C6orf201
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| C6orf201 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , dJ1013A10.5, chromosom 6 otwarta ramka odczytu 201, białko MGC87625 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Identyfikatory zewnętrzne | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Otwarta ramka odczytu chromosomu 6 201 , C6orf201, jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen C6orf201 . U ludzi gen ten koduje białko jądrowe , którego ekspresja zachodzi głównie w jądrach .
Gen
U ludzi gen ma długość 51 558 par zasad . Transkrypt , który wytwarza najdłuższe białko o długości 140 aminokwasów, jest tłumaczony z nieprzetworzonego mRNA , który ma sześć egzonów i ma długość 1664 nukleotydów .
Skróty
Otwarta ramka odczytu chromosomu 6 201 (C6orf201) jest również określana jako: dJ1013A10.5, MGC87625, RP5-1013A10.5 i LOC404220.
Umiejscowienie
C6orf201 znajduje się na chromosomie 6 w pozycji 6p25.2 i jest zakodowany na nici dodatniej. C6orf201 znajduje się w pobliżu genu FAM217A i genu ECI2 .
Ochrona
C6orf201 jest wysoce konserwatywny u naczelnych , umiarkowanie konserwowany u innych ssaków , a także u kilku gadów . W Mycoplasma gallinarum występuje wystarczająca konserwacja, aby sugerować, że w historii ewolucji C6orf201 mogło dojść do poziomego transferu genów . Nie ma paralogów ani zdarzeń duplikacji genów dla C6orf201.
ortologi
Domeny homologiczne
C6orf201 należy do DUF4523 (Pfam15023), funkcjonalnie niescharakteryzowanej rodziny białek występujących u ssaków .
Białko
Nazwy
białka C6orf201 to: białko MGC87625, hipotetyczne białko LOC404220, OTTHUMP00000213693 i OTTHUMP00000213725.
Ogólne właściwości/funkcje
U ludzi najdłuższy wariant białka ma długość 140 aminokwasów , masę cząsteczkową 16,2 kDa i punkt izoelektryczny 10,88. Przewiduje się, że C6orf201 będzie białkiem jądrowym .
Modyfikacja i struktura
C6orf201 ma wiele przewidywanych miejsc fosforylacji PKC i CKII u ludzi . Białko ma również sygnał lokalizacji jądrowej . C6orf201 ma konserwatywną helisę alfa i konserwowaną nić beta w białku .
Interakcje białek
C6orf201 współdziała z SRPK1 , TMEM106B i APP.
Wyrażenie
C6orf201 ulega ekspresji przede wszystkim w jądrach ludzi , a także w jądrach dorosłych myszy i szczurów . Dane z mikromacierzy GEO potwierdzają również ekspresję C6orf201 w jądrach ludzi i myszy .
Znaczenie kliniczne
Winiki wyszukiwania
Badanie toksykologiczne wykazało, że C6orf201 był jednym z 20 najbardziej rozregulowanych genów u małp , które były narażone na opary spawalnicze przez dłuższy czas. W innym badaniu zbadano ekspresję genów po zastosowaniu metylacji , przy czym C6orf201 był jednym z wielu badanych genów .