Józef DeRisi

Józef DeRisi
Joseph DeRisi 2021.jpg
Narodowość amerykański
Alma Mater Uniwersytet Stanforda , Uniwersytet Kalifornijski w Santa Cruz
Znany z ViroChip, praca nad identyfikacją wirusa SARS , ekspresja genów w Plasmodium falciparum
Kariera naukowa
Pola Biologia
Instytucje Uniwersytet Kalifornijski, Instytut Medyczny Howarda Hughesa w San Francisco
Praca dyplomowa   Analiza ekspresji genów całego genomu w pączkujących drożdżach Saccharomyces cerevisiae . (1999)
Doradca doktorski Patricka O. Browna

Joseph Lyman DeRisi jest amerykańskim biochemikiem specjalizującym się w biologii molekularnej , parazytologii , genomice , wirusologii i biologii obliczeniowej .

Wczesne życie i edukacja

DeRisi wychował się w Carmichael w Kalifornii , gdzie ukończył Liceum Del Campo . W 1992 roku uzyskał tytuł licencjata z biochemii i biologii molekularnej na Uniwersytecie Kalifornijskim w Santa Cruz .

DeRisi uzyskał stopień doktora. Doktorat z biochemii uzyskał na Uniwersytecie Stanforda w 1999 roku. Pracując w laboratorium Patricka O. Browna , opracował metody produkcji i wykorzystania mikromacierzy DNA w biologii molekularnej, a jego pracą magisterską była analiza ekspresji całego genomu pączkujących drożdży S. cerevisiae . Po ukończeniu studiów DeRisi przyjął stanowisko Sandler Fellow na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco .

Kariera

Joseph DeRisi jest współprzewodniczącym Chan Zuckerberg Biohub i przewodniczącym Wydziału Biochemii i Biofizyki na Uniwersytecie Kalifornijskim w San Francisco (UCSF) ze wspólną nominacją w California Institute for Quantitative Biosciences (QB3). Jest byłym Instytutu Medycznego Howarda Hughesa (HHMI).

Najbardziej znane osiągnięcia DeRisi to wydrukowanie pierwszej macierzy ekspresji całego genomu , przeprowadzenie pierwszej szerokiej analizy zróżnicowanej ekspresji genów w komórkach nowotworowych, profilowanie ekspresji genów w całym cyklu życia pierwotniaka wywołującego malarię Plasmodium falciparum , odkrycie przez niego wirusa SARS oraz pionierskie odkrywanie wirusów przy użyciu macierzy hybrydyzacji genów i technologii sekwencjonowania DNA.

DeRisi intensywnie wykorzystuje mikromacierze w swojej pracy oraz zaprojektował i zbudował zarówno sprzęt, jak i oprogramowanie dla mikromacierzy. Jest zwolennikiem otwartego dostępu do technologii mikromacierzy [ potrzebne źródło ] i utrzymuje stronę internetową z oprogramowaniem i protokołami do operacji na mikromacierzach. [ potrzebne źródło ] Jest także zwolennikiem publikowania w otwartym dostępie , [ potrzebne źródło ] i ma publikacje w czasopismach Public Library of Science .

DeRisi zidentyfikował wirusy wywołujące przypuszczalne choroby u ludzi (rak, SARS , inne infekcje dróg oddechowych, paranowotworowe zapalenie mózgu itp.) oraz u zwierząt, od papug i nimf po pszczoły miodne i boa dusiciele. On i jego partner badawczy, Don Ganem , zidentyfikowali pasożyta, Nosema ceranae , który wydaje się być odpowiedzialny za rozpad kolonii pszczół miodnych. Odkrył również związek wirusów z pewnymi podzbiorami ludzkiego raka.

Być może najbardziej istotne dla współczesnego globalnego zdrowia, w oparciu o obszerną charakterystykę patogenu wywołującego malarię , Plasmodium falciparum , grupa DeRisi opracowała bardzo obiecujące leki kandydujące na malarię.

W 2004 roku DeRisi został stypendystą MacArthura (nagroda „Genius”), w 2008 roku otrzymał 14. doroczną nagrodę Heinza w dziedzinie technologii, gospodarki i zatrudnienia, w 2013 roku został wybrany na członka Kalifornijskiej Akademii Nauk i do Academy of the American Society of Microbiology, aw 2014 roku otrzymał nagrodę im. Johna J. Carty'ego za Postęp Nauki od Narodowej Akademii Nauk . W 2015 roku został wybrany do American Academy of Arts and Sciences , a w 2016 roku został wybrany do Narodowa Akademia Nauk i Narodowa Akademia Medyczna .

Był zaangażowany w rozwój ViroChip, który służy do szybkiej identyfikacji wirusów w płynach ustrojowych. Został użyty do zidentyfikowania zespołu ostrej ostrej niewydolności oddechowej w 2003 roku. Był również zaangażowany w rozwój platformy internetowej o nazwie IDseq, wspieranej przez Chan Zuckerberg Initiative i Chan Zuckerberg Biohub, która służy do identyfikacji wirusów na podstawie sekwencjonowania metagenomicznego dane. W 2018 roku w ramach tej pracy DeRisi i współpracownicy zidentyfikowali lek nitroksolinę jako związek, który można wykorzystać w miarę możliwości pełzakobójczy przeciwko Balamuthia mandrillaris , który powoduje ziarniniakowe pełzakowe zapalenie mózgu (GAE), śmiertelną chorobę, w 2021 roku mężczyzna, który nie zareagował na zalecaną terapię lekową, wyzdrowiał po dodaniu nitroksoliny do reżimu.

W 2020 roku, podczas pandemii COVID-19 , DeRisi kierował zespołem, który w ciągu ośmiu dni zamienił pustą przestrzeń laboratoryjną sąsiadującą z CZ Biohub w placówkę testową na COVID-19 z certyfikatem CLIA. CLIAhub stał się jednym z wiodących w kraju ośrodków testowych na COVID-19, przetwarzając tysiące testów dziennie i stając się wzorem dla narodu.

Jednocześnie DeRisi stał się aktywnym orędownikiem opracowania krajowego systemu nadzoru COVID-19 w celu identyfikacji i monitorowania mutacji wirusa COVID-19.

Nagrody

Linki zewnętrzne

Pobrano z „ https://en.wikipedia.org/w/index.php?title=Joseph_DeRisi&oldid=1139403625 ”