MSSF9

Identyfikatory
SRSF9
	, SFRS9, SRp30c, czynnik splicingu bogaty w serynę/argininę 9, czynnik splicingu bogaty w serynę i argininę 9 Identyfikatory
zewnętrzne
Lokalizacja genu ( Człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Ojej Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
Ortolodzy Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) Wyszukiwanie PubMed
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Czynnik splicingu, bogaty w argininę/serynę 9 , znany również jako SFRS9 , to ludzki gen kodujący białko SR zaangażowane w wybór miejsca splicingu w alternatywnym splicingu .

Interakcje

Wykazano, że SFRS9 oddziałuje z białkiem wiążącym Y-box 1 i NOL3 .

Dalsza lektura

•    Screaton GR, Cáceres JF, Mayeda A i in. (1995). „Identyfikacja i charakterystyka trzech członków rodziny ludzkich SR czynników splicingu pre-mRNA” . EMBO J. 14 (17): 4336–49. doi : 10.1002/j.1460-2075.1995.tb00108.x . PMC 394518 . PMID 7556075 .
•    Nayler O, Strätling W, Bourquin JP i in. (1998). „Białko SAF-B łączy transkrypcję i składanie pre-mRNA z elementami SAR/MAR” . Kwasy nukleinowe Res . 26 (15): 3542–9. doi : 10.1093/nar/26.15.3542 . PMC 147731 . PMID 9671816 .
•   Yuan Y; Li DM; Słońce H. (1998). „PIR1, nowa fosfataza, która wykazuje wysokie powinowactwo do RNA. Kompleksy rybonukleoproteinowe” . J. Biol. Chem . 273 (32): 20347–53. doi : 10.1074/jbc.273.32.20347 . PMID 9685386 .
•    Petersen-Mahrt SK, Estmer C, Ohrmalm C i in. (1999). „Białko związane z czynnikiem splicingu, p32, reguluje splicing RNA poprzez hamowanie wiązania i fosforylacji RNA ASF / SF2” . EMBO J. 18 (4): 1014–24. doi : 10.1093/emboj/18.4.1014 . PMC 1171193 . PMID 10022843 .
•   Stwosz O; Schwaiger FW; Cooper TA; Stamma S. (1999). „Alternatywny splicing określa lokalizację wewnątrzkomórkową nowego białka jądrowego Nop30 i jego interakcję z czynnikiem splicingu SRp30c” . J. Biol. Chem . 274 (16): 10951–62. doi : 10.1074/jbc.274.16.10951 . PMID 10196175 .
•    Elliott DJ, Bourgeois CF, Klink A i in. (2000). „Białko wiążące RNA specyficzne dla komórek rozrodczych ssaków oddziałuje z powszechnie wyrażanymi białkami zaangażowanymi w selekcję miejsca splicingu” . Proc. Natl. Acad. Nauka. USA . 97 (11): 5717–22. Kod Bib : 2000PNAS...97.5717E . doi : 10.1073/pnas.97.11.5717 . PMC 18499 . PMID 10823932 .
•   Stoss O, Olbrich M, Hartmann AM i in. (2001). „Białko z rodziny STAR / GSG rSLM-2 reguluje wybór alternatywnych miejsc składania” . J. Biol. Chem . 276 (12): 8665–73. doi : 10.1074/jbc.M006851200 . PMID 11118435 .
•    Denegri M, Chiodi I, Corioni M i in. (2002). „Ciała jądrowe wywołane stresem są miejscami akumulacji czynników przetwarzających pre-mRNA” . Mol. Biol. Komórka . 12 (11): 3502–14. doi : 10.1091/mbc.12.11.3502 . PMC 60271 . PMID 11694584 .
•    Andersen JS, Lyon CE, Fox AH i in. (2002). „Ukierunkowana analiza proteomiczna jąderka ludzkiego” . Aktualny Biol . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 . S2CID 14132033 .
•   Młody PJ, DiDonato CJ, Hu D i in. (2002). „Zależna od SRp30c stymulacja włączenia eksonu 7 neuronu ruchowego przeżycia (SMN) jest ułatwiona przez bezpośrednią interakcję z hTra2 beta 1” . Szum. Mol. Geneta . 11 (5): 577–87. doi : 10.1093/hmg/11.5.577 . PMID 11875052 .
•    Simard MJ; Chabota B. (2002). „SRp30c jest represorem wykorzystania miejsca splotu 3'” . Mol. Komórka. Biol . 22 (12): 4001–10. doi : 10.1128/MCB.22.12.4001-4010.2002 . PMC 133842 . PMID 12024014 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA ludzkich i mysich” . Proc. Natl. Acad. Nauka. USA . 99 (26): 16899–903. Kod Bib : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Raffetseder U, Frye B, Rauen T i in. (2003). „Interakcja czynnika splicingowego SRp30c z białkiem Y-box-1 powoduje przemieszczanie się jądrowego YB-1 i wybór alternatywnego miejsca splicingu” . J. Biol. Chem . 278 (20): 18241–8. doi : 10.1074/jbc.M212518200 . PMID 12604611 .
•   Xu Q; Leung DY; Kisich KO (2003). „Biało p30 bogate w serynę i argininę kieruje alternatywnym splicingiem pre-mRNA receptora glukokortykoidowego do beta receptora glukokortykoidowego w neutrofilach” . J. Biol. Chem . 278 (29): 27112–8. doi : 10.1074/jbc.M300824200 . PMID 12738786 .
•    Li J, Hawkins IC, Harvey CD i in. (2003). „Regulacja alternatywnego splicingu przez SRrp86 i oddziałujące z nim białka” . Mol. Komórka. Biol . 23 (21): 7437–47. doi : 10.1128/MCB.23.21.7437-7447.2003 . PMC 207616 . PMID 14559993 .
•    Kondo S, Yamamoto N, Murakami T i in. (2004). „Tra2 beta, SF2/ASF i SRp30c modulują funkcję egzonowego wzmacniacza splicingu w eksonie 10 pre-mRNA tau” . Komórki Genów . 9 (2): 121–30. doi : 10.1111/j.1356-9597.2004.00709.x . PMID 15009090 . S2CID 22248867 .
•    Beausoleil SA, Jędrychowski M, Schwartz D i in. (2004). „Charakterystyka na dużą skalę fosfoprotein jądrowych komórek HeLa” . Proc. Natl. Acad. Nauka. USA . 101 (33): 12130–5. Kod Bib : 2004PNAS..10112130B . doi : 10.1073/pnas.0404720101 . PMC 514446 . PMID 15302935 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i rozwój projektu cDNA pełnej długości NIH: kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•   Wang Y, Wang J, Gao L i in. (2005). „Eksony 2 i 10 Tau, które są błędnie regulowane w chorobach neurodegeneracyjnych, są częściowo regulowane przez tłumiki, które wiążą kompleks SRp30c.SRp55, który rekrutuje lub antagonizuje htra2beta1” . J. Biol. Chem . 280 (14): 14230–9. doi : 10.1074/jbc.M413846200 . PMID 15695522 .
•   Scherer SE, Muzny DM, Buhay CJ i in. (2006). „Gotowa sekwencja DNA ludzkiego chromosomu 12” . Natura . 440 (7082): 346–51. Bibcode : 2006Natur.440..346S . doi : 10.1038/natura04569 . PMID 16541075 .