Eksporter lizyny
| Eksporter D- i L-lizyny, histydyny i argininy (LysE) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identyfikatory | |||||||||
| Symbol | LysE aka CGL1262 | ||||||||
| Pfam | PF01810 | ||||||||
| InterPro | IPR001123 | ||||||||
| TCDB | 2.A.75 | ||||||||
| Nadrodzina OPM | 248 | ||||||||
| Białko OPM | 2n4x | ||||||||
| |||||||||
Eksporterzy lizyny to nadrodzina białek transbłonowych , które eksportują aminokwasy , lipidy i jony metali ciężkich . Zapewniają homeostazę jonową , biorą udział w tworzeniu otoczki komórkowej i chronią przed nadmiernym stężeniem metali ciężkich w cytoplazmie . Nadrodzina została nazwana na podstawie wczesnego odkrycia białka nośnikowego LysE z Corynebacterium glutamicum .
Rodziny
2.A.75 – Rodzina eksporterów L-lizyny (LysE).
2.A.76 - Odporność na rodzinę homoseryny/treoniny (RhtB).
2.A.77 - Rodzina odporności na kadm (CadD).
2.A.95 - Rodzina transporterów neutralnych aminokwasów (NAAT) 6TMS
2.A.106 - Rodzina Ca 2+ :H + Antiporter-2 (CaCA2)
2.A.107 - Rodzina eksporterów Mn 2+ (MntP).
2.A.108 — Rodzina transporterów żelaza/ołowiu (ILT).
2.A.109 - Rodzina oporności na jony telluru (TerC).
2.A.113 - Rodzina transporterów niklu/kobaltu (NicO).
2.A.116 - Rodzina białek adresujących peptydoglikolipid (GAP).
5.A.1 - Rodzina oksydoreduktazy D wiązań dwusiarczkowych (DsbD).
Rodzina LysE
Dwóch członków rodziny LysE (LysE z Corynebacterium glutamicum ( TC# 2.A.75.1.1 ) i ArgO z E. coli ) zostało funkcjonalnie scharakteryzowanych, ale funkcjonalnie niescharakteryzowane homologi są zakodowane w genomach wielu bakterii, w tym Bacillus subtilis , Mycobacterium tuberculosis , Aeromonas salmonicida , Helicobacter pylori , Vibrio cholerae i Yersinia pestis . Zatem członkowie rodziny LysE są szeroko rozpowszechnioni w Gram-ujemnych i bakterie Gram-dodatnie .
Struktura
Białka te mają długość 190-240 reszt aminokwasowych i posiadają sześć regionów hydrofobowych. Analizy fuzji PhoA LysE C. glutamicum dostarczyły dowodów na typologię 5 transbłonowych α-helikalnych kluczy (TMS) z N-końcem wewnątrz i C-końcem na zewnątrz. Jednak niektóre dowody sugerują topologię 6 TMS.
Funkcjonować
Wydaje się, że LysE katalizuje jednokierunkowy wypływ L-lizyny (i innych zasadowych aminokwasów, takich jak L-arginina) i zapewnia jedyną drogę wydalania L-lizyny. Uważa się, że źródłem energii jest siła napędowa protonu (H + antyport). Homolog E. coli ArgO ( TC# 2.A.75.1.2 ) usuwa argininę i prawdopodobnie również lizynę i kanawaninę .
Wczesne badania wykazały, że rodzina LysE jest spokrewniona z rodziną RhtB ( TC #2.A.76 ) oraz rodziną CadD ( TC #2.A.77 ) w oparciu zarówno o podobne rozmiary i topologie ich członków, jak i o Wyniki PSI-BLAST.
Uogólniona reakcja transportowa
Uogólniona reakcja transportu dla LysE to:
Lizyna (wejście) + [nH + (wyjście) lub nOH − (wejście)] Lizyna (wyjście) + [nH + (wejście) lub nOH − (wyjście)].
