać jako ligaza ubikwityna-białko E3, która przyjmuje ubikwitynę z enzymów koniugujących ubikwitynę E2 i przenosi ją na substraty. Dla tego locus opisano kilka wariantów transkryptu poddanych alternatywnemu składaniu, ale znany jest charakter pełnej długości tylko niektórych.
Zobacz też
Interakcje
Wykazano, że RNF216 oddziałuje z TLR9 i RIPK1 .
Dalsza lektura
Lake JA, Carr J, Feng F i in. (2003). „Rola Vif podczas zakażenia HIV-1: interakcja z nowymi czynnikami komórkowymi gospodarza”. J. Clin. Wirol . 26 (2): 143–52. doi : 10.1016/S1386-6532(02)00113-0 . PMID 12600646 .
Matoba R, Okubo K, Hori N i in. (1994). „Dodanie informacji kodującej 5' do biblioteki cDNA skierowanej na 3' poprawia analizę ekspresji genów”. Gene . 146 (2): 199–207. doi : 10.1016/0378-1119(94)90293-3 . PMID 8076819 .
van der Reijden BA, Erpelinck-Verschueren CA, Löwenberg B, Jansen JH (1999). „TRIAD: nowa klasa białek z nową sygnaturą bogatą w cysteinę” . Białko Sci . 8 (7): 1557–61. doi : 10.1110/ps.8.7.1557 . PMC 2144383 PMID 10422847 .
Wang X, Stollar BD (1999). „Ekspresja genu immunoglobuliny VH w procesie starzenia się człowieka”. Clin. Immunol . 93 (2): 132–42. doi : 10.1006/klimat.1999.4781 . PMID 10527689 .
Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (2001). „Klonowanie DNA za pomocą rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Genom Res . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 PMID 11076863 .
Wiemann S, Weil B, Wellenreuther R i in. (2001). „W stronę katalogu ludzkich genów i białek: sekwencjonowanie i analiza 500 nowych, kompletnych białek kodujących ludzkie cDNA” . Genom Res . 11 (3): 422–35. doi : 10.1101/gr.GR1547R . PMC 311072 PMID 11230166 .
Simpson JC, Wellenreuther R, Poustka A i in. (2001). „Systematyczne umiejscowienie subkomórkowe nowych białek zidentyfikowanych przez sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Przedstawiciel EMBO 1 (3): 287–92. doi : 10.1093/embo-reports/kvd058 . PMC 1083732 PMID 11256614 .
Chen D, Li X, Zhai Z, Shu HB (2002). „Nowe białko palca cynkowego oddziałuje z białkiem oddziałującym z receptorem (RIP) i hamuje aktywację NF-kappa B indukowaną przez czynnik martwicy nowotworu (TNF) i IL1” . J. Biol. Chem . 277 (18): 15985–91. doi : 10.1074/jbc.M108675200 PMID 11854271 .
Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA ludzkich i mysich” . Proc. Natl. Acad. Nauka. USA . 99 (26): 16899–903. Kod Biblijny : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 PMC 139241 PMID 12477932 .
Hillier LW, Fulton RS, Fulton LA i in. (2003). „Sekwencja DNA ludzkiego chromosomu 7” . Natura . 424 (6945): 157–64. Kod Bib : 2003Natur.424..157H . doi : 10.1038/natura01782 PMID 12853948 .
Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 ludzkich cDNA pełnej długości” . Nat. Geneta . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 PMID 14702039 .
Chuang TH, Ulevitch RJ (2004). „Triad3A, ligaza białkowa ubikwityny E3 regulująca receptory Toll-podobne”. Nat. Immunol . 5 (5): 495–502. doi : 10.1038/ni1066 . PMID 15107846 . S2CID 39773935 .
Feng F, Davis A, Lake JA i in. (2004). „Białko palca serdecznego ZIN oddziałuje z ludzkim wirusem niedoboru odporności typu 1 Vif” . J. Virol . 78 (19): 10574–81. doi : 10.1128/JVI.78.19.10574-10581.2004 . PMC 516435 PMID 15367624 .
Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i rozwój projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 PMID 15489334 .
Wiemann S, Arlt D, Huber W i in. (2004). „Od ORFeome do biologii: funkcjonalny rurociąg genomiki” . Genom Res . 14 (10B): 2136–44. doi : 10.1101/gr.2576704 . PMC 528930 PMID 15489336 .
Oh JH, Yang JO, Hahn Y i in. (2006). „Analiza transkryptomu ludzkiego raka żołądka”. Mam. Genom . 16 (12): 942–54. doi : 10.1007/s00335-005-0075-2 . PMID 16341674 . S2CID 69278 .
Mehrle A, Rosenfelder H, Schupp I i in. (2006). „Baza LIFEdb w 2006 roku” . Kwasy nukleinowe Res . 34 (problem z bazą danych): D415–8. doi : 10.1093/nar/gkj139 . PMC 1347501 PMID 16381901 .
Obawia się C, Pan Q, Mathison JC, Chuang TH (2006). „Triad3A reguluje ubikwitynację i degradację proteasomów RIP1 po przerwaniu wiązania Hsp90” . J. Biol. Chem . 281 (45): 34592–600. doi : 10.1074/jbc.M604019200 PMID 16968706 .
Linki zewnętrzne
