Takson w przebraniu
Hipotetyczny przykład | ||||||||||||||||||
|
||||||||||||||||||
B jest filogenetycznie częścią grupy A, ale nie taksonomicznie, więc A jest parafiletyczne. |
W bakteriologii takson w przebraniu to gatunek , rodzaj lub wyższa jednostka klasyfikacji biologicznej , której historia ewolucyjna ujawnia, że wyewoluowała z innej jednostki o podobnej lub niższej randze, czyniąc jednostkę rodzicielską parafiletyczną . Dzieje się tak, gdy szybka ewolucja sprawia, że nowy gatunek wydaje się tak radykalnie różny od grupy przodków, że nie jest (początkowo) rozpoznawany jako należący do macierzystej filogenetycznej , którą pozostawia się jako stopień ewolucyjny .
Chociaż termin ten pochodzi z bakteriologii, równoległe przykłady można znaleźć w całym drzewie życia . Na przykład czworonożne zwierzęta wyewoluowały z przodków ryb, ale ponieważ nie są ogólnie uważane za ryby , można o nich powiedzieć, że są „rybami w przebraniu”.
W wielu przypadkach parafilia może zostać rozwiązana poprzez przeklasyfikowanie danego taksonu do grupy macierzystej. Jednak w bakteriologii, ponieważ zmiana nazw grup może mieć poważne konsekwencje, ponieważ powodując zamieszanie co do tożsamości patogenów , na ogół unika się tego w przypadku niektórych grup.
Przykłady
Shigella
Rodzaj bakterii Shigella jest przyczyną czerwonki bakteryjnej , potencjalnie poważnej infekcji, która każdego roku zabija ponad milion ludzi. Rodzaj ( S. dysenteriae , S. flexneri , S. boydii , S. sonnei ) wyewoluował z pospolitej bakterii jelitowej Escherichia coli , co czyni ten gatunek parafiletycznym. Sama E. coli może również powodować poważną czerwonkę, ale różnice w składzie genetycznym między E. coli i Shigella powodować różne stany chorobowe i objawy.
Escherichia coli jest źle sklasyfikowanym gatunkiem, ponieważ niektóre szczepy mają tylko 20% wspólnego genomu. Jest tak różnorodny, że powinien otrzymać wyższy ranking taksonomiczny. Jednak warunki medyczne związane z E. coli i Shigella sprawiają, że obecna klasyfikacja nie powinna być zmieniana, aby uniknąć nieporozumień w kontekście medycznym. Shigella pozostanie zatem „ E. coli w przebraniu”.
B. cereus -grupa
Podobnie gatunki Bacillus z grupy B. cereus ( B. anthracis , B. cereus , B. thuringiensis , B. mycoides , B. pseudomycoides , B. weihenstephanensis i B. medusa ) mają w 99-100% podobną sekwencję 16S rRNA (97% to często podawana odpowiednia granica gatunków) i należy je traktować jako pojedynczy gatunek. Wydaje się, że niektórzy członkowie tej grupy wywodzą się z innych Bacillus poprzez nabycie plazmidu kodującego białko więc grupa może być polifiletyczna. Ze względów medycznych, takich jak wąglik , obecny układ odrębnych gatunków pozostał nienaruszony.
Duże rodzaje drobnoustrojów
- Rodzaj bakterii Pseudomonas powiększył się w ciągu kilku generacji metod taksonomicznych, doprowadzając liczbę gatunków do alarmujących proporcji, z około 800 gatunkami rozpoznanymi do połowy XX wieku. Bakterie wiążące azot z rodzaju Azotobacter i gatunek Azomonas macrocytogenes wyewoluowały z gatunku z rodzaju Pseudomonas . Jego zdolność wiązania azotu i odbiegające od normy cechy spowodowały, że Azotobacter został opisany jako „ Pseudomonas w przebraniu”.
- Rodzaj Bacillus został opisany na wczesnym etapie historii mikrobiologii , podobnie jak duży, bardzo zróżnicowany genetycznie rodzaj, liczący 266 gatunków. Rodzaje Paenibacillus i Brevibacillus to klady zagnieżdżone w Bacillus . Ponieważ Bacillus ma duże znaczenie medyczne, a Paenibacillus jest organizmem modelowym używanym w badaniach, zmiana ich nazw w celu odzwierciedlenia filogenezy spowodowałaby zamieszanie.
Zobacz też
- Monofilia
- parafilicznie
- polifilia
- Problem gatunku
- Stopień ewolucyjny
- Tajemniczy kompleks gatunków
- synonim (taksonomia)
- Taksonomia
- LPSN , lista akceptowanych nazw bakterii i archeonów
- Typy bakteryjne , złożony schemat klasyfikacji
- Cyjanobakterie , gromada pospolitych bakterii, które pozostają słabo sklasyfikowane