Rhizobium binae

Klasyfikacja naukowa
Rhizobium binae
Domena: Bakteria
Gromada: Pseudomonadota
Klasa: Alfaproteobakterie
Zamówienie: Hyfomikrobiale
Rodzina: Rhizobaceae
Rodzaj: Ryzob
Gatunek:
R. binae
Nazwa dwumianowa
Rhizobium binae
Harun-lub Rashid i in. 2015

Rhizobium binae to gram-ujemna bakteria wyizolowana z guzków korzeni soczewicy w Bangladeszu .

Opis

Rhizobium binae to bakterie w kształcie pałeczek występujące w glebie. Wymagają tlenu i nie tworzą zarodników .

Rhizobium binae dobrze rośnie na podłożu agarowym YEMA , gdzie tworzy kolonie okrągłe, wypukłe i kremowobiałe. Szczepy przeżywają przy pH pomiędzy 5,5 a 10. Są bardzo wrażliwe na ampicylinę i oporne na kanamycynę i kwas nalidyksowy . Szczepy nie tolerują tetracykliny i nie rosną na podłożu LB.

Rhizobium binae może wykorzystywać różnorodne składniki odżywcze, w tym dekstrynę , D-maltozę, D-trehalozę, D-celobiozę, gentiobiozę , sacharozę , D-rafinozę, α-D-glukozę, D-turanozę, α-D laktozę, D-fruktozę , D-melibioza, β-metylo-D-glukozyd, salicyna , N-acetylo-D-galaktozamina, D-mannoza , D-galaktoza , D-mannitol , D-sorbitol, D-arabitol, glicerol , D-glukoza-6 -fosforan, D-fruktozo-6-fosforan, D-alanina , kwas L-asparaginowy , L-histydyna , kwas l-piroglutaminowy, kwas chinowy , kwas D-sacharowy, pirogronian metylu , kwas L-mlekowy, kwas cytrynowy , kwas D-jabłkowy, kwas L-jabłkowy, kwas bromo-bursztynowy, β-hydroksy-d,l -kwas masłowy i kwas octowy . R. binae nie może wykorzystywać składników odżywczych: N-acetylo-D-mannozamina, 3-metyloglukoza, inozyna , glicylo-L-prolina, L-arginina , kwas D-galakturonowy , kwas D-glukuronowy , glukuronamid , kwas p-hydroksy-fenylooctowy, ester metylowy kwasu D-mlekowego, kwas α-keto-glutarowy, tween 40 , kwas propionowy lub kwas mrówkowy .

Rhizobium binae może rosnąć w obecności antybiotyków linkomycyny i tellurynu potasu , ale nie w obecności 1% mleczanu sodu , troleandomycyny , chlorku litu lub maślanu sodu .

Typowym szczepem R. binae jest szczep BLR195T (=LMG 28443T = DSM 29288T).

Aplikacje

Różne szczepy tego gatunku mogą tworzyć efektywne brodawki i wspomagać wzrost soczewicy, grochu i latyrusu, a także są przydatne do produkcji bionawozów.

Genetyka

Rhizobium binae jest genetycznie bardzo podobny do swoich bliskich krewnych Rhizobium etli i Rhizobumphaseoli . Zawartość GC w DNA szczepu typu R. binae wynosi 61,5%.

Sekwencja genomu jest dostępna w NCBI i europejskim archiwum nukleotydów .

Historia

Rhizobium binae został po raz pierwszy opisany w 2015 roku przez M. Haruna-lub Rashida i innych. Został wyizolowany z guzków korzeniowych Lens culinaris w dystrykcie Feni w Bangladeszu. Został nazwany „binae” jako skrót od Bangladeszskiego Instytutu Rolnictwa Jądrowego , instytutu badawczego, w którym pierwotnie badano tę bakterię.

Dalsza lektura

  • Rashid, MH, Gonzalez, H., Young, JPW i Wink, M. (2014) Rhizobium leguminosarum to symbiont soczewicy na Bliskim Wschodzie i w Europie, ale nie w Bangladeszu. Ekologia mikrobiologii FEMS, 87: 64 -77.
  • Rashid, MH, Schafer, H., Gonzalez, H i Wink, M. (2012) Genetyczna różnorodność ryzobii brodawkowatej soczewicy ( Lens culinaris ) w Bangladeszu. Mikrobiologia systematyczna i stosowana, 35: 98-109.

Linki zewnętrzne

Źródło: „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Rhizobium_binae&oldid=1081094276 ”