Czynnik wiązania powtórzeń telomerowych 1

TERF1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, PIN2, TRBF1, TRF, TRF1, hTRF1-AS, t-TRF1, czynnik wiązania powtórzeń telomerowych 1
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS nie dotyczy
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Nie mylić z transferyną , genem mus musculus o pseudonimie Trf.

Czynnik wiążący powtórzenia telomerowe 1 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen TERF1 .

Gen

Ludzki gen TERF1 znajduje się w chromosomie 8 na 73 921 097-73 960 357 pz. Dwa transkrypty tego genu są produktami alternatywnego składania. Gen TERF1 jest również znany jako TRF, PIN2 (inhibitor proteinazy 2), TRF1, t-TRF1 i h-TRF1-AS.

Białko

Zobacz też: TERF2 § Domena homologii TERF

Struktura białka zawiera C-końcowy motyw Myb, domenę dimeryzacyjną (homologię TERF) w pobliżu jej N-końca i kwaśny N-koniec.

Dystrybucja subkomórkowa

Dystrybucja komórkowa tego białka wiążącego DNA obejmuje nukleoplazmę , chromosomy , region telomerowy, jądrowy kompleks czapeczki telomerowej , cytoplazmę, wrzeciono , jądro i jąderko oraz chromosom jądrowy.

Funkcjonować

Gen TERF 1 koduje białko specyficzne dla telomeru, które jest składnikiem kompleksu nukleoproteinowego schronyny telomerów . Białko to jest obecne w telomerach przez cały cykl komórkowy i działa jako inhibitor telomerazy , działając w cis w celu ograniczenia wydłużania końców poszczególnych chromosomów. Wiadomo, że chroni telomery ssaków przed mechanizmami DNA wykorzystywanymi do celów naprawczych i jednocześnie reguluje aktywność telomerazy. Białko czynnika wiążącego powtórzenia telomerowe 1 jest obecne w telomerach, gdzie monitorowany jest aspekt starzenia się komórek podczas typowego procesu cyklu komórkowego. Postępująca utrata telomerowych końców chromosomów jest ważnym mechanizmem określającym czas starzenia się komórek człowieka. Czynnik powtórzeń telomerów 1 (TRF1) jest białkiem, które wiąże się na końcach telomerów.

Białko ma ostateczne zastosowanie jako inhibitor telomerazy, enzymu białkowego, który pomaga w wydłużaniu chromosomów poprzez dodanie sekwencji TTAGGG na końcu chromosomów. Białko działa jako elementy cis-regulatorowe w procesie ograniczania wydłużania końców poszczególnych chromosomów, co ułatwia telomeraza i sekwencje TTAGGG. Struktura białka składa się z domeny dimeryzacji blisko jej końca aminowego, karboksylu końcowy ogon, który jest wolną grupą karboksylową, która kończy koniec łańcucha białka i kwasowy koniec aminowy, który jest wolną grupą aminową, która kończy początek białka.

Procesy biologiczne

Białko jest również aktywnie zaangażowane w procesy biologiczne, takie jak odpowiedź na lek i negatywna regulacja utrzymania telomeru poprzez proces replikacji półkonserwatywnej, podobny do cis. Ponadto, według Kaplana i Christophera, białko bierze również udział w biologicznych procesach pozytywnej regulacji polimeryzacji mikrotubuli i negatywnej kontroli procesu replikacji DNA. Białko to jest również przydatne w biologicznym procesie mitozy i pozytywnej regulacji mitozy. Pozytywnie reguluje mitotyczny cykl komórkowy. Białko kodowane przez gen TERF 1 bierze również udział w biologicznym procesie podziału komórki oraz negatywnej regulacji utrzymania telomerów, którą ułatwia enzym telomeraza.

Oprócz działania jako inhibitor enzymu telomerazy w procesie wydłużania końców chromosomów, białko to pełni jeszcze inne funkcje. Funkcje te obejmują wiązanie białka, ułatwianie aktywności homodimeryzacji białek, wiązanie DNA i ułatwianie aktywności heterodimeryzacji białek, a także wiązanie mikrotubuli. Dodatkowo białko pełni molekularną funkcję wiązania telomerowego DNA i dwuniciowego telomerowego DNA. Białko czynnika wiążącego powtórzenia telomerowe 1 jest również wykorzystywane w wiązaniu chromatyny i całej aktywności zginania DNA.

