APOBEK
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| domeny N-końcowej podobne do APOBEC | |||||||||
| Symbol | APOBEC_N | ||||||||
| Pfam | PF08210 | ||||||||
| InterPro | IPR013158 | ||||||||
| |||||||||
| Identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| domeny C-końcowej podobne do APOBEC | |||||||||
| Symbol | APOBEC_C | ||||||||
| Pfam | PF05240 | ||||||||
| InterPro | IPR007904 | ||||||||
| |||||||||
APOBEC („enzym edytujący mRNA apolipoproteiny B, polipeptyd katalityczny”) to rodzina konserwatywnych ewolucyjnie deaminaz cytydynowych .
Mechanizmem generowania różnorodności białek jest edycja mRNA . Członkowie tej rodziny to enzymy edytujące C-do-U . Domena N-końcowa białek podobnych do APOBEC jest domeną katalityczną, podczas gdy domena C-końcowa jest domeną pseudokatalityczną. Dokładniej, domena katalityczna jest domeną deaminazy cytydyny zależnej od cynku i jest niezbędna do deaminacji cytydyny. Edycja RNA przez APOBEC-1 wymaga homodimeryzacji, a kompleks ten oddziałuje z białkami wiążącymi RNA, tworząc editosom .
U ludzi/ssaków pomagają chronić przed infekcjami wirusowymi. Enzymy te, gdy są źle regulowane, są głównym źródłem mutacji w wielu typach nowotworów.
W przeglądzie z 2013 roku omówiono strukturalne i biofizyczne aspekty enzymów z rodziny APOBEC3. Wiele cech białka APOBEC opisano na szeroko przestudiowanej stronie APOBEC3G . [ ton ]
Członkowie rodziny
Ludzkie geny kodujące członków rodziny białek APOBEC obejmują:
- APOBEC1
- APOBEC2
- APOBEC3A
- APOBEC3B
- APOBEC3C
- APOBEC3D („ APOBEC3E ” odnosi się teraz do tego)
- APOBEC3F
- APOBEC3G
- APOBEC3H
- APOBEC4
- Deaminaza indukowana aktywacją (cytydyna) (AID)
