Transporter oporności na kadm
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| białek oporności na kadm | |||||||||
| Symbol | CadD | ||||||||
| Pfam | PF03596 | ||||||||
| InterPro | IPR004676 | ||||||||
| |||||||||
Rodzina białek opornych na kadm (CadD) ( TC# 2.A.77 ) należy do nadrodziny eksporterów lizyny (LysE) . Członkowie CadD ułatwiają eksport związków kationowych, takich jak kadmu .
Członkowie
Obecnie wiele sekwencjonowanych białek obejmuje rodzinę CadD. Dwa są bliskimi ortologami w dwóch Staphylococcus , o których doniesiono, że działają w oporności na kadm, czwarty działa w eksporcie czwartorzędowych kationów amoniowych , a czwarty to odległa otwarta ramka odczytu (ORF) w Staphylococcus aureus . Białka te znajdują się w bakteriach Gram-dodatnich . Ich tryb sprzężenia energii nie został zbadany, ale przypuszcza się, że obejmuje mechanizm antyportu protonów. Ta rodzina jest daleko spokrewniona z członkami rodziny LysE ( TC #2.A.75 ) i rodziną RhtB ( TC #2.A.76 ). Te trzy rodziny, które należą do nadrodziny LysE , składają się z białek o podobnych rozmiarach (około 200 reszt) i topologiach (6 domniemanych transbłonowych segmentów α-helikalnych; 5 eksperymentalnie określonych TMS).
Ogólna reakcja transportu
Prawdopodobna reakcja katalizowana przez te białka to:
Związek kationowy (wejście) + nH + (wyjście) → Związek kationowy (wyjście) + nH + (wyjście).
Dalsza lektura
- Schirawski J, Hagens W, Fitzgerald GF, Van Sinderen D (listopad 2002). „Charakterystyka molekularna oporności na kadm u Streptococcus thermophilus szczep 4134: przykład bocznego transferu genów” . Mikrobiologia stosowana i środowiskowa . 68 (11): 5508–16. Bibcode : 2002ApEnM..68.5508S . doi : 10.1128/AEM.68.11.5508-5516.2002 . PMC 129935 . PMID 12406744 .
- Johnson DA, Tetu SG, Phillippy K, Chen J, Ren Q, Paulsen IT (październik 2008). „Wysokoprzepustowa charakterystyka fenotypowa genów transportu błonowego Pseudomonas aeruginosa” . PLOS Genetyka . 4 (10): e1000211. doi : 10.1371/journal.pgen.1000211 . PMC 2542419 . PMID 18833300 .
- Nies DH (styczeń 1992). „Odporność drobnoustrojów na kadm, kobalt, cynk i nikiel”. plazmid . 27 (1): 17–28. doi : 10.1016/0147-619X(92)90003-S . PMID 1741458 .
- Braz VS, Marques MV (październik 2005). „Geny zaangażowane w oporność na kadm u Caulobacter crescentus” . Listy mikrobiologiczne FEMS . 251 (2): 289–95. doi : 10.1016/j.femsle.2005.08.013 . PMID 16168577 .
- Lee SW, Glickmann E, Cooksey DA (kwiecień 2001). „Locus chromosomalny oporności na kadm w Pseudomonas putida składający się z ATPazy transportującej kadm i regulatora odpowiedzi rodziny MerR” . Mikrobiologia stosowana i środowiskowa . 67 (4): 1437–44. Bibcode : 2001ApEnM..67.1437L . doi : 10.1128/AEM.67.4.1437-1444.2001 . PMC 92752 . PMID 11282588 .
Według stanu na 25 lutego 2016 r. ten artykuł pochodzi w całości lub w części z Transporter Classification Database , którego autorem jest Saier Lab Bioinformatics. Właściciel praw autorskich udzielił licencji na treść w sposób, który pozwala na ponowne wykorzystanie zgodnie z CC BY-SA 3.0 i GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków. Oryginalny tekst znajdował się w „2.A.77 Rodzina odporności na kadm (CadD)”
