Decyzja Dx-UM

DecisionDx-UM to test prognostyczny , który dokładnie określa ryzyko przerzutów związane z nowotworami czerniaka gałki ocznej. Czerniak oka jest terminem powszechnie używanym do opisania guzów błony oka , takich jak czerniak błony naczyniowej oka , czerniak naczyniówki , czerniak ciała rzęskowego i czerniak tęczówki. Test DecisionDx-UM został klinicznie zwalidowany na tych guzach błony naczyniowej oka. Narzędzie DecisionDx-UM ocenia profil ekspresji genów (GEP) podzbioru genów, które ulegają różnej ekspresji w pierwotnych komórkach nowotworowych w porównaniu z komórkami, które przeszły transformację do fenotypu przerzutowego .

Test klasyfikuje guzy jako:

Klasa 1A (niskie ryzyko przerzutów),
Klasa 1B (długoterminowe ryzyko przerzutów),
Klasa 2 (natychmiastowe, wysokie ryzyko przerzutów).

Nazywany również profilem ekspresji genów, test został bezpośrednio porównany ze wszystkimi innymi czynnikami klinicznymi i patologicznymi , takimi jak status chromosomu 3 ( monosomia 3), cytopatologia i rozmiar guza, a test DecisionDx-UM okazał się dokładniejszy niż te inne czynniki. Test DecisionDx-UM stał się standardem postępowania w większości onkologii oka w USA i jest zalecany przez American Joint Committee on Cancer (AJCC). AJCC zaleca to badanie wszystkim pacjentom z rozpoznaniem czerniaka błony naczyniowej oka, ponieważ wyniki są „istotne klinicznie”. Dokładne wyniki uzyskuje się zarówno przy użyciu biopsji aspiracyjnej cienkoigłowej (BAC), jak i utrwalonej w formalinie tkanki guza zatopionej w parafinie (FFPE). Informacje prognostyczne dostarczane przez DecisionDx-UM pomagają lekarzom i ich pacjentom w podejmowaniu zindywidualizowanych decyzji dotyczących najbardziej odpowiednich opcji nadzoru i terapii. Test DecisionDx-UM uzyskał wyłączną licencję od Washington University w St. Louis i jest dostępny wyłącznie za pośrednictwem firmy Castle Biosciences , Incorporated.

Czerniak błony naczyniowej oka

Chociaż rzadki, czerniak błony naczyniowej oka (czerniak oka) jest najczęstszą postacią raka oka i drugą najczęstszą postacią czerniaka . Guzy czerniaka błony naczyniowej pojawiają się w błonie naczyniowej oka, która obejmuje tęczówkę , ciało rzęskowe i naczyniówkę . Leczenie pierwotnego guza oka polega na terapii oszczędzającej oko ( radioterapia płytkowa lub naświetlanie wiązką protonów ) lub usunięciu oka ( wyłuszczenie ). Oba są bardzo skuteczne, a wskaźniki „wyleczeń” przekraczają 90%. Jednak, jak dobrze udokumentowano w wielu publikacjach, w tym w Collaborative Ocular Melanoma Study (COMS), u prawie 50% pacjentów czerniak prawdopodobnie dał już przerzuty do czasu rozpoznania i leczenia pierwotnego guza oka. Większość tych przerzutów jest mikroskopijna i klinicznie niewykrywalna w momencie rozpoznania guza pierwotnego. Niestety, wiele obecnych technik diagnostycznych (w tym obrazowanie i testy czynnościowe wątroby) nie są w stanie dokładnie wykryć mikroprzerzutów, dopóki guzki guza nie urosną znacznie i prawdopodobnie nie staną się oporne na leczenie.

Brak dokładnych testów prognostycznych pozwalających określić, którzy pacjenci są narażeni na ryzyko rozwoju jawnej klinicznie choroby przerzutowej, stanowi istotny problem w leczeniu poszczególnych pacjentów z czerniakiem błony naczyniowej oka. Bez dokładnych pomiarów indywidualnego ryzyka przerzutów niemożliwe jest określenie, którzy pacjenci są narażeni na wysokie ryzyko klinicznych przerzutów, co może następnie prowadzić do nadmiernego lub niedostatecznego leczenia danego pacjenta. Test DecisionDx-UM został opracowany w celu zapewnienia lepszej indywidualnej oceny ryzyka przerzutów, co pozwala na bardziej odpowiedni nadzór i planowanie leczenia.

