Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
UBB
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie Human UniProt:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, HEL-S-50,
identyfikatory zewnętrzne ubikwityny B
Wikidane
Ubikwityna jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen UBB .
Funkcjonować
Ubikwityna jest jednym z najbardziej konserwatywnych białek znanych organizmom eukariotycznym. Ubikwityna jest wymagana do ATP , nielizosomalnej degradacji białek wewnątrzkomórkowych nieprawidłowych białek i normalnych białek z szybkim obrotem. Ubikwityna jest kowalencyjnie związana z białkami, które mają ulec degradacji, i przypuszczalnie znakuje te białka do degradacji. Ubikwityna wiąże się również z histonem H2A w aktywnie transkrybowanych regionach, ale nie powoduje degradacji histonu H2A, co sugeruje, że ubikwityna bierze również udział w regulacji ekspresji genów. Gen ten składa się z trzech bezpośrednich powtórzeń sekwencji kodującej ubikwitynę bez sekwencji rozdzielającej. W konsekwencji białko ulega ekspresji jako prekursor poliubikwityny z końcowym aminokwasem po ostatnim powtórzeniu. Nieprawidłowa postać tego białka ( UBB+1 ) zaobserwowano u pacjentów z chorobą Alzheimera , zespołem Downa , innymi tauopatiami (np. chorobą Picka ) i chorobą poliglutaminową (np. chorobą Huntingtona ).
Dalsza lektura
Conaway RC, Brower CS, Conaway JW (2002). „Pojawiające się role ubikwityny w regulacji transkrypcji”. nauka . 296 (5571): 1254-1258. Bibcode : 2002Sci...296.1254C . doi : 10.1126/science.1067466 . PMID 12016299 . S2CID 38822700 .
Murphey RK, Godenschwege TA (2002). „Nowe role ubikwityny w montażu i funkcji obwodów neuronalnych” . neuron . 36 (1): 5–8. doi : 10.1016/S0896-6273(02)00943-1 . PMID 12367500 . S2CID 15764136 .
Mazzé FM, Degreve L (2006). „Rola białek wirusowych i komórkowych w pączkowania ludzkiego wirusa niedoboru odporności”. Acta Virol . 50 (2): 75–85. PMID 16808324 .
Schlesinger DH, Goldstein G (1975). „Molekularna ochrona sekwencji 74 aminokwasów ubikwityny między bydłem a człowiekiem”. Natura . 255 (5507): 423–4. Bibcode : 1975Natur.255..423S . doi : 10.1038/255423a0 . PMID 1128706 . S2CID 4159096 .
Adams SM, Sharp MG, Walker RA i in. (1992). „Różnicowa ekspresja genów związanych z translacją w łagodnych i złośliwych ludzkich guzach piersi” . br. J. Rak . 65 (1): 65–71. doi : 10.1038/bjc.1992.12 . PMC 1977345 . PMID 1370760 .
Pancre V, Pierce RJ, Fournier F i in. (1991). „Wpływ ubikwityny na funkcje płytek krwi: możliwa identyczność z limfokiną hamującą aktywność płytek krwi (PASL)”. Eur. J. Immunol . 21 (11): 2735–41. doi : 10.1002/eji.1830211113 . PMID 1657614 . S2CID 23901646 .
Baker RT, Zarząd PG (1991). „Ludzki gen białka fuzyjnego ubikwityny-52 aminokwasów ma kilka wspólnych cech strukturalnych z genami białka rybosomalnego ssaków” . Kwasy nukleinowe Res . 19 (5): 1035–1040. doi : 10.1093/nar/19.5.1035 . PMC 333777 . PMID 1850507 .
Fornace AJ, Alamo I, Hollander MC, Lamoreaux E (1989). „MRNA ubikwityny jest głównym transkryptem indukowanym stresem w komórkach ssaków” . Kwasy nukleinowe Res . 17 (3): 1215–1230. doi : 10.1093/nar/17.3.1215 . PMC 331738 . PMID 2537950 .
Lund PK, Moats-Staats BM, Simmons JG i in. (1985). „Analiza sekwencji nukleotydów cDNA kodującego ludzką ubikwitynę ujawnia, że ubikwityna jest syntetyzowana jako prekursor” . J. Biol. chemia . 260 (12): 7609–13. doi : 10.1016/S0021-9258(17)39652-7 . PMID 2581967 .
Einspanier R, Sharma HS, Scheit KH (1987). „Klonowanie i analiza sekwencji cDNA kodującego poli-ubikwitynę w ludzkich komórkach ziarnistych jajnika”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 147 (2): 581–587. doi : 10.1016/0006-291X(87)90970-3 . PMID 2820408 .
Wiborg O, Pedersen MS, Wind A i in. (1985). „Multigenowa rodzina ludzkiej ubikwityny: niektóre geny zawierają wiele bezpośrednio powtarzających się sekwencji kodujących ubikwitynę” . EMBO J. 4 (3): 755–9. doi : 10.1002/j.1460-2075.1985.tb03693.x . PMC 554252 . PMID 2988935 .
