SND1

SND1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory , TDRD11, p100, nukleaza gronkowcowa i domena Tudor zawierająca 1,
identyfikatory zewnętrzne
	Tudor-SN
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko 1 zawierające domenę nukleazy gronkowcowej, znane również jako koaktywator 100 kDa lub białko 11 zawierające domenę Tudora (TDRD11) jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SND1 . SND1 jest głównym składnikiem kompleksu RISC i odgrywa ważną rolę w funkcjonowaniu miRNA . SND1 jest białkiem zawierającym domenę Tudora , a białka Tudora są wysoce konserwatywnymi białkami, które występują nawet w Drosophila melanogaster. SND1 jest również zaangażowany w autyzm.

Znaczenie kliniczne

SND1 działa jako onkogen w wielu nowotworach iw progresji raka wątrobowokomórkowego . SND1 promuje angiogenezę guza w ludzkim raku wątrobowokomórkowym poprzez nowy szlak, który obejmuje NF-kappaB i miR-221 . SND1 promuje migrację i inwazję poprzez receptor angiotensyny II typu 1 i sygnalizację TGFβ. Ekspresja SND1 jest regulowana przez Mir-184 w glejakach .

Interakcje

Wykazano, że SND1 oddziałuje z MYB ,

• PIM1 , POLR2A , RBPJ i STAT6 .

SND1 oddziałuje również z G3BP (białkiem ziarnistości stresu) i AEG-1 .

Dalsza lektura

•   Dash AB, Orrico FC, Ness SA (sierpień 1996). „Motyw EVES pośredniczy zarówno w regulacji międzycząsteczkowej, jak i wewnątrzcząsteczkowej c-Myb” . Geny i rozwój . 10 (15): 1858–69. doi : 10.1101/gad.10.15.1858 . PMID 8756344 .
•   Leverson JD, Koskinen PJ, Orrico FC, Rainio EM, Jalkanen KJ, Dash AB, Eisenman RN, Ness SA (październik 1998). „Kinaza Pim-1 i p100 współpracują w celu zwiększenia aktywności c-Myb” . Komórka molekularna . 2 (4): 417–25. doi : 10.1016/S1097-2765(00)80141-0 . PMID 9809063 .
•    Liénard P, Rivière M, Van Vooren P, Szpirer C, Szpirer J (2001). „Przypisanie SND1, genu kodującego koaktywator p100, do ludzkiego chromosomu 7q31.3 i szczurzego chromosomu 4q23 przez hybrydyzację in situ” . Cytogenetyka i genetyka komórki . 90 (3–4): 253–4. doi : 10.1159/000056783 . PMID 11124528 . S2CID 46217878 .
•   Rushton JJ, Ness SA (2001). „Konserwowana domena wiążąca DNA pośredniczy w podobnych interakcjach regulacyjnych dla czynników transkrypcyjnych A-Myb, B-Myb i c-Myb”. Komórki krwi, cząsteczki i choroby . 27 (2): 459–63. doi : 10.1006/bcmd.2001.0405 . PMID 11259168 .
•   Broadhurst MK, Wheeler TT (listopad 2001). „Koaktywator p100 jest obecny w jądrach komórek nabłonka sutka, a jego obfitość wzrasta w odpowiedzi na prolaktynę w hodowli iw tkance sutka podczas laktacji” . Dziennik Endokrynologii . 171 (2): 329–37. doi : 10.1677/joe.0.1710329 . PMID 11691653 .
•    Yang J, Aittomäki S, Pesu M, Carter K, Saarinen J, Kalkkinen N, Kieff E, Silvennoinen O (wrzesień 2002). „Identyfikacja p100 jako koaktywatora STAT6, który łączy STAT6 z polimerazą RNA II” . Dziennik EMBO . 21 (18): 4950–8. doi : 10.1093/emboj/cdf463 . PMC 126276 . PMID 12234934 .
•   Tijms MA, Snijder EJ (wrzesień 2003). „Niestrukturalne białko 1 wirusa zapalenia tętnic koni, istotny czynnik wirusowej syntezy subgenomowego mRNA, oddziałuje z komórkowym kofaktorem transkrypcji p100” . The Journal of General Virology . 84 (cz. 9): 2317–22. doi : 10.1099/vir.0.19297-0 . PMID 12917451 .
•    Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (styczeń 2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Biotechnologia przyrody . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
•   Broadhurst MK, Lee RS, Hawkins S, Wheeler TT (styczeń 2005). „Koaktywator p100 EBNA-2: wysoce konserwatywne białko występujące w wielu komórkach i tkankach zewnątrzwydzielniczych i wewnątrzwydzielniczych bydła”. Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Struktura i ekspresja genów . 1681 (2–3): 126–33. doi : 10.1016/j.bbaexp.2004.10.009 . PMID 15627504 .
•   Välineva T, Yang J, Palovuori R, Silvennoinen O (kwiecień 2005). „Białko koaktywatora transkrypcji p100 rekrutuje aktywność acetylotransferazy histonowej do STAT6 i pośredniczy w interakcji między białkiem wiążącym CREB i STAT6” . Journal of Biological Chemistry . 280 (15): 14989–96. doi : 10.1074/jbc.M410465200 . PMID 15695802 .
•   Chi A, Valencia JC, Hu ZZ, Watabe H, Yamaguchi H, Mangini NJ, Huang H, Canfield VA, Cheng KC, Yang F, Abe R, Yamagishi S, Shabanowitz J, Hearing VJ, Wu C, Appella E, Hunt DF (listopad 2006). „Proteomiczna i bioinformatyczna charakterystyka biogenezy i funkcji melanosomów”. Dziennik badań proteomu . 5 (11): 3135–44. doi : 10.1021/pr060363j . PMID 17081065 .
•    Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (listopad 2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 . S2CID 7827573 .