Pulpit CompTox Chemicals
 | |
| Treść | |
|---|---|
| Opis | Baza danych substancji chemicznych skierowana do nauk o środowisku i zapewniająca dostęp do ponad 875 000 związków chemicznych, właściwości, danych z testów biologicznych i powiązanych informacji. Wyszukiwania |
| Kontakt | |
| Centrum Badań | Agencja Ochrony Środowiska |
| Laboratorium |
|
| Cytowanie podstawowe | CompTox Chemistry Dashboard: źródło danych społeczności dotyczące chemii środowiskowej. |
| Dostęp | |
| Strona internetowa | |
| Pobierz URL | |
| Różnorodny | |
| Licencja | Domena publiczna |
| Częstotliwość udostępniania danych |
Co 6 miesięcy |
| Polityka kuracji | Ręcznie wyselekcjonowane |
CompTox Chemicals Dashboard to ogólnodostępna internetowa baza danych stworzona i utrzymywana przez amerykańską Agencję Ochrony Środowiska (EPA). Baza danych zapewnia dostęp do wielu rodzajów danych, w tym właściwości fizykochemicznych , losów i transportu w środowisku, narażenia, użytkowania, toksyczności in vivo i testów biologicznych in vitro . EPA i inni naukowcy wykorzystują dane i modele zawarte na pulpicie nawigacyjnym, aby pomóc zidentyfikować substancje chemiczne, które wymagają dalszych testów i ograniczyć wykorzystanie zwierząt w testach chemicznych. Tablica rozdzielcza jest również wykorzystywana do zapewniania publicznego dostępu do informacji zawartych w planach działań EPA, np. dotyczących perfluorowanych substancji alkilowanych .
Pierwotnie zatytułowana Chemistry Dashboard, pierwsza wersja została wydana w 2016 r. Najnowsza wersja bazy danych (wersja 3.0.5) zawiera ręcznie opracowane dane dla ponad 875 000 chemikaliów i zawiera najnowsze dane wygenerowane z programu EPA Toxicity Forecaster (ToxCast) program do sprawdzania przepustowości. Pulpit nawigacyjny substancji chemicznych zawiera dane z kilku poprzednich baz danych EPA w jednym pakiecie, w tym pulpit nawigacyjny ToxCast, pulpit nawigacyjny programu badań przesiewowych zaburzeń endokrynologicznych (EDSP) oraz baza danych substancji chemicznych i produktów (CPDat).
Zakres i dostęp
Baza danych CompTox Chemicals Dashboard zawiera wysokiej jakości struktury chemiczne i informacje, które zostały szczegółowo opracowane i sprawdzone pod względem jakości, co może służyć jako źródło informacji dla analityków zajmujących się identyfikacją struktur.
Dane o zagrożeniach chemicznych na pulpicie nawigacyjnym pochodzą zarówno z tradycyjnych badań laboratoryjnych na zwierzętach, jak i wysokowydajnych badań przesiewowych . Dane biologiczne z wysokowydajnych badań przesiewowych są generowane przez program ToxCast EPA, dane ToxCast w bazie danych dostarczają informacji o zastosowanych testach oraz ich sile odpowiedzi i skuteczności. Dane te znajdziesz w zakładce bioaktywność.
Dostęp do pulpitu nawigacyjnego substancji chemicznych można uzyskać za pośrednictwem interfejsu internetowego, a zawarte w nim zestawy danych można pobrać do użytku w trybie offline. Zakładka Listy może służyć do przeglądania i pobierania grup powiązanych substancji chemicznych w oparciu o ich znaczenie dla określonego tematu badawczego (takiego jak dodatki do papierosów lub substancje chemiczne wykazujące wpływ na efekty neurorozwojowe ) lub określonych punktów końcowych testu, których dotyczą.
W internetowym panelu można wyszukiwać według kategorii produktów/zastosowań, oznaczeń/genów, nazw systematycznych, synonimów, numerów CAS , DSSTOx Substance ID lub InChiKey . W zakładce Wyszukiwanie zaawansowane można wyszukiwać chemikalia na podstawie ich masy lub wzoru cząsteczkowego . Wyszukiwanie można również przeprowadzać dla grup substancji chemicznych na podstawie nazwy chemicznej CASRN, InChIKey, identyfikatora substancji DSSTOx, identyfikatora związku DSSTOx, szkieletu InChIKey, formuły MS-Ready, formuły dokładnej lub masy monoizotopowej za pomocą funkcji wyszukiwania partii.
Inne funkcje
Zautomatyzowane narzędzie do analizy przekrojowej o nazwie Generalized Read-Across (GenRA) jest zintegrowane z pulpitem nawigacyjnym substancji chemicznych. GenRA zaprojektowano tak, aby zachować uwagę ekspertów właściwą metodzie podejścia przekrojowego, ale zautomatyzować proces selekcji substancji chemicznych, aby pomóc przewidzieć toksyczność.
Dashboard ma również możliwość przeszukiwania istniejących źródeł literatury naukowej, takich jak PubMed , za pośrednictwem internetowej wersji „Abstract Sifter”, Google Scholar oraz raportów z tymczasowych wartości toksyczności recenzowanych przez EPA ( PPRTV ) i zintegrowanego systemu informacji o ryzyku EPA ( IRYS ).
QSAR w czasie rzeczywistym dla wielu właściwości fizykochemicznych i punktów końcowych toksyczności są dostępne na karcie prognoz .
Wspieranie spektrometrii mas
Pulpit nawigacyjny zapewnia obsługę spektrometrii mas , zapewniając wyszukiwanie danych chemicznych zawartych w bazie danych na podstawie masy i wzoru cząsteczkowego . Pulpit nawigacyjny został zastosowany do analizy nieukierunkowanej w poszukiwaniu „ znanych niewiadomych ”. Obsługiwana jest zarówno ukierunkowana spektrometria mas , jak i nieukierunkowana spektrometria mas. Wyszukiwania wykorzystują wyszukiwanie oparte na formach związków chemicznych „MS-Ready”. Poszczególne substabcje chemiczne są załamywane do postaci, którą można wykryć za pomocą spektrometrii mas, tak że sole są odsalane i neutralizowane, a wieloskładnikowe chemikalia są rozdzielane na ich poszczególne składniki.