Baker RT, Zarząd PG (1987). „Rodzina genów ludzkiej ubikwityny: struktura genu i pseudogenów z podrodziny Ub B” . Kwasy nukleinowe Res . 15 (2): 443–463. doi : 10.1093/nar/15.2.443 . PMC 340445 . PMID 3029682 .
Vijay-Kumar S, Bugg CE, Cook WJ (1987). „Struktura ubikwityny udoskonalona w rozdzielczości 1,8 A”. J. Mol. Biol . 194 (3): 531–544. doi : 10.1016/0022-2836(87)90679-6 . PMID 3041007 .
Busch H. (1984). „[23] Ubikwitynacja białek”. Ubikwitynacja białek . Met. Enzymol . Metody w enzymologii. Tom. 106. s. 238–262. doi : 10.1016/0076-6879(84)06025-0 . ISBN 978-0-12-182006-0 . PMID 6092831 .
Andersen MW, Ballal NR, Goldknopf IL, Busch H (1981). „Aktywność liazy białka A24 w jąderkach wątroby szczura leczonej tioacetamidem uwalnia histon 2A i ubikwitynę ze sprzężonego białka A24”. Biochemia . 20 (5): 1100–1104. doi : 10.1021/bi00508a009 . PMID 6261785 .
Busch H, Goldknopf IL (1982). „Ubikwityna - koniugaty białkowe”. Mol. Komórka. Biochem . 40 (3): 173–87. doi : 10.1007/bf00224611 . PMID 6275256 . S2CID 21101636 .
Treier M, Staszewski LM, Bohmann D (1994). „Zależna od ubikwityny degradacja c-Jun in vivo odbywa się za pośrednictwem domeny delta”. komórka . 78 (5): 787–798. doi : 10.1016/S0092-8674(94)90502-9 . PMID 8087846 . S2CID 33344164 .
Cook WJ, Jeffrey LC, Kasperek E, Pickart CM (1994). „Struktura tetraubikwityny pokazuje, jak mogą tworzyć się łańcuchy multiubikwityny”. J. Mol. Biol . 236 (2): 601–609. doi : 10.1006/jmbi.1994.1169 . PMID 8107144 .
Ramage R, Green J, Muir TW i in. (1994). „Badania syntetyczne, strukturalne i biologiczne systemu ubikwityny: całkowita synteza chemiczna ubikwityny” . Biochem. J. _ 299 (1): 151–8. doi : 10.1042/bj2990151 . PMC 1138034 . PMID 8166633 .
Galeria WP
1aar : STRUKTURA KONJUGATU DIUBIKWITYNY I MODEL ODDZIAŁYWANIA Z ENZYMEM KONJUGUJĄCYM UBIKWITYNĘ (E2)
1cmx : STRUKTURALNE PODSTAWY SPECYFICZNOŚCI C-TERMINALNYCH HYDROLAZ UBIKWITYNY
1d3z : STRUKTURA UBIKWITYNY NMR
1f9j : STRUKTURA NOWEJ FORMY KRYSZTAŁOWEJ TETRAUBIKWITYNY
1fxt : STRUKTURA KOMPLEKSU KONJUGATU ENZYMU-TIIOLESTERU UBIKWITYNY
1g6j : STRUKTURA REKOMBINOWANEJ LUDZKIEJ UBIKWITYNY W ODWRÓCONE MICELE AOT
1gjz : STRUKTURA ROZTWORU DIMERYCZNEGO N-KOŃCOWEGO FRAGMENTU LUDZKIEJ UBIKWITYNY
1nbf : Struktura krystaliczna enzymu deubikwitynującego z rodziny UBP w izolacji iw kompleksie z aldehydem ubikwityny
1ogw : SYNTETYCZNA UBIKWITYNA Z FLUORO-LEU W 50 I 67
1otr : Struktura rozwiązania kompleksu CUE-ubikwityna
1p3q : Mechanizm rozpoznawania ubikwityny przez domenę CUE VPS9
1q0w : Struktura roztworu amino-końcowego kompleksu UIM-ubikwityna Vps27
1q5w : Rozpoznawanie ubikwityny przez palce cynkowe Npl4
1s1q : Domena TSG101 (UEV) w kompleksie z ubikwityną
1sif : Struktura krystaliczna wielokrotnego hydrofobowego rdzenia mutanta ubikwityny
1tbe : STRUKTURA TETRAUBIKWITYNY POKAZUJE, W JAKI SPOSÓB MOGĄ TWORZYĆ SIĘ ŁAŃCUCHY MULTIUBIKWITYNY
1ubi : SYNTETYCZNE BADANIA STRUKTURALNE I BIOLOGICZNE SYSTEMU UBIKWITYNY. CZĘŚĆ 1
1ubq : STRUKTURA UBIKWITYNY WYRAFINOWANA DO ROZDZIELCZOŚCI 1,8 ANGSTROMA
1ud7 : STRUKTURA ROZWIĄZANIA ZAPROJEKTOWANEGO HYDROFOBOWEGO MUTANTA RDZENNEGO UBIKWITYNY, 1D7
1uzx : KOMPLEKS VPS23 UEV Z UBIQUITINĄ
1v80 : Struktury roztworów ubikwityny przy 30 barach i 3 kbarach
