SNX9

SNX9
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, SDP1, SH3PX1, SH3PXD3A, WISP, sortowanie nexin 9
identyfikatorów zewnętrznych
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Sortująca neksyna-9 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SNX9 .

Ten gen koduje członka sortującej rodziny neksyny. Członkowie tej rodziny zawierają domenę phox (PX), która jest domeną wiążącą fosfoinozytyd i są zaangażowani w handel wewnątrzkomórkowy. To białko nie zawiera zwiniętego regionu cewki, jak niektórzy członkowie rodziny, ale zawiera domenę SH3 w pobliżu jej N-końca . Białko to oddziałuje z domenami cytoplazmatycznymi prekursora, ale nie z przetworzonymi formami domeny dezintegrynowej i metaloproteazowej 9 i 15. Białko to wiąże domenę przydatków beta białka adaptorowego 2 i może działać wspomagając białko adaptorowe 2 w jego roli w błona plazmatyczna. Białko to oddziałuje z aktywowaną kinazą-2 związaną z Cdc42, regulując degradację białka receptora naskórkowego czynnika wzrostu.

Interakcje

Wykazano, że SNX9 oddziałuje z ADAM9 , DNM2 i ADAM15 .

Dalsza lektura

•    Teasdale RD, Loci D, Houghton F i in. (2001). „Duża rodzina białek zlokalizowanych w endosomach związanych z sortowaniem neksyny 1” . Biochem. J. _ 358 (część 1): 7–16. doi : 10.1042/0264-6021:3580007 . PMC 1222026 . PMID 11485546 .
•   Lin Q; Lo CG; Cerione RA; Yang W. (2002). „Cel Cdc42 ACK2 oddziałuje z sortowaniem neksyny 9 (SH3PX1) w celu regulacji degradacji receptora naskórkowego czynnika wzrostu” . J. Biol. chemia . 277 (12): 10134–8. doi : 10.1074/jbc.M110329200 . PMID 11799118 .
•    Lundmark R; Carlsson SR (2002). „Wydatki beta czterech kompleksów adaptor-białko (AP): struktura i właściwości wiązania oraz identyfikacja sortującej neksyny 9 jako białka pomocniczego do AP-2” . Biochem. J. _ 362 (część 3): 597–607. doi : 10.1042/0264-6021:3620597 . PMC 1222423 . PMID 11879186 .
•    Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH i in. (2003). „Generowanie i wstępna analiza ponad 15 000 pełnej długości sekwencji cDNA człowieka i myszy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 99 (26): 16899–903. Bibcode : 2002PNAS...9916899M . doi : 10.1073/pnas.242603899 . PMC 139241 . PMID 12477932 .
•   Lundmark R; Carlsson SR (2004). „Sortowanie neksyny 9 uczestniczy w endocytozie za pośrednictwem klatryny poprzez interakcje z głównymi składnikami” . J. Biol. chemia . 278 (47): 46772–81. doi : 10.1074/jbc.M307334200 . PMID 12952949 .
•   Mungall AJ, Palmer SA, Sims SK i in. (2003). „Sekwencja DNA i analiza ludzkiego chromosomu 6” . Natura . 425 (6960): 805–11. Bibcode : 2003Natur.425..805M . doi : 10.1038/natura02055 . PMID 14574404 .
•   Schulze WX; Mann M. (2004). „Nowy ekran proteomiczny interakcji peptyd-białko” . J. Biol. chemia . 279 (11): 10756-64. doi : 10.1074/jbc.M309909200 . PMID 14679214 .
•   Ota T, Suzuki Y, Nishikawa T i in. (2004). „Kompletne sekwencjonowanie i charakterystyka 21 243 pełnej długości ludzkich cDNA” . Nat. Genet . 36 (1): 40–5. doi : 10.1038/ng1285 . PMID 14702039 .
•    Lehnera B; Sanderson CM (2004). „Struktura interakcji białek do degradacji ludzkiego mRNA” . Genom Res . 14 (7): 1315–23. doi : 10.1101/gr.2122004 . PMC 442147 . PMID 15231747 .
•   Lundmark R; Carlsson SR (2004). „Regulowana rekrutacja błonowa dynaminy-2, w której pośredniczy sortowanie neksyny 9” . J. Biol. chemia . 279 (41): 42694–702. doi : 10.1074/jbc.M407430200 . PMID 15299020 .
•    Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA i in. (2004). „Stan, jakość i ekspansja projektu cDNA pełnej długości NIH: Kolekcja genów ssaków (MGC)” . Genom Res . 14 (10B): 2121–7. doi : 10.1101/gr.2596504 . PMC 528928 . PMID 15489334 .
•    Soulet F; Jarar D; Leonard M.; Schmid SL (2005). „SNX9 reguluje montaż dynaminy i jest wymagany do wydajnej endocytozy za pośrednictwem klatryny” . Mol. Biol. komórka . 16 (4): 2058–67. doi : 10.1091/mbc.E04-11-1016 . PMC 1073683 . PMID 15703209 .
•    Yeow-Fong L; Lim L; Manser E. (2005). „SNX9 jako adapter do łączenia synaptojanin-1 z efektorem Cdc42 ACK1” . FEBS Lett . 579 (22): 5040–8. doi : 10.1016/j.febslet.2005.07.093 . PMID 16137687 . S2CID 44482842 .
•    Rual JF, Venkatesan K, Hao T i in. (2005). „W kierunku mapy w skali proteomu sieci interakcji białko-białko człowieka”. Natura . 437 (7062): 1173-8. Bibcode : 2005Natur.437.1173R . doi : 10.1038/natura04209 . PMID 16189514 . S2CID 4427026 .
•    Dziecięca C; Lin Q; Yang W (2006). „Dimeryzacja jest wymagana do fosforylacji tyrozyny SH3PX1 w odpowiedzi na sygnalizację naskórkowego czynnika wzrostu i interakcję z ACK2” . Biochem. J. _ 394 (cz. 3): 693–8. doi : 10.1042/BJ20050576 . PMC 1383719 . PMID 16316319 .
•    Marchès O, Batchelor M, Shaw RK i in. (2006). „EspF enteropatogennej Escherichia coli wiąże sortowanie neksyny 9” . J. Bacteriol . 188 (8): 3110–5. doi : 10.1128/JB.188.8.3110-3115.2006 . PMC 1447016 . PMID 16585770 .
•    Schmid EM, Ford MG, Burtey A i in. (2007). „Rola koncentratora przydatków beta AP2 w rekrutacji partnerów do montażu pęcherzyków pokrytych klatryną” . PLOS Biol . 4 (9): e262. doi : 10.1371/journal.pbio.0040262 . PMC 1540706 . PMID 16903783 .
•    Badour K, McGavin MK, Zhang J i in. (2007). „Interakcja białka zespołu Wiskotta-Aldricha z sortowaniem neksyny 9 jest wymagana do endocytozy CD28 i cosignalingu w komórkach T” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 104 (5): 1593-8. Bibcode : 2007PNAS..104.1593B . doi : 10.1073/pnas.0610543104 . PMC 1785243 . PMID 17242350 .