SRA1

SRA1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, SRA, SRAP, STRAA1, pp7684, aktywator RNA receptora steroidowego 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Aktywator RNA receptora steroidowego 1, znany również jako białko aktywatora RNA receptora steroidowego (SRAP), jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SRA1 . mRNA transkrybowany z genu SRA1 jest składnikiem kompleksu rybonukleoproteinowego zawierającego NCOA1 . Ten funkcjonalny RNA koduje również białko.

Funkcjonować

Gen ten bierze udział w transkrypcyjnej koaktywacji przez receptor steroidowy . Obecnie istnieją dane sugerujące, że ten gen koduje zarówno niekodujący RNA, który działa jako część kompleksu rybonukleoproteinowego, jak i mRNA kodujący białko. Zwiększona ekspresja zarówno transkryptu, jak i białka jest związana z rakiem.

Interakcje

Wykazano, że SRA1 wchodzi w interakcje z:

• receptor estrogenowy alfa ,
• DDX17 ,
• Koaktywator receptora jądrowego 2 i
• SPEN .

Wykazano, że SRAP oddziałuje ze swoim odpowiednikiem SRA RNA pośrednio z funkcjonalną podstrukturą STR7 RNA SRA. Pierwotnie zaproponowano, aby zawierał RRM, wykazano, że SRAP ma wiązkę helisy na swoim C-końcu, podczas gdy N-końc w tej domenie wydaje się nieustrukturyzowany.