Decyzja Test Dx-UM GEP

Odkrycie

Profil ekspresji genów mierzony przez DecisionDx-UM został odkryty w laboratorium J. Williama Harbora na Uniwersytecie Waszyngtońskim w St. Louis . Zastosowanie analizy mikromacierzy do pierwotnych nieleczonych czerniaków błony naczyniowej oka wykazało, że guzy skupiły się w dwie oddzielne grupy na podstawie ich profili ekspresji. Filtrowanie zestawu genów o różnej ekspresji doprowadziło do identyfikacji zestawu genów zdolnych do rozróżnienia guzów klasy 1 i klasy 2.

W kolejnych eksperymentach grupa dr Harbour zebrała informacje z mikromacierzy z większego podzbioru próbek guza czerniaka błony naczyniowej oka i była w stanie zidentyfikować potencjalne geny dyskryminujące do dalszej analizy. Profile ekspresji genetycznej tych rozróżniających genów zweryfikowano w nowotworach czerniaka błony naczyniowej oka za pomocą ilościowej reakcji łańcuchowej polimerazy (qPCR), a także przeprowadzono modelowanie predykcyjne w celu zidentyfikowania optymalnego zestawu genów zdolnych do dokładnego przewidywania ryzyka przerzutów i zgłaszania przypisań klas. W końcowym teście oceniono 12 genów rozróżniających i 3 geny kontrolne w celu określenia guzów klasy 1 (niskiego ryzyka) i klasy 2 (wysokiego ryzyka) i zwalidowano w wieloośrodkowym badaniu z udziałem 609 pacjentów, które obejmowało próbki BACC i FFPE.

Dokładność prognostyczna

Obecna platforma DecisionDx-UM została potwierdzona klinicznie w badaniu COOG, które obejmowało 514 pacjentów z UM leczonych w 12 ośrodkach onkologii oka w Stanach Zjednoczonych w latach 1998-2010. Raport zawiera dane pokazujące, że DecisionDx-UM ma wysoki wskaźnik sukcesu technicznego (>95%).

Kliniczny sukces techniczny

Od czasu pierwszej oferty DecisionDx-UM w grudniu 2009 r. firma Castle Biosciences otrzymała ponad 800 zamówień klinicznych do analizy z ponad 55 ośrodków onkologii oka w całych Stanach Zjednoczonych. Sukces techniczny i oznaczenie klasy osiągnięto dla 96,2% próbek. Większość niepowodzeń wynikała z niewłaściwego pobrania i/lub postępowania z biopsją . Pobieranie biopsji guza ma kluczowe znaczenie dla skutecznego zgłaszania ryzyka przerzutów Przypisanie klasy po przeprowadzeniu testu DecisionDx-UM.

DecyzjaDx-UM Zamawianie i raportowanie

Firma Castle Biosciences, Incorporated przyjmuje zlecenia serwisowe dla DecisionDx-UM wyłącznie od licencjonowanych lekarzy (najczęściej onkologów okulistycznych, okulistów lub specjalistów zajmujących się siatkówką ), którzy opiekują się pacjentami, u których zdiagnozowano czerniaka błony naczyniowej oka. Lekarze, którzy są klientami po raz pierwszy, muszą skontaktować się z Castle's w celu uzyskania informacji i założenia konta. Przesłanie próbki wymaga wypełnienia Formularza Zapotrzebowania na Decyzję Dx-UM i przesłania go faksem do firmy Castle. Próbki z BACC wymagają użycia zestawu do pobierania próbek dostarczonego przez firmę Castle, aby ustabilizować próbkę i zmniejszyć ryzyko awarii technicznej. Zestaw ten musi otrzymać lekarz zlecający przed pobraniem próbki. Personel zamku służy pomocą logistyczną w zakresie pobierania i wysyłki próbek.

Castle dostarcza lekarzowi zlecającemu raport, który sklasyfikuje guza jako klasę 1A, klasę 1B lub klasę 2. Raport będzie również opisywał statystyki związane z klasyfikacją i poda wartość dyskryminacyjną, która odzwierciedla pewność klasyfikacji. Informacje zawarte w raporcie firmy Castle określają prawdopodobieństwo przerzutów (rozprzestrzeniania się) guza, przy czym ryzyko to zostało sklasyfikowane jako niskie (klasa 1A), pośrednie (klasa 1B) lub wysokie (klasa 2).

