Czynnik indukujący apoptozę 1, mitochondrialny, jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen AIFM1 na chromosomie X. Białko to lokalizuje się w mitochondriach , jak również w jądrze , gdzie przeprowadza fragmentację jądra w ramach apoptozy niezależnej od kaspazy .
AIFM1 ulega ekspresji jako białko prekursorowe o 613 resztach , które zawiera sekwencję kierującą do mitochondriów (MTS) na swoim N-końcu i dwie sekwencje wiodące w jądrze (NLS). Po zaimportowaniu do mitochondriów pierwsze 54 reszty N-końca są rozszczepiane w celu wytworzenia dojrzałego białka, które wstawia się do wewnętrznej błony mitochondrialnej . Dojrzałe białko zawiera kofaktor FAD i fałduje się w trzy domeny strukturalne: domenę wiążącą FAD, domenę wiążącą NAD i C -końcową . Podczas gdy C-końcowy jest odpowiedzialny za aktywność proapoptotyczną AIFM1, domeny wiążące FAD i NAD mają wspólną klasyczną topologię Rossmanna z innymi flawoproteinami i aktywnością reduktazy zależną od NAD(P)H.
Dla tego genu zidentyfikowano trzy alternatywne transkrypty kodujące różne izoformy . Dwie alternatywne splicingowe izoformy mRNA odpowiadają włączeniu/wyłączeniu domeny C-końcowej i reduktazy. Pseudogen, który uważa się za powiązany z tym genem, został zidentyfikowany na chromosomie 10.
Funkcjonować
Gen ten koduje flawoproteinę niezbędną do rozpadu jądra w komórkach apoptotycznych, która znajduje się w mitochondrialnej przestrzeni międzybłonowej w zdrowych komórkach. Indukcja apoptozy powoduje rozszczepienie tego białka w reszcie 102 przez kalpainy i/lub katepsyny do postaci rozpuszczalnej i proapoptogennej, która przemieszcza się do jądra, gdzie powoduje kondensację i fragmentację chromosomów. Ponadto ten produkt genu indukuje mitochondria do uwalniania apoptogennych białek cytochromu c i kaspazy-9. AIFM1 przyczynia się również reduktazy w metabolizmie redoks .
Analiza filogenetyczna wskazuje, że rozbieżność sekwencji AIFM1 i innych ludzkich AIF (AIFM2a i AIFM3) wystąpiła przed rozbieżnością eukariontów. Wniosek ten jest poparty domenową architekturą tych białek. Zarówno eukariotyczne, jak i eubakteryjne białka AIFM1 zawierają dodatkową domenę AIF_C.
Candé C, Cohen I, Daugas E, Ravagnan L, Larochette N, Zamzami N, Kroemer G (2002). „Czynnik indukujący apoptozę (AIF): nowy niezależny od kaspazy efektor śmierci uwalniany z mitochondriów”. Biochimie . 84 (2–3): 215–22. doi : 10.1016/S0300-9084(02)01374-3 . PMID 12022952 .
Księżyc HS, Yang JS (luty 2006). „Rola HIV Vpr jako regulatora apoptozy i efektora na komórki postronne”. Cząsteczki i komórki . 21 (1): 7–20. PMID 16511342 .
Daugas E, Susin SA, Zamzami N, Ferri KF, Irinopoulou T, Larochette N, Prévost MC, Leber B, Andrews D, Penninger J, Kroemer G (kwiecień 2000). „Translokacja mitochondrio-jądrowa AIF w apoptozie i martwicy”. Dziennik FASEB . 14 (5): 729–39. doi : 10.1096/fasebj.14.5.729 . PMID 10744629 . S2CID 7289409 .
Joza N, Susin SA, Daugas E, Stanford WL, Cho SK, Li CY, Sasaki T, Elia AJ, Cheng HY, Ravagnan L, Ferri KF, Zamzami N, Wakeham A, Hakem R, Yoshida H, Kong YY, Mak TW , Zúñiga-Pflücker JC, Kroemer G, Penninger JM (marzec 2001). „Zasadnicza rola mitochondrialnego czynnika indukującego apoptozę w programowanej śmierci komórki”. Natura . 410 (6828): 549–54. Bibcode : 2001Natur.410..549J . doi : 10.1038/35069004 . PMID 11279485 . S2CID 4387964 .
Ravagnan L, Gurbuxani S, Susin SA, Maisse C, Daugas E, Zamzami N, Mak T, Jäättelä M, Penninger JM, Garrido C, Kroemer G (wrzesień 2001). „Białko szoku cieplnego 70 antagonizuje czynnik indukujący apoptozę”. Natura Biologia komórki . 3 (9): 839–43. doi : 10.1038/ncb0901-839 . PMID 11533664 . S2CID 21164493 .
Ye H, Cande C, Stephanou NC, Jiang S, Gurbuxani S, Larochette N, Daugas E, Garrido C, Kroemer G, Wu H (wrzesień 2002). „Wiązanie DNA jest wymagane do apoptogennego działania czynnika indukującego apoptozę”. Biologia strukturalna przyrody . 9 (9): 680–4. doi : 10.1038/nsb836 . PMID 12198487 . S2CID 7819466 .