Wirus marszczenia rzepy
| Wirus marszczenia rzepy | |
|---|---|
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Kitrinoviricota |
| Klasa: | Tolucaviricetes |
| Zamówienie: | Tolivirales |
| Rodzina: | Tombusviridae |
| Rodzaj: | Betakarmowirus |
| Gatunek: |
Wirus marszczenia rzepy
|
Wirus marszczenia rzepy (TCV) jest wirusem chorobotwórczym dla roślin z rodziny Tombusviridae . Po raz pierwszy został wyizolowany z rzepy ( Brassica campestris ssp. rapa ).
Struktura
TCV jest małym (4054 nukleotydów ), jednoniciowym wirusem RNA o dodatniej czułości (wirusowy RNA ma tę samą orientację co mRNA). Wykazano, że infekuje różne rodzaje gatunków roślin, w tym pospolite modele roślin Arabidopsis thaliana i Nicotiana benthamiana . Jego gRNA koduje pięć białek : p28 i p88 (replikacja), p8 i p9 (ruch) oraz CP (białko otoczki lub enkapsydacja ). Strukturę wirusa określono z rozdzielczością 3,2 angstremów przy użyciu krystalografia rentgenowska w 1986. Jest strukturalnie bardzo podobny do wirusa krzaczastego pomidora .
genomie TCV scharakteryzowano szereg niekodujących elementów RNA ; przykładami są szpilka do włosów 5 i promotor rdzeniowy .
Replikacja
Replikacja wirusowego RNA rozpoczyna się od migracji p28 do błony mitochondrialnej. p28 migruje do zewnętrznej błony mitochondrialnej i wnika w nią; kilka cząsteczek p88 przenosi się do nowo utworzonych pęcherzyków. Wirusowy RNA wiąże się z p28 związanym z błoną, a polimeraza RNA zależna od RNA , czyli p88, inicjuje replikację dodatniej nici RNA w celu wytworzenia pośredniej nici ujemnej. Półprodukt o ujemnej nici jest używany jako matryca do wytwarzania dodatniej nici RNA potomstwa. Białka płaszcza p8, p9 i p38 biorą udział w ruchu w roślinie.
Wirusy satelitarne
, że małe wirusy pomocnicze znane jako satelitarne RNA współinfekują rośliny tylko w obecności TCV. Te niekodujące RNA zwiększają objawy zakażenia TCV. Propagacja satelitarnego RNA zależy od TCV i maszynerii gospodarza. Satelita C ma wspólną homologię sekwencji z końcem 3' TCV, podczas gdy satelita D ma homologię sekwencji z końcem 5' satelity C. [ Potrzebne źródło ]
Odporność Arabidopsis thaliana na TCV
Przeprowadzono wiele badań nad TCV i sposobem, w jaki wpływa na Arabidopsis thaliana (rzeżucha tajska). Namioty Arabidopsis są bardzo podatne na TCV, podobnie jak kilka innych gatunków innych niż rzepa. Jest używany do badań, ponieważ jego podatność i prostota sprawiają, że jest dobrym organizmem modelowym. Badania wykazały, że tylko satelita C wywołuje jakiekolwiek objawy u Arabidopsis. Te same badania wykazały, że to, jak bardzo roślina jest dotknięta wirusem, zależy w dużej mierze od ekotypu, ponieważ ekotyp Dijon Arabidopsis thaliana wydaje się być znacznie bardziej podatny niż inne typy. Wykazano również, że światło wpływa na odporność Arabidopsis na TCV, a inokulacja okazała się nieskuteczna bez ekspozycji rośliny na światło. Przeprowadzono również badania nad tym, jaka część TCV jest rozpoznawana przez szczepy Arabidopsis odporne na TCV i wydaje się, że jest to koniec aminowy białka płaszcza. Zostało to określone przy użyciu wirusów zarówno z końcem aminowym, jak i bez niego.