Dalsza lektura

•    Ulveling D, Francastel C, Hubé F (kwiecień 2011). „Kiedy jeden jest lepszy niż dwa: RNA o podwójnych funkcjach” (PDF) . Biochimie . 93 (4): 633–44. doi : 10.1016/j.biochi.2010.11.004 . PMID 21111023 . S2CID 22165949 .
•    Hubé F, Velasco G, Rollin J, Furling D, Francastel C (styczeń 2011). „Białko aktywatora RNA receptora steroidowego wiąże się i przeciwdziała aktywacji MyoD i różnicowaniu mięśni za pośrednictwem SRA RNA” . Badania kwasów nukleinowych . 39 (2): 513–25. doi : 10.1093/nar/gkq833 . PMC 3025577 . Identyfikator PMID 20855289 .
•    Cooper C, Guo J, Yan Y, Chooniedass-Kothari S, Hube F, Hamedani MK, Murphy LC, Myal Y, Leygue E (lipiec 2009). „Zwiększenie względnej ekspresji endogennego niekodującego aktywatora RNA receptora steroidowego (SRA) w ludzkich komórkach raka piersi przy użyciu zmodyfikowanych oligonukleotydów” . Badania kwasów nukleinowych . 37 (13): 4518–31. doi : 10.1093/nar/gkp441 . PMC 2715257 . PMID 19483093 .
•   Hube F, Guo J, Chooniedass-Kothari S, Cooper C, Hamedani MK, Dibrov AA, Blanchard AA, Wang X, Deng G, Myal Y, Leygue E (lipiec 2006). „Alternatywny splicing pierwszego intronu aktywatora RNA receptora steroidowego (SRA) uczestniczy w wytwarzaniu izoform kodujących i niekodujących RNA w liniach komórkowych raka piersi”. Biologia DNA i komórki . 25 (7): 418–28. doi : 10.1089/dna.2006.25.418 . hdl : 1807.1/831 . PMID 16848684 .
•   Leygue E, Dotzlaw H, Watson PH, Murphy LC (wrzesień 1999). „Ekspresja aktywatora RNA receptora steroidowego w ludzkich guzach piersi”. Badania nad rakiem . 59 (17): 4190–3. PMID 10485452 .
•   Murphy LC, Simon SL, Parkes A, Leygue E, Dotzlaw H, Snell L, Troup S, Adeyinka A, Watson PH (listopad 2000). „Zmieniona ekspresja koregulatorów receptora estrogenowego podczas powstawania nowotworów piersi u ludzi”. Badania nad rakiem . 60 (22): 6266–71. PMID 11103781 .
•   Cavarretta IT, Mukopadhyay R, Lonard DM, Cowsert LM, Bennett CF, O'Malley BW, Smith CL (luty 2002). „Redukcja ekspresji koaktywatora przez antysensowne oligodeoksynukleotydy hamuje aktywność transkrypcyjną ERalfa i proliferację MCF-7” . Endokrynologia Molekularna . 16 (2): 253–70. doi : 10.1210/mend.16.2.0770 . PMID 11818499 .
•   Kucera T, Waltner-Law M, Scott DK, Prasad R, Granner DK (lipiec 2002). „Mutacja punktowa domeny transaktywacji AF2 receptora glukokortykoidowego zakłóca jego interakcję z koaktywatorem receptora steroidowego 1” . Journal of Biological Chemistry . 277 (29): 26098–102. doi : 10.1074/jbc.M204013200 . PMID 12118039 .
•   Ueda T, Mawji NR, Bruchovsky N, Sadar MD (październik 2002). „Niezależna od liganda aktywacja receptora androgenowego przez interleukinę-6 i rola koaktywatora receptora steroidowego-1 w komórkach raka prostaty” . Journal of Biological Chemistry . 277 (41): 38087–94. doi : 10.1074/jbc.M203313200 . PMID 12163482 .
•    Lanz RB, Razani B, Goldberg AD, O'Malley BW (grudzień 2002). „Wyraźne motywy RNA są ważne dla koaktywacji receptorów hormonów steroidowych przez aktywator RNA receptora steroidowego (SRA)” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 99 (25): 16081-6. Bibcode : 2002PNAS...9916081L . doi : 10.1073/pnas.192571399 . PMC 138568 . PMID 12444263 .
•   Emberley E, Huang GJ, Hamedani MK, Czosnek A, Ali D, Grolla A, Lu B, Watson PH, Murphy LC, Leygue E (luty 2003). „Identyfikacja nowych izoform aktywatora RNA ludzkiego kodującego receptora steroidowego”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 301 (2): 509–15. doi : 10.1016/S0006-291X(02)03070-X . PMID 12565891 .
•   Watkins RE, Davis-Searles PR, Lambert MH, Redinbo MR (sierpień 2003). „Wiązanie koaktywatora promuje specyficzną interakcję między ligandem a receptorem pregnanu X”. Dziennik biologii molekularnej . 331 (4): 815–28. doi : 10.1016/S0022-2836(03)00795-2 . PMID 12909012 .
•    Deblois G, Giguère V (czerwiec 2003). „Niezależna od liganda koaktywacja ERalpha AF-1 przez aktywator RNA receptora steroidowego (SRA) poprzez aktywację MAPK”. The Journal of Steroid Biochemistry and Molecular Biology . 85 (2–5): 123–31. doi : 10.1016/S0960-0760(03)00225-5 . PMID 12943696 . S2CID 34194523 .
•    Lanz RB, Chua SS, Barron N, Söder BM, DeMayo F, O'Malley BW (październik 2003). „Aktywator RNA receptora steroidowego stymuluje proliferację oraz apoptozę in vivo” . Biologia molekularna i komórkowa . 23 (20): 7163–76. doi : 10.1128/MCB.23.20.7163-7176.2003 . PMC 230309 . PMID 14517287 .
•   Fleming FJ, Hill AD, McDermott EW, O'Higgins NJ, Young LS (styczeń 2004). „Różnicowa rekrutacja białek koregulatorowych, koaktywatora-1 receptora steroidowego i mediatora wyciszającego receptory retinoidowe i tarczycowe do elementu odpowiedzi receptor estrogenowo-estrogenowy przez beta-estradiol i 4-hydroksytamoksyfen w raku piersi u ludzi” . The Journal of Clinical Endokrynologii i Metabolizmu . 89 (1): 375–83. doi : 10.1210/jc.2003-031048 . PMID 14715875 .
•   Xu B, Koenig RJ (sierpień 2004). „Domena wiążąca RNA w receptorze hormonu tarczycy zwiększa aktywację transkrypcji” . Journal of Biological Chemistry . 279 (32): 33051–6. doi : 10.1074/jbc.M404930200 . PMID 15180993 .
•   Zhao X, Patton JR, Davis SL, Florence B, Ames SJ, Spanjaard RA (sierpień 2004). „Regulacja aktywności receptora jądrowego przez syntazę pseudourydyny poprzez potranskrypcyjną modyfikację aktywatora RNA receptora steroidowego” . Komórka molekularna . 15 (4): 549–58. doi : 10.1016/j.molcel.2004.06.044 . PMID 15327771 .
•   Coleman KM, Lam V, Jaber BM, Lanz RB, Smith CL (październik 2004). „Koaktywacja SRA receptora estrogenowego alfa jest niezależna od fosforylacji i zwiększa aktywność agonisty 4-hydroksytamoksyfenu”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 323 (1): 332–8. doi : 10.1016/j.bbrc.2004.08.090 . PMID 15351741 .

Linki zewnętrzne

• SRA1 w przeglądarce genomu UCSC .
• SRA1 w przeglądarce genomu UCSC .
• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q9HD15 (aktywator RNA ludzkiego receptora steroidowego 1) w PDBe-KB .
• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : Q80VJ2 (aktywator RNA mysiego receptora steroidowego 1) w PDBe-KB .