Transporter żelaza/ołowiu
żelaza /ołowiu (ILT) ( TC# 2.A.108 ) to rodzina białek transbłonowych należąca do nadrodziny eksporterów lizyny (LysE) . Rodzina ILT obejmuje dwie podrodziny, rodzinę transportującą żelazo (OFeT) ( TC# 2.A.108.1 ) i rodzinę transportującą ołów (PbrT) ( TC# 2.A.108.2 ). Reprezentatywną listę białek należących do tych podrodzin rodziny ILT można znaleźć w Transporter Classification Database .
Transportery żelaza
Drożdże ( Saccharomyces cerevisiae , Candida albicans i Schizosaccharomyces pombe ) i inne grzyby mają wysokie powinowactwo (Km ≈ 0,1 μM) do układów pobierania Fe 2+ . Systemy te zależą od ferroksydaz powierzchniowych komórek w celu przekształcenia zewnątrzkomórkowego Fe 2+ w Fe 3+ , które może być następnie wchłonięte przez transporter o niskim powinowactwie (30 μM) z rodziny FeT ( TC #9.A.9 ) lub przez transporter o wysokim powinowactwie -affinity Opisany tutaj transporter z rodziny OFeT. Do uzyskania wysokiego powinowactwa Fe 2+ wymagane są dwa produkty genowe transportu, Fet3p, który jest oksydazą, i Ftr1p, który jest składnikiem permeazy.
Fet3p
Fet3p z S. cerevisiae jest wielomiedziową oksydazą (636 reszt aminoacylowych), która raz rozciąga się na błonę komórkową (reszty 561-584) i ma dwie domeny oksydazy wielomiedziowej (reszty 121-141 i 483-494), które posiadają aktywność ferroksydazy na zewnętrzną powierzchnię błony plazmatycznej. Jest członkiem rodziny oksydaz wielomiedziowych i dlatego jest homologiczny do lakkazy (benzenodiol: oksydoreduktaza tlenowa lub ligninolityczna oksydaza fenolowa), jak również do oksydazy L-askorbinianowej , ceruloplazminy i oksydazy dihydrogeodyny. Jego domena wiążąca miedź jest homologiczna do domeny wiążącej miedź PcoA z E. coli .
Ftr1p
Ftr1p jest białkiem składającym się z 404 reszt aminokwasowych, które mogą siedmiokrotnie rozciągać błonę. Wykazuje homologię z innymi otwartymi ramkami odczytu (ORF) drożdży, a także ORF glonów, bakterii i archeonów. Bakteryjne i archeologiczne ORF są bardzo różne od białek drożdży i dlatego mogą pełnić odmienne funkcje. Niedawno scharakteryzowano bakteryjny transporter żelaza z morskiej magnetotaktycznej α-proteobakterii, ale błędy w sekwencji wykluczyły włączenie tego białka do TCDB .
Złożony
Jednoczesna ekspresja Fet3p i Ftr1p w drożdżach jest wymagana do właściwej lokalizacji któregokolwiek z białek na powierzchni komórki, co sugeruje, że tworzy się kompleks dwóch białek. Oba białka są regulowane koordynacyjnie, ulegając ekspresji na wysokim poziomie, gdy żelazo jest nieobecne i tłumione, gdy żelazo jest nasycone.
Funkcjonować
Zasugerowano reakcję translokacji grupowej, w której Fe 2+ jest jednocześnie utleniane i transportowane do Fe 3+ , ale jej nie zademonstrowano. Alternatywnie, Fe 2+ może zostać utlenione przez Fet3p do Fe 3+ , które może przejść z miejsca aktywnego Fet3p bezpośrednio do miejsca wiązania Fe 3+ w Ftr1. Jeszcze inną możliwością jest to, że Fet3p działa tylko pośrednio w transporcie, umożliwiając wstawienie błony, lokalizację lub stabilność Ftr1p z powodu tworzenia kompleksu między tymi dwoma białkami. Niezależnie od tych możliwości nie wiadomo, czy działa kanał lub mechanizm nośny. Natura procesu łączenia energii w transporcie nie jest ustalona.
Scharakteryzowano dwuczęściowy układ wychwytu żelaza, FetM (646 aas; 8 TMS w układzie 1 + 7)/FetP (białko peryplazmatyczne, które zwiększa wychwyt żelaza przez FetM) (TC# 2.A.108.2.10). FetP wiąże Cu 2+ i Mn 2+ w dwóch różnych miejscach, oddalonych od siebie o 1,3 Å, w tym homodimerycznym białku. Trójwymiarowa struktura z dwoma Cu 2+ związanymi z każdą z dwóch podjednostek ujawniła różne geometrie w obu miejscach. FetMP może być permeazą żelaza z funkcją wychwytywania żelaza i prawdopodobnie również funkcją redukcji żelaza.
Reakcja transportu
Uogólniona reakcja transportowa dla rodziny OFeT to:
(1) Fe 3+ (wychodzi) → Fe 3+ (wchodzi) lub
(2) Fe 2+ (wyjście) + 1/4 O 2 (wyjście) → Fe 3+ (wejście) + 1/2 H 2 O (wyjście).
