2,3-dioksygenaza bifenylu
| identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 2,3-dioksygenazy bifenylu | |||||||||
| nr WE | 1.14.12.18 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
W enzymologii 2,3-dioksygenaza bifenylu ( EC 1.14.12.18 ) jest enzymem , który katalizuje reakcję chemiczną
- bifenyl + NADH + H + + O 2 (1S, 2R) -3-fenylocykloheksa-3,5-dien-1,2-diol + NAD +
Cztery substraty tego enzymu to bifenyl , NADH , H + i O2 i , podczas gdy jego dwoma produktami są (1S,2R)-3-fenylocykloheksa-3,5-dieno-1,2-diol NAD + .
Enzym ten należy do rodziny oksydoreduktaz , szczególnie tych działających na sparowanych dawców, z O2 jako utleniaczem i włączaniem lub redukcją tlenu. Wprowadzony tlen nie musi pochodzić z O2 z NADH lub NADPH jako jednym donorem i włączeniem dwóch atomów tlenu w drugim donorze. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to bifenyl, NADH: oksydoreduktaza tlenowa (2,3-hydroksylująca) . Enzym ten jest również nazywany dioksygenazą bifenylową . Enzym ten bierze udział w degradacji bifenylu .
Studia strukturalne
Od końca 2007 roku rozwiązano dwie struktury dla tej klasy enzymów, z kodami dostępu PDB 1ULI i 1ULJ .
- Plamiak JD, Gibson DT (1995). „Oczyszczanie i charakterystyka składnika oksygenazy 2,3-dioksygenazy bifenylu z Pseudomonas sp. szczep LB400” . J. Bacteriol . 177 (20): 5834–9. doi : 10.1128/jb.177.20.5834-5839.1995 . PMC 177406 . PMID 7592331 .
- Plamiak JD, Pelletier DA, Gibson DT (1997). „Oczyszczanie i właściwości ferredoksyny BPH, składnika 2,3-dioksygenazy bifenylu szczepu Pseudomonas sp. LB400”. J. Ind. Microbiol. Biotechnologia . 19 (5–6): 355–9. doi : 10.1038/sj.jim.2900429 . PMID 9451832 . S2CID 2654044 .
- Broadus RM, Plamiak JD (1998). „Oczyszczanie i charakteryzacja składnika oksydoreduktazy NADH: ferredoksynaBPH 2,3-dioksygenazy bifenylu z Pseudomonas sp. szczep LB400”. Łuk. Mikrobiol . 170 (2): 106–12. doi : 10.1007/s002030050621 . PMID 9683647 . S2CID 11693349 .
