Bank danych dynamiki konformacyjnej
 | |
| Treść | |
|---|---|
| Opis | dynamika konformacyjna białek i supramolekularnych zespołów białkowych. |
| Kontakt | |
| Cytowanie podstawowe | PMID 21051356 |
| Data wydania | 2010 |
| Dostęp | |
| Strona internetowa | http://www.cdyn.org |
Bank danych dynamiki konformacyjnej ( CDDB ) jest bazą danych o dynamice konformacyjnej białek ciężkich i zespołów białkowych . CDDB jest użyteczna, gdy jest używana razem ze statycznymi danymi strukturalnymi, jako pomoc w badaniach funkcji białek . Jest również pomocny w identyfikacji zespołów białek, które są niezbędne do funkcjonowania komórki .
Analizę przeprowadza się za pomocą gruboziarnistych obliczeń struktur obecnych w banku danych mikroskopii elektronowej (EMDB). Ta analiza pokazuje równowagowe fluktuacje termiczne i rozkład energii odkształcenia sprężystego , co pozwala na identyfikację sztywnych i elastycznych domen białkowych. Wyniki dostarczają również informacji na temat korelacji w ruchach molekularnych , które można wykorzystać do identyfikacji regionów molekularnych, które są silnie sprzężone dynamicznie.
- ^ ab ; Kim, Do-Nyun Altschuler Josiah; Silny Campbell; McGill Gaël; Znak do kąpieli (styczeń 2011). „Bank danych dynamiki konformacyjnej: baza danych dynamiki konformacyjnej białek i supramolekularnych zespołów białkowych” . kwasy nukleinowe Res . Anglia. 39 (problem z bazą danych): D451-5. doi : 10.1093/nar/gkq1088 . PMC 3013685 . PMID 21051356 .
Linki zewnętrzne