Holin CidA/LrgA
Rodzina CidA/LrgA Holin (CidA/LrgA Holin) ( TC# 1.E.14 ) to grupa białek nazwana na cześć CidA ( TC# 1.E.14.1.2 ) i LrgA ( TC# 1.E.14.1) .1 ) Staphylococcus aureus . CidA i LrgA są homologicznymi białkami holinowymi i antyholinowymi, z których każde ma 4 domniemane segmenty transbłonowe (TMS). Członkowie rodziny CidA / LrgA holin obejmują również domniemanych eksporterów mysiej hydrolazy z szerokiej gamy bakterii Gram-dodatnich i Gram-ujemnych, a także archeonów . Większość białek z rodziny holin CidA/LrgA różni się wielkością od 100 do 160 reszt aminoacylowych (aas) długości, chociaż kilka jest większych.
Funkcjonować
Zaproponowano, że CidA i CidB (odpowiednio 23% i 32% identycznych z LrgA i LrgB) biorą udział w zaprogramowanej śmierci komórki w procesie analogicznym do apoptozy u eukariontów. Wiadomo, że białka te regulują i wpływają na biofilmu poprzez uwalnianie DNA z lizowanych komórek, co przyczynia się do tworzenia matrycy biofilmu. Uważa się, że CidA, białko o długości 131 aminokwasów z 4 przypuszczalnymi TMS, jest holiną, która eksportuje autolizynę CidB, podczas gdy LrgA może być anty-holiną, białkiem, które wiąże i hamuje aktywność holiny. Jeśli jest to ogólny mechanizm zaprogramowanej śmierci komórki, wyjaśniałoby to ich niemal wszechobecność w świecie prokariotycznym.
Wyrażenie
Operon cidABC jest aktywowany przez CidR w obecności kwasu octowego. Zarówno CidAB, jak i LrgAB wpływają na tworzenie biofilmu, stres oksydacyjny, przeżycie fazy stacjonarnej i tolerancję antybiotyków w sposób wzajemny, a ich geny są regulowane przez dwuskładnikowy system regulacyjny LytSR. Zastosowano techniki mikroprzepływowe do czasowego i przestrzennego śledzenia ekspresji genów podczas tworzenia biofilmu , ujawniając, że zarówno cidA , jak i lrgA ulegają ekspresji głównie we wnętrzu struktur wieżowych w biofilmach, regulowanych przez dostępność tlenu. Analogiczne białka mogą być powiązane z kompetencjami u mutantów S. .
Zobacz też
Dalsza lektura
- Brunskill, EW; Bayles, KW (1996). „Identyfikacja genów regulowanych przez LytSR ze Staphylococcus aureus” . Journal of Bacteriology . 178 (19): 5810–5812. doi : 10.1128/jb.178.19.5810-5812.1996 . PMC 178427 . PMID 8824633 .
- Chen, Yun; Gozzi, Kevin; Jan, Kieł; Chai, Yunrong (2015). „Kwas octowy działa jako lotny sygnał stymulujący tworzenie biofilmu bakteryjnego” . mBio . 6 (3): e00392. doi : 10.1128/mBio.00392-15 . PMC 4462622 . PMID 26060272 .
- Desvaux, Mickaël; Chan, Arszad; Beatson, Scott A.; Scott-Tucker, Anthony; Henderson, Ian R. (2005). „Systemy wydzielania białek w Fusobacterium nucleatum: identyfikacja genomowa piliacji typu 4 i kompletnych szlaków typu V przynosi nowy wgląd w mechanizmy patogenezy” . Biochimica et Biophysica Acta (BBA) - Biomembrany . 1713 (2): 92–112. doi : 10.1016/j.bbamem.2005.05.002 . PMID 15993836 .
- Fischer, A.; Kambara, K.; Meyer, H.; Stenz, L.; Bonetti, EJ; Girard, M.; Lalk, M.; François, P.; Schrenzel, J. (2014). „GdpS przyczynia się do tworzenia biofilmu Staphylococcus aureus poprzez regulację uwalniania eDNA”. Międzynarodowy Dziennik Mikrobiologii Medycznej . 304 (3–4): 284–299. doi : 10.1016/j.ijmm.2013.10.010 . PMID 24275081 .
- Patton, Toni G.; Ryż, Kelly C.; Foster, Mary K.; Bayles, Kenneth W. (2005). „Gen Staphylococcus aureus cidC koduje oksydazę pirogronianową, która wpływa na metabolizm octanu i śmierć komórek w fazie stacjonarnej”. Mikrobiologia Molekularna . 56 (6): 1664-1674. doi : 10.1111/j.1365-2958.2005.04653.x . PMID 15916614 . S2CID 34897582 .
- Saier, Milton H.; Reddy, Bhaskara L. (2015). „Holiny u bakterii, eukariontów i archeonów: wielofunkcyjne ksenologie o potencjalnych zastosowaniach biotechnologicznych i biomedycznych” . Journal of Bacteriology . 197 (1): 7–17. doi : 10.1128/JB.02046-14 . PMC 4288690 . PMID 25157079 .
- Tran, Tramwaj Anh T.; Uderzony, Douglas K.; Młody, Ry (2005). „Domeny peryplazmatyczne definiują interakcje Holin-antyholin w hamowaniu lizy T4” . Journal of Bacteriology . 187 (19): 6631–6640. doi : 10.1128/JB.187.19.6631-6640.2005 . PMC 1251592 . PMID 16166524 .
Od tej edycji w tym artykule wykorzystano treść z „1.E.14 The CidA/LrgA Holin (CidA/LrgA Holin) Family” , która jest licencjonowana w sposób umożliwiający ponowne wykorzystanie w ramach licencji Creative Commons Attribution-ShareAlike 3.0 Unported License , ale nie w ramach GFDL . Należy przestrzegać wszystkich odpowiednich warunków.