Znaczenie kliniczne

Poziomy białka TERF1 korelują z długością telomerów w raku jelita grubego Telomery chronią chromosom przed degradacją przez nukleazy i fuzję end-to-end. Postępująca utrata telomerowych końców chromosomów jest ważnym mechanizmem określającym czas starzenia się komórek człowieka. Czynnik powtórzeń telomerów 1 (TRF1) jest białkiem, które wiąże się na końcach telomerów. Aby zmierzyć stężenia TRF1 i zależności między długością telomerów, aktywnością telomerazy i poziomami TRF1 w guzie i prawidłowej błonie śluzowej jelita grubego, z próbek prawidłowych i nowotworowych pacjentów, którzy przeszli operację raka jelita grubego, przeanalizowaliśmy stężenie białka TRF1 i aktywność telomerazy zostały przeanalizowane . W rezultacie wysokie poziomy TRF1 zaobserwowano w 68,7% próbek guza, podczas gdy większość próbek prawidłowych wykazywała ujemne lub słabe stężenia TRF1. Wśród próbek guza długość telomerów była istotnie związana z poziomami białka TRF1. Podsumowując, istnieje związek między długością telomerów a obfitością białka TRF1 w próbkach guza, co oznacza, że ​​TRF1 jest ważnym czynnikiem w progresji nowotworu i być może czynnikiem diagnostycznym.

Interakcje

Wykazano, że białko kodowane przez TERF1 wchodzi w interakcje z następującymi; SALL1 (Sal-like1-Drosophila, białko.), ABL (homolog onkogenu wirusa mysiej białaczki Abelsona, białko), MAPRE2 (białko RP / EB związane z mikrotubulami, białko), ATM (zmutowana ataksja teleangiektazja, kinaza białkowa) , PINX1 (inhibitor 1 telomerazy oddziałujący z TERF1), TINF2 (czynnik jądrowy telomerazy oddziałujący z TERF1), TNKS2 (Tankyraza, enzym) i NME1 (kinaza difosforanowa nukleozydu). Podsumowując, jak wspomniano powyżej, białko czynnika 1 wiążącego powtórzenia telomerowe pełni większość swoich funkcji związanych z wiązaniem składników i regulacją procesów.

Wykazano, że TERF1 wchodzi w interakcje z:

• gen Abl ,
• zmutowana ataksja teleangiektazja ,
• MAPRE1 ,
• NME1 ,
• PINX1
• SALL1 ,
• TINF2 ,
• TNKS2 i
• TNKS .

