VPS4A

VPS4A
Dostępne konstrukcje
WPB	Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, SKD1, SKD1A, SKD2, VPS4, VPS4-1, wakuolowe sortowanie białek 4 homolog A, CIMDAG
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek )
Chr.
Koniec
Lokalizacja genu ( mysz )
Chr.
Koniec
Wzór ekspresji RNA
Ontologia genów
Funkcje molekularne
Składnik komórkowy
Proces biologiczny
	Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi
	Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka	Wyświetl/edytuj mysz

Białko 4A związane z sortowaniem białek wakuolowych jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen VPS4A .

Funkcjonować

Białko kodowane przez ten gen należy do rodziny białek AAA (ATPazy związane z różnymi aktywnościami komórkowymi) i jest homologiem drożdżowego białka Vps4. U ludzi zidentyfikowano dwa paralogi białka drożdży. Dzielą one ze sobą wysoki stopień podobieństwa sekwencji aminokwasów , a także z drożdżowymi Vps4 i mysimi białkami. Badania funkcjonalne wskazują, że oba ludzkie paralogi łączą się z przedziałami endosomalnymi i biorą udział w wewnątrzkomórkowym handlu białkami , podobny do białka Vps4 w drożdżach. Gen kodujący ten paralog został zmapowany na chromosomie 16 ; gen drugiego znajduje się na chromosomie 18 .

Interakcje

Wykazano, że VPS4A oddziałuje z CHMP1A .

