Reidun Twarock

Reidun Twarock
Reidun Twarock.jpg
Narodowość Niemiecki
Alma Mater Technische Universität Clausthal
Znany z Biologia matematyczna , Wirusologia , Bioinformatyka
Kariera naukowa
Pola Matematyk , biolog
Instytucje Uniwersytet Yorku

Reidun Twarock ( niemiecki: [ˈʁaɪdɐn ˈtvæʁɔk] ) to urodzony w Niemczech biolog matematyczny na Uniwersytecie w Yorku . Znana jest z opracowywania modeli matematycznych wirusów opartych na sieciach wielowymiarowych .

Edukacja

Twarock początkowo studiował fizykę matematyczną na uniwersytetach w Kolonii i Bath . Podczas doktoratu na Technische Universität Clausthal eksperymentowała z modelami mechaniki kwantowej ograniczonymi do powierzchni kuli.

Badania

Na początku XXI wieku, myśląc o kafelkach Penrose'a i różnych sposobach podziału powierzchni kuli, Twarock stworzył model opisujący wyjątkową budowę Papovaviridae . Prawie wszystkie dwudziestościenne wirusy mają białka na swoich kapsydach ułożone w klastry po pięć i sześć, ze strukturą dopuszczającą co najwyżej 12 klastrów po pięć, ale Papovaviridae, w tym HPV , mają 72 klastry po pięć Ten układ białek nie odpowiada żadnemu znanemu sferycznemu wielościanowi do matematyki.

Następnie Twarock zajął się wirusologią. Struktura wirusa HK97 była również wyjątkowa, nie modelowana przez żaden wielościan Goldberga . Wirusologia matematyczna wcześniej badała tylko powierzchnie wirusów, używając modeli, które były przechyleniami 2- sfery ; Twarock miał nadzieję pójść dalej, modelować trójwymiarową strukturę białek i wnętrze wirusów, w których upakowany jest ich genom .

Wiadomo było, że za pomocą rotacji można wygenerować wzorce białek wirusowych z pojedynczego kształtu, kopiując go i przesuwając w sposób zachowujący symetrię. Twarock dodał zewnętrzną translację do tego procesu generowania, co stworzyło dość złożone wzory punktów w przestrzeni 3D. Okazało się, że wzorce te dokładnie przewidują kształt i rozmiar białek, a także strukturę zapakowanego materiału genetycznego dla wielu wirusów, w tym Nodaviridae .

Modele okazały się przydatne do badania składania wirusów RNA , które obejmuje białka wiążące się z określonymi częściami genomu, które kończą się w trójwymiarowych lokalizacjach, które można określić matematycznie. Więcej informacji uzyskano przy użyciu metody „wytnij i projektuj” generowania nachylenia penrose'a . Jej modele można traktować jako zgniecione trójwymiarowe obrazy 6-sześciennych płytek o strukturze plastra miodu, które są sześciowymiarową wersją trójwymiarowego czworościennego-ośmiościennego plastra miodu . Różne wirusy są modelowane przez różne podzbiory wierzchołków tej sieci. Wirusy wydają się wykorzystywać te wzorce, ponieważ są one najbardziej stabilnym sposobem łączenia wielu oddziałujących na siebie warstw, z których wszystkie mają dwudziestościenną symetrię .

Jej praca ma zastosowanie w badaniu nanomateriałów .

Nagrody i wyróżnienia

Zobacz też

Linki zewnętrzne