Transportery ołowiu
PbrT
Pojedyncze białko, PbrT ( TC# 2.A.108.2.1 ), zakodowane w locus oporności na ołów Ralstonia metallidurans CH34, służy jako prototyp rodziny PbrT. Białko to, gdy ulega nadekspresji, zwiększa wrażliwość na Pb 2+ . Białko wykazuje pojedynczy N-końcowy segment hydrofobowy (domniemany TMS) oraz 6 dodatkowych przypuszczalnych TMS w regionie C-końcowym (reszty 420–650) tego białka o długości 652 aminokwasów. Region N-końcowy (reszty 100–218) wykazuje podobieństwo sekwencji do domeny C-końcowej cytochromu C6 dihemowego cytochromu typu c, FixP ( A8HZ17 ), z Azorhizobium caulinodans (30% identyczności). C-końcowa domena transbłonowa (reszty 223–619) wykazuje podobieństwo sekwencji do członków rodziny transporterów Fe 2+ zależnych od oksydazy , OFeT ( TC# 2.A.108 ), w tym transportera żelaza Ftr1 z Saccharomyces cerevisiae ( TC# 2.A.108.1.1 ) (30% tożsamości). Zatem PbrT jest powiązany z rodziną OFeT, zarówno strukturalnie, jak i funkcjonalnie. Domena N-końcowa (reszty 100–218 w R. metallidurans ) wykazuje podobieństwo do domeny C-końcowej cytochromu C6 w dihemowym cytochromie typu c, FixP z Azorhizobium caulinodans .
Reakcja transportu
Uogólnione reakcje transportowe katalizowane przez członków rodziny PbrT to:
(1) Pb 2+ (wyjście) → Pb 2+ (wejście) i
(2) Fe 2+ (wychodzi) → Fe 2+ (wchodzi).
Zobacz też
Dalsza lektura
- Cao, J; Woodhall, pan; Alvarez, J; Cartron, ML; Andrews, SC (2007). „EfeUOB (YcdNOB) to trójdzielny, indukowany kwasem i regulowany przez CpxAR transporter Fe2 + o niskim pH, który jest tajemniczy w Escherichia coli K-12, ale działa w E. coli O157: H7”. Mol Mikrobiol . 65 (4): 857–75. doi : 10.1111/j.1365-2958.2007.05802.x . PMID 17627767 . S2CID 44998004 . .
- Chan, AC; Dukow, TI; Scofield, M.; Tom Yew, SA; Ramin, AB; Mackichan, JK; Gaynor, WE; Murphy, ja (2010). „Struktura i funkcja P19, transporter żelaza o wysokim powinowactwie ludzkiego patogenu Campylobacter jejuni”. J Mol Biol . 401 (4): 590–604. doi : 10.1016/j.jmb.2010.06.038 . PMID 20600116 . .
- Hložková, K; Suman, J; Strnad, H.; Ruml, T; Kroki, V; Kotrba, P (2013). „Charakterystyka genów pbt nadających zwiększoną tolerancję Pb2 + i Cd2 + na Achromobacter xylosoxidans A8”. Res Microbiol . 164 (10): 1009-18. doi : 10.1016/j.resmic.2013.10.002 . PMID 24125695 . .
- Jung, WH; Sham, A; Lian, T; Singh, A; Kosman, DJ; Kronstad, JW (2008). „Preferencja źródła żelaza i regulacja wychwytu żelaza u Cryptococcus neoformans” . Patog PLOS . 4 (2): e45. doi : 10.1371/journal.ppat.0040045 . PMC 2242830 . PMID 18282105 . .
- Mateusz, A; Eberl, L; Carlier, AL (2014). „Nowa, niezależna od sideroforów strategia wychwytu żelaza w rodzaju Burkholderia” . Mol Mikrobiol . 91 (4): 805–20. doi : 10,1111/mmi,12499 . PMID 24354890 . S2CID 45695964 . .
- Terzulli, A; Kosman, DJ (2010). „Analiza systemu wychwytu żelaza o wysokim powinowactwie w błonie plazmatycznej Chlamydomonas reinhardtii” . Komórka Eukariota . 9 (5): 815–26. doi : 10.1128/EC.00310-09 . PMC 2863958 . PMID 20348389 . .
- VanOrsdel, CE; Bhatt, S; Allen, RJ; Brenner EP; Hobson, JJ; Jamil, A; Haynes, BM; Genson, AM; Hemm, MR (2013). „Białko Escherichia coli CydX jest członkiem kompleksu oksydazy CydAB cytochromu bd i jest wymagane do aktywności oksydazy cytochromu bd” . J Bakteriol . 195 (16): 3640–50. doi : 10.1128/JB.00324-13 . PMC 3754557 . PMID 23749980 . .
- Zieglera, L; Terzulli, A; Gaur, R; McCarthy, R; Kosman, DJ (2011). „Charakterystyka funkcjonalna ferroksydazy, permeazy kompleksu transportu żelaza o wysokim powinowactwie z Candida albicans” . Mol Mikrobiol . 81 (2): 473–85. doi : 10.1111/j.1365-2958.2011.07704.x . PMC 3133879 . PMID 21645130 . .
Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treści z „2.A.108 The Iron/Lead Transporter (ILT) Family” , które są objęte licencją zezwalającą na ponowne wykorzystanie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie na licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License GFDL . _ Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.