Yersiniaceae
|
|
| Yersiniaceae | |
|---|---|
| Yersinia pestis | |
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | Bakteria |
| Gromada: | pseudomonadota |
| Klasa: | Gammaproteobakterie |
| Zamówienie: | Enterobakterie |
| Rodzina: |
Yersiniaceae Adeolu i in., 2016 |
| Rodzaje | |
Yersiniaceae to rodzina bakterii Gram-ujemnych , która obejmuje niektóre znane patogeny. Na przykład typ rodzaju Yersinia obejmuje Yersinia pestis , czynnik sprawczy dżumy . Ta rodzina jest członkiem rzędu Enterobacterales w klasie Gammaproteobacteria typu Pseudomonadota .
Nazwa Yersiniaceae pochodzi od łacińskiego terminu Yersinia , odnoszącego się do rodzaju rodziny i przyrostka „-aceae”, końcówki używanej do określenia rodziny. Razem Yersiniaceae odnosi się do rodziny, której typem nomenklaturowym jest rodzaj Yersinia .
Charakterystyka biochemiczna i sygnatury molekularne
Bakterie te są ruchliwe , katalazo dodatnie i nie wytwarzają dwusiarczku wodoru .
Analizy sekwencji genomu gatunków Yersiniaceae pozwoliły zidentyfikować trzy konserwatywne indele sygnaturowe (CSI), które są unikalnie obecne w tej rodzinie w regulatorze transkrypcji rodziny TetR i białku hipotetycznym. Te CSI zapewniają niezawodną metodę molekularną do odróżniania członków tej rodziny od innych rodzin z rzędu Enterobacterales i wszystkich innych bakterii.
Systematyka historyczna i aktualna taksonomia
Yersiniaceae, od 2021 r., Zawiera osiem ważnie opublikowanych rodzajów. Członkowie tej rodziny byli pierwotnie członkami rodziny Enterobacteriaceae , dużej niepowiązanej filogenetycznie grupy gatunków o różnych cechach biochemicznych i różnych niszach ekologicznych. Pierwotne przypisanie gatunków do rodziny Enterobacteriaceae było w dużej mierze oparte na analizach sekwencji genomu 16S rRNA, o którym wiadomo, że ma niską moc dyskryminacyjną, a którego wyniki zależą od zastosowanego algorytmu i informacji o organizmie. Mimo to analizy nadal wykazywały rozgałęzienia polifiletyczne, co wskazuje na obecność odrębnych podgrup w obrębie rodziny.
W 2016 roku Adeolu i in. zaproponowali podział Enterobacteriaceae na 7 nowych rodzin w oparciu o porównawcze analizy genomiczne i wzór rozgałęzień różnych drzew filogenetycznych zbudowanych z konserwatywnych sekwencji genomu, sekwencji 16S rRNA i analiz sekwencji multilocus. Markery molekularne, szczególnie zachowane indele sygnaturowe , charakterystyczne dla tej rodziny, zostały również zidentyfikowane jako dowód potwierdzający podział niezależny od drzew filogenetycznych.