eTOX
| eTOX | |
|---|---|
| Część Inicjatywy Leków Innowacyjnych | |
 | |
| Słowa kluczowe | Odkrywanie leków , opracowywanie leków |
| Typ projektu | Wspólna Inicjatywa Technologiczna |
| Agencja finansująca |
Siódmy program ramowy Europejska Federacja Przemysłu i Stowarzyszeń Farmaceutycznych (EFPIA) |
| Cel | Opracuj strategie in silico i narzędzia programowe do przewidywania profili toksykologicznych małych cząsteczek |
| Koordynator projektu | Novartis , Bayer |
| Uczestnicy | EFPIA: AstraZeneca , Boehringer Ingelheim , Esteve , GlaxoSmithKline , Janssen Pharmaceutica , Lundbeck , Pfizer , Hoffmann-La Roche , UCB , Sanofi , Servier
Akademia: Erasmus Universitair Medisch Centrum, Fraunhofer Gesellschaft, Fundació Institut Mar d'Investigacions Mèdiques, Fundación Centro Nacional de Investigaciones Oncológicas Carlos III, European Molecular Biology Laboratory , Liverpool John Moores University , Technical University of Denmark , Universitat Politècnica de Valencia, University of Leicester , Universität Wien , VU University Amsterdam MŚP: Lhasa Limited, Inte:Ligand , Molecular Networks, Chemotargets, Lead Molecular Design, Synapse Research Management Partners |
| Budżet |
|
| Czas trwania | 2010 – 2016 |
| Strona internetowa | |
eTOX to tymczasowe konsorcjum utworzone w 2010 r. w celu udostępniania i wykorzystywania danych toksykologicznych . Jest to współpraca przedkonkurencyjna, której głównym celem jest stworzenie i dystrybucja narzędzi do przewidywania skutków ubocznych leków na podstawie eksperymentów przedklinicznych. Celem jest lepsza in silico potencjalnych zdarzeń niepożądanych oraz ograniczenie wykorzystywania zwierząt w badaniach toksykologicznych. eTOX jest finansowany przez Innovative Medicines Initiative (IMI).
Cele
Oficjalny tytuł konsorcjum brzmi: „Integracja podejść bioinformatycznych i chemoinformatycznych na rzecz rozwoju systemów eksperckich umożliwiających przewidywanie toksyczności in silico (eTOX)”. eTOX ma na celu stworzenie narzędzi in silico do przewidywania toksyczności małych cząsteczek na wczesnych etapach procesu opracowywania leków. Konsorcjum tworzy model prognostyczny w oparciu o zestaw raportów toksykologicznych sporządzonych przez firmy farmaceutyczne, które dołączyły do konsorcjum. W duchu IMI, eTOX skupia prywatne firmy produkujące dane przedkliniczne oraz partnerów akademickich, ekspertów w dziedzinie chemioinformatyki , bioinformatyki i przetwarzania języka naturalnego . Wkład w domenę publiczną algorytmów, oprogramowania i ontologii jest częścią planu działania.
Organizacja
Aby osiągnąć te cele, powołano konsorcjum zrzeszające 25 firm farmaceutycznych, firm biotechnologicznych oraz uczelnię wyższą. Projekt rozpoczął się w 2010 roku, był pierwotnie finansowany przez 5 lat przez partnerów konsorcjum i Unię Europejską . Konsorcjum skorzystało z przedłużenia ENSO i będzie je kontynuować do końca 2016 r. Całkowity szacowany budżet to 18,7 mln euro.
Wzmacniacz
eTOX współpracuje z OpenPHACTS , kolejnym konsorcjum IMI w celu ponownego wykorzystania publicznie dostępnych danych klinicznych. W 2014 roku powstało konsorcjum IMI iPiE (Intelligence-Led Assessment of Pharmaceuticals in the Environment), którego cele są podobne do eTOX, ale surowe dane pochodzą z substancji chemicznych zebranych w celu spełnienia wymogów europejskiego rozporządzenia REACH . Uzgodniono, że będzie miała miejsce ścisła współpraca w zakresie rozwoju baz danych, systemów predykcyjnych i kwestii własności intelektualnej.
Wyniki i rozpowszechnianie
Projekt eTox jest obecnie realizowany i ma się zakończyć w grudniu 2016 r. Prace wewnętrzne powoli stają się widoczne na zewnątrz: od sierpnia 2014 r. 3046 raportów z 4291 badań na zwierzętach zostało ręcznie opracowanych i przechowywanych w bazie danych. Przetwarzane są dwa tysiące kolejnych, zbudowano i zweryfikowano siedemdziesiąt cztery modele, w większości oparte na danych publicznych. Konsorcjum rozpoczęło rozpowszechnianie informacji i opublikowano artykuł przeglądowy na temat projektu.
Lista publikacji naukowych (w tym artykułów i referatów) jest dostępna na ogólnodostępnej stronie internetowej eTOX .
Zewnętrzny biuletyn [ stały martwy link ] jest wydawany co 3 miesiące z głównymi postępami w projekcie, od listopada 2011 r.
Przyszłość
Amerykańska Agencja ds. Żywności i Leków zamierza poprosić o przesyłanie drogą elektroniczną nieprzetworzonych danych z badań na zwierzętach przy użyciu Standardu wymiany danych nieklinicznych w przyszłych składach wniosków o pozwolenie na nowe leki i leki biologiczne. Jest to powszechnie postrzegane jako potencjalna zmiana zasad gry w dziedzinie toksykologii, w której wymiana danych i eksploracja dużych zbiorów danych nie jest normą. Mogłoby to pozwolić na automatyczny import do bazy danych takiej jak eTOX.