Syndekan-4

SDC4
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, SYND4, syndekan 4
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Syndekan-4 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SDC4 . Syndekan-4 jest jednym z czterech syndekanów kręgowców i ma masę cząsteczkową ~ 20 kDa. Syndekany są najlepiej scharakteryzowanymi proteoglikanami błony komórkowej. Ich wewnątrzkomórkowa domena białka rdzeniowego obejmującego błonę oddziałuje z cytoszkieletem aktynowym i cząsteczkami sygnałowymi w korze komórkowej. Syndekany zwykle znajdują się na powierzchni komórkowej fibroblastów i komórek nabłonkowych. Syndekany oddziałują z fibronektyną na powierzchni komórki, białkami cytoszkieletu i sygnałowymi wewnątrz komórki, modulując funkcję integryny w adhezji komórki do macierzy. Ponadto syndekany wiążą się z FGF i przenoszą je do receptora FGF na tej samej komórce. Jako koreceptor lub regulator, zmutowane niektóre proteoglikany mogą powodować poważne wady rozwojowe, takie jak nieuporządkowana dystrybucja lub inaktywacja cząsteczek sygnałowych.

Syndekany mają podobne cechy konstrukcyjne:

• Dołącz do łańcuchów siarczanu heparanu - czynniki oddziałujące (np. cząsteczki Matrix, czynniki wzrostu i enzymy)
• Łańcuch siarczanu chondroityny
• Domena transbłonowa – samoasocjacja
• Domena C1 - cytoszkielet związany z aktyną
• Domena zmienna – specyficzna dla syndekanu
• Domena C2 – przyłącza się do białek PDZ

Syndekany zwykle tworzą homodimery lub multimery. Ich funkcja biologiczna obejmuje regulację wzrostu, różnicowanie i adhezję komórek. Syndekan-4 ma szerszą dystrybucję niż inne syndekany i jest to jedyny syndekan, który został konsekwentnie znaleziony w zrostach ogniskowych.

Gen

Syndekan-4 jest również nazywany ryudokanem lub amfiglikanem. Znajduje się na chromosomie 20, podczas gdy pseudogen został znaleziony na chromosomie 22. Syndekan-4 jest jednym z czterech syndekanów kręgowców i ma masę cząsteczkową ~ 20 kDa. Ma bardziej rozpowszechnioną dystrybucję niż inne syndekany i jest jedynym syndekanem, który został konsekwentnie znaleziony w zrostach ogniskowych.

Funkcjonować

Syndekan-4 jest transbłonowym (typu I) proteoglikanem siarczanu heparanu , który działa jako receptor w sygnalizacji wewnątrzkomórkowej. Białko występuje jako homodimer i należy do proteoglikanów syndekanu . Syndekan-4 wchodzi w interakcje z macierzą pozakomórkową, antykoagulantami i czynnikami wzrostu. Reguluje również cytoszkielet aktynowy, adhezję komórek i migrację komórek.

Syndekan-4 aktywuje kinazę białkową C (PKC), enzym biorący udział w transdukcji sygnału. Domena zmienna syndekanu-4 może być miejscem samoasocjacji. Stopień oligomeryzacji koreluje z aktywnością kinaz, więc stopień skupienia syndekanu-4 koreluje z aktywnością PKC. Syndekan-4 wiąże się również z (4,5)-bisfosforanem fosfatydyloinozytolu (PIP2) poprzez domenę zmienną i zwiększa aktywność PKC dziesięciokrotnie.

Syndekan-4 jest również regulatorem sygnalizacji czynnika wzrostu fibroblastów-2 (FGF-2). Syndekan-4 wiąże się z FGF i pośredniczy w interakcji z receptorem FGF. Ze względu na ścisłą korelację między syndekanem-4 a czynnikami wzrostu, uważa się, że skuteczność terapii angiogennych odnosi się do syndekanu-4. Sygnalizacja czynnika wzrostu może zostać zakłócona przez zmiany w ekspresji syndekanu-4. Wychwyt komórkowy, transport i lokalizacja jądrowa FGF-2 mogą być zwiększone przez wspólne dostarczanie proteoliposomów syndekanu-4. Zmiany te należy wziąć pod uwagę w terapiach opartych na FGF-2.