1v81 : Struktury roztworów ubikwityny przy 30 barach i 3 kbarach
1wr1 : Złożona struktura Dsk2p UBA z ubikwityną
1wr6 : Struktura krystaliczna domeny GGA3 GAT w kompleksie z ubikwityną
1wrd : Struktura krystaliczna domeny Tom1 GAT w kompleksie z ubikwityną
1xd3 : Struktura krystaliczna kompleksu UCHL3-UbVME
1xqq : Jednoczesne wyznaczanie struktury i dynamiki białek
1yd8 : KOMPLEKS LUDZKIEJ DOmeny GGA3 GAT I UBIKWITYNY
1yiw : Rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej ubikwityny
1yj1 : rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej [D-Gln35] ubikwityny
1yx5 : Struktura rozwiązania kompleksu S5a UIM-1/Ubiquitin
1yx6 : Struktura rozwiązania kompleksu S5a UIM-2/Ubiquitin
1zgu : Struktura roztworu ludzkiego kompleksu Mms2-Ubiquitin
2ayo : Struktura USP14 związana z aldehydem ubkwityny
2bgf : STRUKTURA NMR DI-UBIKWITYNY ZWIĄZANEJ Z LYS48 WYKORZYSTUJĄC DANE O ZABURZENIU PRZESUNIĘCIA CHEMICZNEGO RAZEM Z RDCS I DANYMI RELAKSACYJNYMI 15N
2c7m : LUDZKIE RESZTY RABEX-5 1-74 W KOMPLEKSIE Z UBIKWITYNĄ
2c7n : LUDZKIE RESZTY RABEX-5 1-74 W KOMPLEKSIE Z UBIKWITYNĄ
2d3g : Dwustronne wiązanie ubikwityny z Hrs-UIM
2den : Struktura rozwiązania domeny związanej z ubikwityną ludzkiego BMSC-UbP i jej kompleksu z ubikwityną
2dx5 : Złożona struktura między mysią domeną EAP45-GLUE a ubikwityną
2fcm : Rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej [D-Gln35] ubikwityny z sześcienną grupą przestrzenną
2fcn : Rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej [D-Val35] ubikwityny z sześcienną grupą przestrzenną
2fcq : Rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej ubikwityny z sześcienną grupą przestrzenną
2fcs : Rentgenowska struktura krystaliczna chemicznie zsyntetyzowanej [L-Gln35] ubikwityny z sześcienną grupą przestrzenną
2fid : Struktura krystaliczna bydlęcego fragmentu Rabex-5 skompleksowanego z ubikwityną
2fif : Struktura krystaliczna bydlęcego fragmentu Rabex-5 skompleksowanego z ubikwityną
2fuh : Struktura roztworu kompleksu niekowalencyjnego UbcH5c/Ub
2g3q : Struktura rozwiązania kompleksu Ede1 UBA-ubikwityna
2g45 : Struktura kokrystaliczna domeny znf ubp z deubikwitynującego enzymu izopeptydazy T (isot) w kompleksie z ubikwityną
2gbj : Struktura krystaliczna mutanta insercyjnego 9-10 8 glicyny ubikwityny.
2gbk : Struktura krystaliczna mutanta insercyjnego 9-10 MoaD ubikwityny
2gbm : Struktura krystaliczna 35-36 8 mutanta insercyjnego glicyny ubikwityny
2gbn : Struktura krystaliczna mutanta ubikwityny z wstawką glicyny 35-36 8
2gbr : Struktura krystaliczna mutanta insercyjnego 35-36 MoaD ubikwityny
2gmi : Mms2/Ubc13~Ubikwityna
2hd5 : USP2 w kompleksie z ubikwityną
2h : Strukturalna podstawa rozpoznawania ubikwityny przez ludzką domenę EAP45/ESCRT-II GLUE
2ibi : Kompleks kowalencyjny ubikwityny-USP2
2j7q : STRUKTURA KRYSZTAŁOWA PROTEAZY SPECYFICZNEJ UBIKWITYNY KODOWANEJ PRZEZ BIAŁKO POWŁOKI M48 mysiego wirusa cytomegalii W KOMPLEKSIE Z SAMOBÓJCZYM PODŁOŻEM NA BAZIE UBKITYNY
2nr2 : Metoda MUMO (minimal under-resining minimal over-resining) do oznaczania stanów natywnych zespołów białek
2o6v : Struktura krystaliczna i badania NMR w roztworze tetraubikwityny połączonej z Lys48 w obojętnym pH
2oob : struktura krystaliczna domeny UBA z ligazy ubikwityny Cbl-b w kompleksie z ubikwityną