Dalsza lektura

•    Zhong Z, Shiue L, Kaplan S, de Lange T (1992). „Czynnik ssaków, który wiąże telomerowe powtórzenia TTAGGG in vitro” . Mol. Komórka. Biol . 12 (11): 4834–43. doi : 10.1128/mcb.12.11.4834 . PMC 360416 . PMID 1406665 .
•    Chong L, van Steensel B, Broccoli D, Erdjument-Bromage H, Hanish J, Tempst P, de Lange T (1995). „Ludzkie białko telomerowe”. nauka . 270 (5242): 1663-7. Bibcode : 1995Sci...270.1663C . doi : 10.1126/science.270.5242.1663 . PMID 7502076 . S2CID 25439525 .
•    Lu KP, Hanes SD, Hunter T (1996). „Ludzka izomeraza peptydylo-prolilowa niezbędna do regulacji mitozy”. Natura . 380 (6574): 544–7. Bibcode : 1996Natur.380..544P . doi : 10.1038/380544a0 . PMID 8606777 . S2CID 4258406 .
•    Bilaud T, Koering CE, Binet-Brasselet E, Ancelin K, Pollice A, Gasser SM, Gilson E (1996). „Telobox, związany z Myb telomerowy motyw wiążący DNA występujący w białkach drożdży, roślin i ludzi” . Kwasy nukleinowe Res . 24 (7): 1294–303. doi : 10.1093/nar/24.7.1294 . PMC 145771 . PMID 8614633 .
•   Broccoli D, Chong L, Oelmann S, Fernald AA, Marziliano N, van Steensel B, Kipling D, Le Beau MM, de Lange T (1997). „Porównanie ludzkich i mysich genów kodujących białko telomerowe TRF1: lokalizacja chromosomalna, ekspresja i konserwowane domeny białkowe” . Szum. Mol. Genet . 6 (1): 69–76. doi : 10.1093/hmg/6.1.69 . PMID 9002672 .
•    Bianchi A, Smith S, Chong L, Elias P, de Lange T (1997). „TRF1 jest dimerem i wygina telomerowy DNA” . EMBO J. 16 (7): 1785–94. doi : 10.1093/emboj/16.7.1785 . PMC 1169781 . PMID 9130722 .
•    Brokuły D, Smogorzewska A, Chong L, de Lange T (1997). „Ludzkie telomery zawierają dwa różne białka związane z Myb, TRF1 i TRF2”. Nat. Genet . 17 (2): 231–5. doi : 10.1038/ng1097-231 . PMID 9326950 . S2CID 41204064 .
•   Nosaka K, Kawahara M, Masuda M, Satomi Y, Nishino H (1998). „Powiązanie kinazy difosforanowej nukleozydu nm23-H2 z ludzkimi telomerami”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 243 (2): 342–8. doi : 10.1006/bbrc.1997.8097 . PMID 9480811 .
•   Nishikawa T, Nagadoi A, Yoshimura S, Aimoto S, Nishimura Y (1998). „Struktura roztworu domeny wiążącej DNA ludzkiego białka telomerowego, hTRF1” . Struktura . 6 (8): 1057–65. doi : 10.1016/S0969-2126(98)00106-3 . PMID 9739097 .
•    Smith S, Giriat I, Schmitt A, de Lange T (1998). „Tankyraza, polimeraza poli (ADP-rybozy) w ludzkich telomerach”. nauka . 282 (5393): 1484-7. CiteSeerX 10.1.1.466.9024 . doi : 10.1126/science.282.5393.1484 . PMID 9822378 .
•    Kim SH, Kaminker P, Campisi J (1999). „TIN2, nowy regulator długości telomerów w komórkach ludzkich” . Nat. Genet . 23 (4): 405–12. doi : 10.1038/70508 . PMC 4940194 . PMID 10581025 .
•    Smogorzewska A, van Steensel B, Bianchi A, Oelmann S, Schaefer MR, Schnapp G, de Lange T (2000). „Kontrola długości telomerów człowieka przez TRF1 i TRF2” . Mol. Komórka. Biol . 20 (5): 1659–68. doi : 10.1128/MCB.20.5.1659-1668.2000 . PMC85349 . _ PMID 10669743 .
•   Wu G, Lee WH, Chen PL (2000). „NBS1 i TRF1 kolokalizują się w ciałach białaczki promielocytowej podczas późnych faz S / G2 w unieśmiertelnionych komórkach ujemnych pod względem telomerazy. Implikacja NBS1 w alternatywnym wydłużaniu telomerów” . J. Biol. chemia . 275 (39): 30618-22. doi : 10.1074/jbc.C000390200 . PMID 10913111 .
•   Chi NW, Lodish HF (2000). „Tankyraza jest substratem kinazy białkowej aktywowanej mitogenem związanym z aparatem Golgiego, który oddziałuje z IRAP w pęcherzykach GLUT4” . J. Biol. chemia . 275 (49): 38437–44. doi : 10.1074/jbc.M007635200 . PMID 10988299 .
•   Kishi S, Wulf G, Nakamura M, Lu KP (2001). „Białko telomerowe Pin2 / TRF1 indukuje wejście mitotyczne i apoptozę w komórkach z krótkimi telomerami i jest obniżone w ludzkich guzach piersi” . Onkogen . 20 (12): 1497–508. doi : 10.1038/sj.onc.1204229 . PMID 11313893 .
•   Kishi S, Zhou XZ, Ziv Y, Khoo C, Hill DE, Shiloh Y, Lu KP (2001). „Białko telomerowe Pin2 / TRF1 jako ważny cel ATM w odpowiedzi na pęknięcia dwuniciowego DNA” . J. Biol. chemia . 276 (31): 29282–91. doi : 10.1074/jbc.M011534200 . PMID 11375976 .
•   Fairall L, Chapman L, Moss H, de Lange T, Rhodes D (2001). „Struktura domeny dimeryzacji TRFH ludzkich białek telomerowych TRF1 i TRF2” . Mol. komórka . 8 (2): 351–61. doi : 10.1016/S1097-2765(01)00321-5 . PMID 11545737 .
•    Zhou XZ, Lu KP (2001). „Białko PinX1 oddziałujące z Pin2 / TRF1 jest silnym inhibitorem telomerazy” . komórka . 107 (3): 347–59. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00538-4 . PMID 11701125 . S2CID 6822193 .
•   Nishikawa T, Okamura H, Nagadoi A, König P, Rhodes D, Nishimura Y (2001). „Struktura rozwiązania telomerowego kompleksu DNA ludzkiego TRF1” . Struktura . 9 (12): 1237–51. doi : 10.1016/S0969-2126(01)00688-8 . PMID 11738049 .