Syndekan-4 jest również związany z procesem gojenia. Brak genu Sdc4 powoduje opóźnione gojenie się ran u myszy. To opóźnienie może być spowodowane upośledzoną ruchliwością fibroblastów.

Znaczenie kliniczne

Endometrioza

Ekspresja syndekanu-4 jest zwiększona w endometrium kobiet cierpiących na endometriozę , a jej obniżenie w komórkach endometriotycznych skutkuje zmniejszeniem inwazyjnego wzrostu i zmniejszoną ekspresją małej GTPazy Rac1 , aktywującego czynnika transkrypcyjnego 2 (ATF2) i MMP3 .

Zapalenie kości i stawów

Syndekan-4 jest regulowany w górę w chorobie zwyrodnieniowej stawów , a hamowanie syndekanu-4 zmniejsza niszczenie chrząstki w mysich modelach OA.

Zobacz Sindecán-4 w hiszpańskiej Wikipedii

Dalsza lektura

•    Bass MD, Humphries MJ (2002). „Cytoplazmatyczne interakcje receptora adhezyjnego orkiestracji syndekanu-4 i sygnalizacji receptora czynnika wzrostu” . Biochem. J. _ 368 (cz. 1): 1–15. doi : 10.1042/BJ20021228 . PMC 1222989 . PMID 12241528 .
•   Yu H, Humphries DE, Watkins M, Karlinsky JB (1995). „Klonowanie molekularne ludzkiego promotora ryudokan”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 212 (3): 1139–44. doi : 10.1006/bbrc.1995.2087 . PMID 7626103 .
•    Barillari G, Gendelman R, Gallo RC, Ensoli B (1993). „Białko Tat ludzkiego wirusa niedoboru odporności typu 1, czynnik wzrostu mięsaka Kaposiego AIDS i komórek naczyniowych aktywowanych cytokinami, indukuje adhezję tych samych typów komórek za pomocą receptorów integryny rozpoznających sekwencję aminokwasową RGD” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 90 (17): 7941–5. Bibcode : 1993PNAS...90.7941B . doi : 10.1073/pnas.90.17.7941 . PMC47263 . _ PMID 7690138 .
•    Woods A, Couchman JR (1994). „Syndecan 4 proteoglikan siarczanu heparanu jest selektywnie wzbogaconym i szeroko rozpowszechnionym składnikiem adhezji ogniskowej” . Mol. Biol. komórka . 5 (2): 183–92. doi : 10.1091/mbc.5.2.183 . PMC 301024 . PMID 8019004 .
•   Maruyama K, Sugano S (1994). „Oligo-capping: prosta metoda zastąpienia struktury czapeczki eukariotycznych mRNA oligorybonukleotydami”. gen . 138 (1–2): 171–4. doi : 10.1016/0378-1119(94)90802-8 . PMID 8125298 .
•   Albini A, Benelli R, Presta M, Rusnati M, Ziche M, Rubartelli A, Paglialunga G, Bussolino F, Noonan D (1996). „Białko HIV-tat jest wiążącym heparynę angiogennym czynnikiem wzrostu”. Onkogen . 12 (2): 289–97. PMID 8570206 .
•   Kojima T, Katsumi A, Yamazaki T, Muramatsu T, Nagasaka T, Ohsumi K, Saito H (1996). „Ludzki ryudokan z komórek podobnych do śródbłonka wiąże podstawowy czynnik wzrostu fibroblastów, midkinę i inhibitor szlaku czynnika tkankowego” . J. Biol. chemia . 271 (10): 5914–20. doi : 10.1074/jbc.271.10.5914 . PMID 8621465 .
•   Takagi A, Kojima T, Tsuzuki S, Katsumi A, Yamazaki T, Sugiura I, Hamaguchi M, Saito H (1997). „Organizacja strukturalna i aktywność promotora ludzkiego genu ryudokan”. J. Biochem . 119 (5): 979–84. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a021338 . PMID 8797100 .
