Amphibacillus xylanus
| Klasyfikacja naukowa | |
|---|---|
| Amphibacillus xylanus | |
|
|
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
A. ksylan
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Amphibacillus xylanus Niimura i in., 1990
|
|
Amphibacillus xylanus to Gram - dodatnia bakteria tworząca przetrwalniki z komórkami o średnicy od 0,3 μm do 0,5 μm i długości od 0,9 μm do 1,9 μm. A. xylanus jest fakultatywnym organizmem beztlenowym , który może rosnąć w kilku różnych środowiskach. Jego sukces w wielu środowiskach wynika z wielu szlaków metabolicznych, z których każdy zapewnia wysoką ATP . Jest biczowany i ruchliwy . Najlepiej rośnie przy pH 8,0-10,0, ale nie przy pH 7,0. Jest katalazy i oksydazy . Pomaga to lepiej wyjaśnić unikalną metodę metabolizmu, na której opiera się organizm.
Komórki zawierają kwas mezodiaminopimelinowy. Komórkowe kwasy tłuszczowe składają się z kwasów izorozgałęzionych i antyizorozgałęzionych oraz znacznych ilości kwasów prostołańcuchowych. Skład DNA tych szczepów mieścił się w zakresie od 36 do 38% G+C ( guanina plus cytozyna ). To w połączeniu z homologią DNA wykazało, że A. xylanus nie był spokrewniony ze szczepami reprezentatywnych gatunków rodzajów Bacillus , Clostridium i Sporolactobacillus . Biorąc pod uwagę te i jej unikalny metabolizm wraz z sekwencjonowaniem 5S rRNA (rybosomalnego RNA), bakteria jest trudna do powiązania z innymi bakteriami w jej schematach taksonomicznych, ponieważ tak mała część jej genomu pasowała do jakiejkolwiek innej bakterii.
Metabolizm
Amphibacillus xylanus dobrze rośnie w środowisku alkalicznym . Jest zdolny do trawienia ksylanu tlenowo i beztlenowo . Wydaje się, że różne środki redukujące nie mają na to wpływu. W warunkach beztlenowych bakteria jest heterofermentatorem produkującym etanol i kwas mrówkowy . Będzie wytwarzać kwas octowy , jeśli będzie utrzymywany w warunkach tlenowych. Ponieważ niektóre z jego produktów fermentacyjnych są elektrochemicznie , A. xylanus jest badany pod kątem zastosowania w samorecyklingowych ogniwach galwanicznych .
Zapobieganie uszkodzeniom oksydacyjnym
Białko AhpC działa wraz z flawoproteiną 55 kDA w celu ochrony komórki przed uszkodzeniami oksydacyjnymi . Białko działa jak układ oksydazy NADH-AhPC, a dzięki dwóm dwusiarczkowym może funkcjonować w postaci homodimeru . To właśnie ten enzym pozwala A. xylanus przetrwać w trudnych warunkach.