Powielony polimorfizm związany z sekwencją

Polimorfizm amplifikowany związany z sekwencją ( SRAP ) to technika molekularna opracowana przez G. Li i CF Quiros w 2001 r. do wykrywania zmienności genetycznej w otwartych ramkach odczytu (ORF) genomów roślin i organizmów pokrewnych .

Zobacz też

• Inkluzywne mapowanie interwałów złożonych
• Mikrosatelita (genetyka)
• Molekularna identyfikacja obliczeniowa
• Marker molekularny
• RAPD
• Narzędzie do profilowania sekwencji

Źródła

•   Kole, Chittaranjan (2007). „Markery molekularne i mapowanie genetyczne”. Nasiona oleiste . Tom. 2 Mapowania genomu i hodowli molekularnej roślin . Skoczek. P. 88. ISBN 978-3540343875 .
•   Li, G.; Quiros, CF (2001). „Amplifikowany polimorfizm związany z sekwencją (SRAP) nowy system markerów oparty na prostej reakcji PCR: jego zastosowanie do mapowania i znakowania genów u kapustnych”. Genetyka teoretyczna i stosowana . 103 (2–3): 455–461. doi : 10.1007/s001220100570 . S2CID 3362269 .

Dalsza lektura

Książki

• Kidwell, KK; Osborn, TC (1992). „Proste procedury izolacji DNA roślin”. W Beckman, JS; Osborn, TC (red.). Genomy roślin: metody mapowania genetycznego i fizycznego . Amsterdam, Holandia: Kluwer Academic Publishers . s. 1–13.
• Tegelstrom, H. (1992). „Wykrywanie fragmentów mitochondrialnego DNA”. W Hoelzel, AR (red.). Genetyczna analiza molekularna populacji: podejście praktyczne . Oksford: IRL Press. s. 89–114.

Artykuły i czasopisma

•    Broude, Natalia E.; Chandra, Abha; Smith, Cassandra L. (1997). „Różnicowe wyświetlanie podzbiorów genomu zawierających określone przeplatane powtórzenia” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (9): 4548–4553. Bibcode : 1997PNAS...94.4548B . doi : 10.1073/pnas.94.9.4548 . PMC20760 . _ PMID 9114027 .
• Brązowy, Allan F.; Jeffery, Elżbieta H.; Juvik, John (2007). „Mapa powiązań brokułów oparta na reakcji łańcuchowej polimerazy i identyfikacja ilościowych loci cech związanych z datą zbioru i masą głowy” (PDF) . Dziennik Amerykańskiego Towarzystwa Nauk Ogrodniczych . 4 (132): 507–513. doi : 10.21273/JASHS.132.4.507 .
•    Dicks, J.; Anderson, M.; Cardle, L.; Cartinhour, S.; Couchman, M.; Davenport, G.; Dickson, J.; Gale, M.; Marshall, D.; Maj, S.; Mcwilliam, H.; O'Malia, A.; Ougham, H.; Sztuczka, M.; Walsh, S.; Waugh, R. (2000). „UK CropNet: zbiór baz danych i zasobów bioinformatycznych dla genomiki roślin uprawnych” . Badania kwasów nukleinowych . 28 (1): 104–107. doi : 10.1093/nar/28.1.104 . PMC 102397 . PMID 10592194 .
• Doyle, JJ; Doyle, JL (1987). „Procedura szybkiej izolacji DNA dla małych ilości świeżej tkanki liści”. Biuletyn fitochemiczny . 19 : 11–15.
• Kosambi, D. (1944). „Oszacowanie odległości mapy od wartości rekombinacji” . Roczniki eugeniki . 12 : 172–175. doi : 10.1111/j.1469-1809.1943.tb02321.x .
•   Lander, Hiszpania; Zielony, P .; Abrahamson, J.; Barlow, A.; Daly, MJ; Lincoln, SE; Newburg, L. (październik 1987). „MAPMAKER: interaktywny pakiet komputerowy do konstruowania pierwotnych map powiązań genetycznych populacji eksperymentalnych i naturalnych” . Genomika . 1 (2): 174–181. doi : 10.1016/0888-7543(87)90010-3 . PMID 3692487 .
•    Li, Huihui; Ribaut, Jean-Marcel; Li, Zhonglai; Wang, Jiankang (2008). „Inclusive Composite Interval Mapping (ICIM) dla digenicznej epistazy cech ilościowych w populacjach dwurodzicielskich”. Genetyka teoretyczna i stosowana . 116 (2): 243–260. doi : 10.1007/s00122-007-0663-5 . PMID 17985112 . S2CID 21798268 .
•    Quiros, CF; Grellet, F.; Sadowski, J.; Suzuki, T.; Li, G.; Wróblewski, T. (2001). „Porównawcza sekwencja, struktura i zawartość genów Arabidopsis i Brassica w segmencie chromosomu ABI1-Rps2-Ckl i regionach pokrewnych” . Genetyka . 157 (3): 1321–1330. doi : 10.1093/genetyka/157.3.1321 . PMC 1461565 . PMID 11238417 .
• Saha, Gopesh; Sarkerb, Ashutosh; Chena, Weidong; Vandemarka, George J.; Muehlbauera, Fred J. (2010). „Położenie mapy dziedziczenia i powiązań genów nadających odporność na zarazę łodygową w soczewicy” . Nauka o uprawach . Crop Science Society of America. 50 (5): 1831–1839. doi : 10.2135/cropsci2009.12.0709 .
• Shapiro, SS; Wilk, MB (1965). „Analiza testu wariancji dla normalności (pełne próbki)” . Biometria . 52 (3–4): 591–611. doi : 10.1093/biomet/52.3-4.591 .
•   Sharma, R.; Mahla, RH; Mohapatra, T.; Bhargava, CS; Szama, MM (2003). „Izolowanie genomowego DNA roślin bez ciekłego azotu”. Biologia molekularna roślin . 21 : 43–50. doi : 10.1007/bf02773395 . S2CID 2893909 .
•   Shen, JunLing; Ni, HuiQun; Chen, XiaoYang; Huang, ShaoWei (2010). „Różnorodność genetyczna Jatropha Curcas z markerami molekularnymi SRAP” . Dziennik Zhejiang Forestry College . 27 (3): 347–353. ISSN 1000-5692 .
•   Sorkheh, K.; Shiran, B.; Kiani, S.; Amirbakhtiar, N.; Mousavi, S.; Rouhi, Vahid; Mohammady-d, Shahram; Gradziel, Tomasz M.; Malysheva-Otto, Ludmiła V.; Martínez-Gómez, Pedro (2009). „Zdolność rozróżniania markerów molekularnych i charakterystyka morfologiczna w ustalaniu powiązań genetycznych w uprawach genotypów migdałów i spoin pokrewnych”. Dziennik badań leśnych . 20 (3): 183–194. doi : 10.1007/s11676-009-0036-9 . S2CID 22190347 .
•    Williams, JGK; Kubelik, AR; Livak, KJ; Rafalski, JA; Tingey, SV (1990). „Polimorfizmy DNA amplifikowane przez arbitralne startery są przydatne jako markery genetyczne” . Badania kwasów nukleinowych . 18 (22): 6531–6535. doi : 10.1093/nar/18.22.6531 . PMC 332606 . PMID 1979162 .