Dalsza lektura

Scheuring S, Bodor O, Röhricht RA, Müller S, Beyer A, Köhrer K (1999). „Klonowanie, charakteryzacja i funkcjonalna ekspresja genu Mus musculus SKD1 w drożdżach pokazuje, że mysie geny SKD1 i drożdżowe VPS4 są ortologami i biorą udział w wewnątrzkomórkowym handlu białkami”. gen . 234 (1): 149–59. doi : 10.1016/S0378-1119(99)00163-8 . PMID 10393249 .
Hu RM, Han ZG, Song HD, Peng YD, Huang QH, Ren SX, Gu YJ, Huang CH, Li YB, Jiang CL, Fu G, Zhang QH, Gu BW, Dai M, Mao YF, Gao GF, Rong R , Ye M, Zhou J, Xu SH, Gu J, Shi JX, Jin WR, Zhang CK, Wu TM, Huang GY, Chen Z, Chen MD, Chen JL (2000). „Profilowanie ekspresji genów w ludzkiej osi podwzgórze-przysadka-nadnercza i klonowanie pełnej długości cDNA” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 97 (17): 9543–8. Bibcode : 2000PNAS...97.9543H . doi : 10.1073/pnas.160270997 . PMC 16901 . PMID 10931946 .
Howard TL, Stauffer DR, Degnin CR, Hollenberg SM (2002). „CHMP1 działa jako członek nowo zdefiniowanej rodziny białek transportujących pęcherzyki”. J. Cell Sci . 114 (Pt 13): 2395–404. doi : 10.1242/jcs.114.13.2395 . PMID 11559748 .
Tanaka H, Fujita H, Katoh H, Mori K, Negishi M (2002). „Vps4-A (sortowanie białek wakuolowych 4-A) jest partnerem wiążącym dla nowej GTPazy z rodziny Rho, Rnd2” . Biochem. J. _ 365 (część 2): 349–53. doi : 10.1042/BJ20020062 . PMC 1222680 . PMID 11931639 .
Nara A, Mizushima N, Yamamoto A, Kabeya Y, Ohsumi Y, Yoshimori T (2002). „Transport endosomalny zależny od SKD1 AAA ATPazy bierze udział w tworzeniu autolizosomów” . Struktura komórkowa. Funkcja . 27 (1): 29–37. doi : 10.1247/csf.27.29 . PMID 11937716 .
Chagnon P, Michaud J, Mitchell G, Mercier J, Marion JF, Drouin E, Rasquin-Weber A, Hudson TJ, Richter A (2003). „Mutacja Missense (R565W) u Cirhin (FLJ14728) w marskości wątroby u dzieci w Ameryce Północnej” . Jestem. J. Hum. Genet . 71 (6): 1443–9. doi : 10.1086/344580 . PMC 378590 . PMID 12417987 .
Beyer A, Scheuring S, Müller S, Mincheva A, Lichter P, Köhrer K (2003). „Porównawcze analizy sekwencji i ekspresji czterech genów VPS4 ssaków”. gen . 305 (1): 47–59. doi : 10.1016/S0378-1119(02)01205-2 . PMID 12594041 .
Katoh K, Shibata H, Suzuki H, Nara A, Ishidoh K, Kominami E, Yoshimori T, Maki M (2003). „Białko Alix oddziałujące z ALG-2 wiąże się z CHMP4b, ludzkim homologiem drożdży Snf7, który bierze udział w wielopęcherzykowym sortowaniu ciał” . J. Biol. chemia . 278 (40): 39104-13. doi : 10.1074/jbc.M301604200 . PMID 12860994 .
Strack B, Calistri A, Craig S, Popova E, Göttlinger HG (2003). „AIP1 / ALIX jest partnerem wiążącym dla HIV-1 p6 i EIAV p9 funkcjonującym podczas pączkowania wirusa” . komórka . 114 (6): 689–99. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00653-6 . PMID 14505569 . S2CID 10733770 .
von Schwedler UK, Stuchell M, Müller B, Ward DM, Chung HY, Morita E, Wang HE, Davis T, He GP, Cimbora DM, Scott A, Kräusslich HG, Kaplan J, Morham SG, Sundquist WI (2003). „Sieć białkowa pączkowania HIV” . komórka . 114 (6): 701–13. doi : 10.1016/S0092-8674(03)00714-1 . PMID 14505570 . S2CID 16894972 .
Sachse M, Strous GJ, Klumperman J (2004). „HVPS4 z niedoborem ATPazy upośledza tworzenie się wewnętrznych pęcherzyków endosomalnych i stabilizuje dwuwarstwowe powłoki klatryny na wakuolach endosomalnych” . J. Cell Sci . 117 (część 9): 1699–708. doi : 10.1242/jcs.00998 . PMID 15075231 .
Lin Y, Kimpler LA, Naismith TV, Lauer JM, Hanson PI (2005). „Interakcja endosomalnego kompleksu sortującego ssaków wymaganego do transportu (ESCRT) III białka hSnf7-1 z samym sobą, błonami i AAA + ATPazą SKD1” . J. Biol. chemia . 280 (13): 12799–809. doi : 10.1074/jbc.M413968200 . PMID 15632132 .
Scott A, Gaspar J, Stuchell-Brereton MD, Alam SL, Skalicky JJ, Sundquist WI (2005). „Struktura i interakcje białkowe ESCRT-III domeny MIT ludzkiego VPS4A” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 102 (39): 13813-8. Bibcode : 2005PNAS..10213813S . doi : 10.1073/pnas.0502165102 . PMC 1236530 . PMID 16174732 .
Tsang HT, Connell JW, Brown SE, Thompson A, Reid E, Sanderson CM (2006). „Systematyczna analiza interakcji ludzkiego białka CHMP: dodatkowe białka zawierające domenę MIT wiążą się z wieloma składnikami ludzkiego kompleksu ESCRT III” . Genomika . 88 (3): 333–46. doi : 10.1016/j.ygeno.2006.04.003 . PMID 16730941 .
Chen VY, Posada MM, Blazer LL, Zhao T, Rosania GR (2007). „Rola szlaku egzosomu VPS4A w wewnętrznej drodze wyjścia leku przeciwnowotworowego wiążącego DNA”. Farmacja. Rez . 23 (8): 1687–95. doi : 10.1007/s11095-006-9043-0 . PMID 16841193 . S2CID 2777033 .
Lambert C, Döring T, Prange R (2007). „Dojrzewanie wirusa zapalenia wątroby typu B jest wrażliwe na funkcjonalne hamowanie ESCRT-III, Vps4 i γ2-adaptyny” . J. Wirol . 81 (17): 9050–60. doi : 10.1128/JVI.00479-07 . PMC 1951427 . PMID 17553870 .