Emarawirus mozaiki figowej
|
|
| Emaravirus mozaiki figowej | |
|---|---|
| Objawy mozaiki figowej na liściach figowych | |
| Klasyfikacja wirusów | |
| (nierankingowe): | Wirus |
| królestwo : | Rybowiria |
| Królestwo: | Orthornawirusy |
| Gromada: | Negarnaviricota |
| Klasa: | Ellioviricetes |
| Zamówienie: | Bunyavirale |
| Rodzina: | Fimoviridae |
| Rodzaj: | Emarawirus |
| Gatunek: |
Emarawirus mozaiki figowej
|
| Synonimy | |
|
|
Wirus mozaiki figowej (FMV) jest segmentowanym, jednoniciowym wirusem RNA o ujemnej czułości , który jest określany jako czynnik sprawczy choroby mozaiki figowej (FMD) u roślin figowca, Ficus carica . Należy do rodzaju Emaravirus i rzędu Bunyavirales i jest przenoszony głównie przez szpeciele Aceria ficus . FMV może powodować szereg objawów o różnym nasileniu, w tym chlorozę liści , deformację, mozaikę lub przebarwienia, a także przedwczesne opadanie owoców.
Historia
Choroba mozaiki figowej (FMD) została po raz pierwszy opisana i podejrzewana o pochodzenie wirusowe w 1933 roku przez Irę J. Condita i WTHorne'a. W 2009 roku Jeewan Jyot Walia, Nida M. Salem i Bryce W. Falk ustalili, że jest to spowodowane wirusem. Od tego czasu chorobę i związanego z nią wirusa zaobserwowano w Grecji , Włoszech , Hiszpanii , Turcji , Syrii , Tunezji , Algierii , Jordanii , Nowej Zelandii , Chinach , Wielkiej Brytanii , Puerto Rico , Australii i Stanach Zjednoczonych .
Klasyfikacja
FMV został umieszczony w rodzaju Emaravirus , który zawiera inne jednoniciowe, ujemnie sensowne, segmentowane wirusy roślinne. Wszystkie emarawirusy zawierają od czterech do sześciu genomu . Są również powszechne w sposobie przenoszenia, który odbywa się za pośrednictwem różnych gatunków szpecieli na podstawie nieznanego mechanizmu, a także mechanicznych sposobów przenoszenia. Oprócz FMV, rodzaj Emaravirus obejmuje emarawirus związany z pierścieniową plamistością jarzębiny (EMARaV), emarawirus różyczki (RRV), emarawirus plamistości liści maliny (RLBV) i inne gatunki.
Struktura genomu
Genom FMV składa się z segmentowanego (wieloczęściowego) ujemnego, jednoniciowego RNA . Od dawna uważano, że genom składa się z czterech segmentów, ale ostatnie odkrycia potwierdziły istnienie sześciu segmentów genomu RNA. Każdy segment ma jedną otwartą ramkę odczytu (ORF). Pierwszy segment, FMV vcRNA 1 (7093 nt), jest wspólny dla wszystkich wirusów z rodzaju Emaravirus i koduje 264 kDa zależną od RNA polimerazę RNA wirusa (RdRp), która ma aktywność endonukleazy w pobliżu N-końca . Drugi segment, vcRNA2, (2252 nt) koduje przypuszczalną glikoproteinę 73 kDa . FMV vcRNA3 (1490 nt) koduje nukleokapsydu (N) o masie cząsteczkowej 35 kDa. FMV vcRNA4 (1472 nt) koduje białko 40,5 kDa o wciąż nieznanej funkcji. Dwa ostatnio odkryte segmenty, RNA5 i RNA6, w przeciwieństwie do pozostałych czterech segmentów, nie są wysoce konserwatywne w obrębie rodzaju. Być może dzieje się tak dlatego, że są skrócone lub wadliwe, ale funkcje białek, które kodują, są nadal nieokreślone.
Ruch między komórkami i do komórek (FMV-p4)
Podobnie jak wszystkie wirusy roślinne, FMV koduje białko ruchu (MP), aby umożliwić mu przemieszczanie się między komórkami, zwykle poprzez zwiększenie limitów wykluczenia wielkości (SEL) plazmodesmy, aby umożliwić przejście wirusa. MP FMV to najprawdopodobniej p4, wniosek, który jest poparty jego lokalizacją w błonie plazmatycznej, ale nie został jeszcze ostatecznie pokazany.
Replikacja genomu poprzez wyrywanie czapeczek
FMV vcRNA 1 koduje białko polimerazy RNA zależnej od RNA (RdRp), które ma funkcję endonukleazy na swoim N-końcu i jest upakowane w wirionie. Gdy wirion wniknie do komórki, RdRp wiąże się z mRNA gospodarza i wykorzystuje aktywność endonukleazy do rozszczepienia metylowanej czapeczki 5' do wykorzystania jako starter do syntezy mRNA i jako sposób na przejęcie maszynerii translacyjnej gospodarza
DMB i LFP
Zakażenie FMV skutkuje powstaniem w cytozolu zakażonych komórek miąższu odrębnych ciałek lub cząstek o podwójnej błonie, zwanych DMB lub DMP, o średnicy 90-200 nm. Te ciała związane z podwójną błoną są otoczone włóknistą matrycą i znajdują się tylko w liściach wykazujących objawy mozaiki na poziomie makro, nigdy w niezainfekowanej tkance użytej jako kontrola. Niektóre odmiany wykazywały również długie, pogięte , przypominające pręciki cząsteczki wirusopodobne (LFP) w tkankach wykazujących oznaki martwicy. Nie są one również widoczne w niezakażonych tkankach kontrolnych. Żaden typ nie ma określonej funkcji.
Objawy
FMV powoduje różnorodne objawy, z których niektóre mogą mieć poważne szkody w rolnictwie, takie jak zmniejszona wydajność owoców. Objawy obejmują pojawienie się wzoru mozaiki liści, defoliację, zmniejszenie plonu owoców, żyłkowanie, pierścieniowe plamistości, zniekształcenie i chlorozę liści oraz żółte plamki na owocach.
Niewiadome i przyszłe badania
Nadal istnieje wiele aspektów struktury molekularnej i funkcji tego wirusa, które są nieznane. Białko kodowane przez czwarty segment genomu wirusa, RNA4, wciąż ma nieznaną funkcję. Ponadto dokładne mechanizmy molekularne replikacji FMV i ogólnie replikacji emarawirusa nadal nie zostały potwierdzone. Obecne badania mają również na celu poznanie natury DMB/DMP, ponieważ trudno je wyizolować z zainfekowanych roślin.