Inne czynniki prognostyczne przerzutów UM

Czynniki histopatologiczne i techniki obrazowania

Historycznie istnieje kilka cech klinicznych i patologicznych, które były statycznie związane z przerzutami. Rozmiar guza, umiejscowienie guza, wiek pacjenta i naczyniowa korelują z początkiem przerzutów i przeżyciem pacjenta. Chociaż na podstawie tych czynników można sformułować ogólniki dotyczące całej populacji pacjentów z UM, żaden z nich, pojedynczo lub łącznie, nie wykazał dokładności predykcyjnej w odniesieniu do aktywności przerzutowej.

Techniki obrazowania stosowane do wykrywania aktywności przerzutów również mają swoje ograniczenia. Ogólnoustrojowe przerzuty są wykrywane za pomocą pozytonowej tomografii emisyjnej (PET) w czasie pierwotnej diagnozy u mniej niż 4% pacjentów z UM. Niedawno doniesiono, że obrazowanie metodą rezonansu magnetycznego (MRI) jest bardziej czułe niż PET w wykrywaniu przerzutów czerniaka naczyniówki , ale MRI wymaga masy guza większej niż 5 mm. W związku z tym obecna technologia obrazowania nie jest wystarczająco czuła w wykrywaniu mikroprzerzutów , które mogą być obecne w momencie pierwotnego rozpoznania czerniaka błony naczyniowej oka.

Czynniki genetyczne

Techniki analizy genetycznej doprowadziły do identyfikacji nieprawidłowości chromosomalnych związanych z progresją nowotworu przerzutowego w czerniaku błony naczyniowej oka. Utrata heterozygotyczności , utrata całych alleli z chromosomów, częściowa addycja i delecja chromosomów oraz polimorfizm pojedynczego nukleotydu (SNP) były związane z przerzutami czerniaka błony naczyniowej oka. W szczególności chromosomy 1, 3, 6 i 8 były szeroko badane pod kątem ich związku z krótszym czasem przeżycia i rozwojem choroby przerzutowej.

Podczas gdy aberracje genetyczne w chromosomach 1, 6 i 8 nie były w stanie niezależnie przewidzieć postępu choroby, profilowanie cytogenetyczne chromosomu 3 ujawniło ważny region genetyczny silnie powiązany z początkiem przerzutów u pacjentów z czerniakiem błony naczyniowej oka. Nieprawidłowości chromosomu 3 analizowano przy użyciu wielu technik, w tym fluorescencyjnej hybrydyzacji in situ (FISH), chromosomalnej hybrydyzacji in situ (CISH), macierzowej porównawczej hybrydyzacji genomowej (aCGH), SNP, multipleksowej amplifikacji sondy zależnej od ligacji (MLPA) i analizy mikrosatelitarnej .

Pomimo bogactwa danych, które zidentyfikowały związek mutacji chromosomu 3 z przerzutami UM, kliniczne zastosowanie tych danych nie zostało jeszcze zrealizowane. Przyczyny niepewności co do zastosowania klinicznego chromosomu 3 obejmują:

wysokie wskaźniki wyników fałszywie dodatnich (od 5 do 22%)
wysokie wskaźniki wyników fałszywie ujemnych (od 4 do 50%)
wysokie wskaźniki awaryjności technicznej (do 50%) ze względu na duże zapotrzebowanie na tkanki dla obecnych technik analitycznych
niekorzystny wpływ heterogeniczności komórek na analizę cytogenetyczną chromosomu 3 .

Ponadto, w przeciwieństwie do testu DecisionDx-UM, nie ma opublikowanych, recenzowanych badań wykazujących kliniczną walidację na niezależnej grupie pacjentów.

Castle Biosciences, Incorporated

Castle Biosciences, Incorporated to firma zajmująca się diagnostyką molekularną, która opracowuje testy diagnostyczne i prognostyczne dla rzadkich nowotworów. Misją Castle'a jest służenie osobom dotkniętym rzadkimi nowotworami poprzez oferowanie dokładnych testów prognostycznych, które dostarczają informacji do podejmowania krytycznych decyzji dotyczących indywidualnego nadzoru i schematów leczenia. Oprócz DecisionDx-UM firma Castle oferuje testy prognostyczne dla czerniaka (DecisionDx-Melanoma) i raka kolczystokomórkowego (DecisionDx-SCC). Castle ma siedzibę w Friendswood w Teksasie i prowadzi działalność w Phoenix w Arizonie .

Linki zewnętrzne