Środek denaturacji
Środkowy punkt denaturacji białka definiuje się jako temperaturę (Tm ) lub stężenie środka denaturującego (Cm ) , w którym oba stany sfałdowane i niesfałdowane są jednakowo wypełnione w równowadze (zakładając dwustanowe sfałdowanie białka ). Tm jest często określana za pomocą testu przesunięcia termicznego .
Jeśli założymy, że szerokości pofałdowanych i rozłożonych studzienek są równe, oba te stany będą miały identyczne energie swobodne w punkcie środkowym. Jednak w białek naturalnych tak nie jest. Istnieje nieodłączna asymetria, o czym świadczy różnica pojemności cieplnych między nimi - złożony zespół ma mniejszą pojemność cieplną (innymi słowy, mniejsze fluktuacje , co wskazuje na węższą studnię) niż złożony zespół. Oznaczałoby to, że energia swobodna stanu złożonego jest niższa w punkcie środkowym denaturacji niż w stanie rozłożonym. W takim scenariuszu temperatura, w której oba odwierty mają identyczne energie swobodne, nazywana jest temperaturą charakterystyczną (T o ).
- Bibliografia _ Sanchez-Ruiz, JM (2004). „Eksploracja zespołów fałdowania białek: model ze zmienną barierą do analizy eksperymentów rozwijania równowagi” . Obrady Narodowej Akademii Nauk . 101 (51): 17646–17651. Bibcode : 2004PNAS..10117646M . doi : 10.1073/pnas.0405829101 . PMC 539728 . PMID 15591110 .