H. Efsun Arda

H. Efsun Arda
Urodzić się	Hatice Efsun Arda
Narodowość	turecki
Alma Mater	Boğaziçi University (licencjat) University of Massachusetts Medical School (doktorat)
Kariera naukowa
Pola	Biologia rozwojowa biologia systemów
Instytucje	Narodowy Instytut Raka
Praca dyplomowa	C. Elegans Metabolic Gene Regulatory Networks (2010)
Doradca doktorski	Marian Walhout
Wpływy	Seung K. Kim

Hatice Efsun Arda jest turecką biologiem rozwojowym i systemowym, badającym linie komórkowe , które dały początek ludzkiej trzustce przy użyciu sekwencjonowania pojedynczych komórek . Jest głównym badaczem Stadtman i szefem grupy ds. genomiki rozwojowej w National Cancer Institute .

Wczesne życie i edukacja

Hatice Efsun Arda spędzała czas ze swoją matką, pielęgniarką , w szpitalu iw laboratoriach klinicznych. Ta wczesna ekspozycja zachęciła ją do studiowania biologii i medycyny. Arda ukończyła licencjat z biologii molekularnej i genetyki na Uniwersytecie Boğaziçi .

Arda uzyskał stopień doktora. w biologii systemowej z University of Massachusetts Medical School . Podczas swojego szkolenia doktoranckiego w laboratorium Marian Walhout studiowała sieci regulacyjne genów , które dotyczą metabolizmu organizmu modelowego, C. elegans . Odkryła zestaw genów metabolicznych , które są wrażliwe na zawartość składników odżywczych w diecie bakterii C. elegans .

Badania podoktoranckie

Zainteresowana sieciami regulacyjnymi genów i biologią rozwoju , Arda dołączyła do laboratorium Seung K. Kim na Uniwersytecie Stanforda, by odbyć staż podoktorancki. Jako JDRF opracowała metody sortowania komórek w celu oczyszczenia pierwotnych komórek trzustki od dzieci i dorosłych oraz wykorzystała sekwencjonowanie RNA do ujawnienia setek genów, które są różnie regulowane w ciągu pierwszych 10 lat życia człowieka , z których kilka jest powiązanych badaniami asocjacyjnymi z ryzykiem cukrzycy . Aby zrozumieć, w jaki sposób programy ekspresji genów specyficznych dla komórek trzustki są kontrolowane na poziomie genomowym, połączyła następnie sortowanie komórek z technikami genomowymi , takimi jak ATAC-Seq , aby nakreślić regulatorowy krajobraz chromatyny typów ludzkich komórek trzustkowych. Ta praca ujawniła tysiące domniemanych regionów wzmacniających, które wyjaśniają specyficzną dla typu komórek ekspresję genów w ludzkiej trzustce.

W 2016 roku badania Ardy wykazały, że komórki beta w ludzkiej trzustce kontynuują dojrzewanie po urodzeniu. Arda i współpracownicy zbadali ekspresję genów i profile chromatyny komórek trzustki izolowanych od dzieci i dorosłych i odkryli specyficzne programy ekspresji genów, które włączają się po 10 roku życia. Badanie było pierwszym, które wykazało te różnice na poziomie globalnym. zespół odkrył nowe czynniki potencjalnie pośredniczące w tym procesie.

Aby zbadać regulację genomu, Arda kontynuowała badania elementów DNA, które kontrolują specyfikację, tożsamość i funkcję komórek trzustki. Arda i współautorzy stworzyli atlas elementów genomowych specyficznych dla głównych typów komórek ludzkiej trzustki. Zidentyfikowała unikalne regiony w naszych genomach, które kontrolują ekspresję genów specyficzną dla typu komórki w ludzkich komórkach trzustkowych. Okazało się również, że regiony te zawierają więcej wariantów ryzyka choroby związanych z cukrzycą lub rakiem trzustki niż inne części ludzkiego genomu .

Kariera i badania

Arda dołączyła do National Institutes of Health w 2017 roku jako główny badacz Stadtman w laboratorium biologii receptorów i ekspresji genów w National Cancer Institute . Jest szefem grupy ds. genomiki rozwojowej.

Laboratorium Ardy ma na celu nakreślenie sieci regulacyjnych genów, które kontrolują rozwój, ekspansję i funkcję ludzkich komórek trzustki. Jej grupa badawcza łączy podejścia genomiczne z wykorzystaniem pierwotnych komórek ludzkich , komórek macierzystych i technologii edycji genomu w celu tworzenia map genomów regulatorowych regulujących powstawanie i wzrost linii ludzkich komórek trzustki . Arda charakteryzuje linie komórkowe, które dały początek ludzkiej trzustce za pomocą sekwencjonowania pojedynczych komórek .

Linki zewnętrzne

• H. Efsun Arda indeksowane przez Google Scholar
• Publikacje H. Efsuna Ardy indeksowane w bazie bibliograficznej Scopus . (wymagana subskrypcja)

Ten artykuł zawiera materiały należące do domeny publicznej ze stron internetowych lub dokumentów National Institutes of Health .