•   Rusnati M, Coltrini D, Oreste P, Zoppetti G, Albini A, Noonan D, d'Adda di Fagagna F, Giacca M, Presta M (1997). „Interakcja białka Tat HIV-1 z heparyną. Rola struktury szkieletu, zasiarczenia i wielkości” . J. Biol. chemia . 272 (17): 11313-20. doi : 10.1074/jbc.272.17.11313 . PMID 9111037 .
•    Chang HC, Samaniego F, Nair BC, Buonaguro L, Ensoli B (1997). „Białko HIV-1 Tat wychodzi z komórek drogą wydzielniczą bez lidera i wiąże się z proteoglikanami siarczanu heparanu związanymi z macierzą zewnątrzkomórkową poprzez swój region podstawowy” . AIDS . 11 (12): 1421–31. doi : 10.1097/00002030-199712000-00006 . PMID 9342064 . S2CID 7648619 .
•   Suzuki Y, Yoshitomo-Nakagawa K, Maruyama K, Suyama A, Sugano S (1997). „Konstrukcja i charakterystyka biblioteki cDNA wzbogaconej o pełnej długości i wzbogaconej o koniec 5'”. gen . 200 (1–2): 149–56. doi : 10.1016/S0378-1119(97)00411-3 . PMID 9373149 .
•   Horowitz A, Simons M (1998). „Regulacja fosforylacji syndekanu-4 in vivo” . J. Biol. chemia . 273 (18): 10914-8. doi : 10.1074/jbc.273.18.10914 . PMID 9556568 .
•   Lee D, Oh ES, Woods A, Couchman JR, Lee W (1998). „Struktura roztworu domeny cytoplazmatycznej syndekanu-4 i jego oddziaływanie z 4,5-bisfosforanem fosfatydyloinozytolu” . J. Biol. chemia . 273 (21): 13022-9. doi : 10.1074/jbc.273.21.13022 . PMID 9582338 .
•    Cohen AR, Woods DF, Marfatia SM, Walther Z, Chishti AH, Anderson JM (1998). „Ludzka CASK / LIN-2 wiąże Syndekan-2 i białko 4.1 i lokalizuje się w błonie podstawno-bocznej komórek nabłonka” . J. Cell Biol . 142 (1): 129–38. doi : 10.1083/jcb.142.1.129 . PMC 2133028 . PMID 9660868 .
•   Rusnati M, Tulipano G, Spillmann D, Tanghetti E, Oreste P, Zoppetti G, Giacca M, Presta M (1999). „Wielokrotne interakcje białka Tat HIV-I z oligosacharydami heparyny o określonej wielkości” . J. Biol. chemia . 274 (40): 28198–205. doi : 10.1074/jbc.274.40.28198 . PMID 10497173 .
•    Gao Y, Li M, Chen W, Simons M (2000). „Synektyna, białko PDZ wiążące domenę cytoplazmatyczną syndekanu-4, hamuje migrację komórek”. J. Komórka. Fizyol . 184 (3): 373–9. doi : 10.1002/1097-4652(200009)184:3<373::AID-JCP12>3.0.CO;2-I . PMID 10911369 . S2CID 20829740 .
•   Tyagi M, Rusnati M, Presta M, Giacca M (2001). „Internalizacja HIV-1 tat wymaga proteoglikanów siarczanu heparanu na powierzchni komórki” . J. Biol. chemia . 276 (5): 3254–61. doi : 10.1074/jbc.M006701200 . PMID 11024024 .
•   Shin J, Lee W, Lee D, Koo BK, Han I, Lim Y, Woods A, Couchman JR, Oh ES (2001). „Struktura roztworu dimerycznej domeny cytoplazmatycznej syndekanu-4”. Biochemia . 40 (29): 8471–8. doi : 10.1021/bi002750r . PMID 11456484 .

Linki zewnętrzne

• Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P31431 (Syndecan-4) w PDBe-KB .