Halorhodospira neutriphila
| Halorhodospira neutriphila | |
|---|---|
| Klasyfikacja naukowa | |
| Domena: | |
| Gromada: | |
| Klasa: | |
| Zamówienie: | |
| Rodzina: | |
| Rodzaj: | |
| Gatunek: |
H. neutriphila
|
| Nazwa dwumianowa | |
|
Halorhodospira neutriphila Hirschler-Réa i in. 2003
|
|
| Typ szczep | |
| DSM 15116, JCM 17835, SG 3301 | |
| Synonimy | |
|
Halorhodospira neutrophila |
|
Halorhodospira neutriphila jest bakterią z rodzaju Halorhodospira , która została wyizolowana z mikrobiologicznej maty pochodzącej z soli morskiej z Delty Rodanu we Francji . Mata mikrobiologiczna tworzy się na powierzchni osadu i ma grubość od 10 do 20 mm, pod cienką warstwą (2–3 cm) skorupy gipsowej. Mata składa się z czerwonej warstwy purpurowych szczepów bakterii poniżej zielonej warstwy sinic, przeplatanych kuleczkami siarki i czasami pokrytych osadami halitu. Te drobnoustroje tworzące maty żyją w beztlenowych mułach i osadach i tworzą matę bentosową w środowisku laguny hipersalinowej, gdzie zasolenie wody waha się od 240-320 ‰ całkowitego zasolenia. H. neutriphila wyizolowano z czerwonej warstwy warstwy drobnoustrojów i stwierdzono, że jest wyjątkowo halofilny i dobrze przystosowany do wytrzymywania ekstremalnych warunków zasolonych w zmodyfikowanym środowisku morskim. Typowy szczep zidentyfikowano jako szczep SG 3301T.
Cechy fenotypowe
H. neutriphila to fototroficzna, purpurowa bakteria o morfologii spiryloidalnej i ruchoma z polarnymi wiciami. Ten gatunek bakterii jest Gram-ujemny, a rozmiary komórek wahają się (szerokość na długość) od 1-1,2 μm x 2-5 μm. H. neutriphila ma fotosyntetyczny system błon wewnątrzkomórkowych, który składa się ze stosów blaszkowatych ze spirilloksantyną i BChl a jako głównymi karotenoidami.
Optymalny wzrost
Optymalny wzrost H. neutriphila występuje przy obecności 9-12% (wag./obj.) NaCl w hodowli i pożywce uzupełnionej 1 mM Na2S.9H20 , 2 mM octanem, 1 mM bursztynianem i 0,05% ekstraktem drożdżowym. Ich metabolizm jest najbardziej wydajny, gdy donorami elektronów są siarczki i octany, a źródłem węgla jest CO 2 . Maksymalny wzrost występuje w zakresie pH 6,8 - 7 w temperaturze 30-35 °C przy natężeniu światła 5000 luksów z cyklem od światła do ciemności 16h:8h. Zarejestrowano szybkość wzrostu dla szczepu typowego jako 0,034 h^-1, a replikacja komórek zachodzi przez rozszczepienie binarne.
Charakterystyka genetyczna
Skład zasad DNA dla szczepu typowego wynosi 74,5% molowych G+C. Gen 16S rDNA, o częściowej długości genomu 1357 par zasad, wykorzystano do określenia pokrewieństwa szczepu H. neutriphila z innymi szczepami, w tym SG 3304, z którym wykazuje 100% homologii. Szczep typu był blisko spokrewniony z gatunkiem Rhodovibrio sodomensis z 98,8% homologią i Halorhodospira halophila z 94,6% homologią. Stwierdzono, że szczepy SG 3301T i SG 3304 są genetycznie, morfologicznie i fizjologicznie wystarczająco różne od innych gatunków z rodzaju Halorhodospira zostać sklasyfikowany jako nowy gatunek; nazwano je Halorhodospira neutriphila sp. listopad
- Bibliografia _ _ _ _ LPSN .
- Bibliografia zewnętrzne _ _ Linki _ www.uniprot.org .
- ^ a b c d e f g hi j k l m n Hirschler - Réa, A; Matheron, R; Riffaud, C; Moune, S; Eatock, C; Herbert, RA; Willison, JC; Caumette, P (styczeń 2003). „Izolacja i charakterystyka spirilloidalnych fioletowych bakterii fototroficznych tworzących czerwone warstwy w matach mikrobiologicznych śródziemnomorskich saltern: opis Halorhodospira neutriphila sp. nov. I poprawka rodzaju Halorhodospira” . International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology . 53 (część 1): 153–63. doi : 10.1099/ijs.0.02226-0 . PMID 12656167 .
-
Bibliografia
_ Garrity, George M (19 stycznia 2017). Parkera, Charlesa Thomasa; Garrity, George M (red.). „Streszczenie taksonomiczne dla gatunku”. NamesforLife, LLC. doi : 10.1601/tx.2175 .
{{ cite journal }}: Cite journal wymaga|journal=( pomoc ) - ^ „Szczegóły: DSM-15116” . www.dsmz.de .
- Bibliografia _ i in. (2018). „Krajowe Centrum Informacji Biotechnologicznej” . NCBI .
Linki zewnętrzne