Johannes Krause

Johannes Krause, 2019

Johannes Krause (urodzony 17 lipca 1980 w Leinefelde ) to niemiecki biochemik, który koncentruje się na badaniach historycznych chorób zakaźnych i ewolucji człowieka. Od 2010 roku jest profesorem archeologii i paleogenetyki na Uniwersytecie w Tybindze . W 2014 roku Krause został współzałożycielem nowego Instytutu Nauki o Historii Człowieka im. Maxa Plancka w Jenie .

Kariera

W latach 2000-2005 Krause studiował biochemię w Lipsku oraz na University College Cork w Irlandii. W 2005 roku uzyskał dyplom z publikacją The mitochondrial genome of the woolly mammoth w Max Planck Institute for Evolutionary Anthropology , a następnie rozprawę doktorską w 2008 roku pod kierunkiem Svante Pääbo pt . badania genetyczne neandertalczyków i niedźwiedzi jaskiniowych .

W 2010 roku za pracę doktorską otrzymał nagrodę Tübingen Award for Early Prehistory and Quaternary Ecology . W tym samym roku, za współautorstwo artykułu Science A draft sequence and pre analysis of the Neandertal genome, otrzymał Newcomb Cleveland Prize of the American Association for the Advancement of Science , nagrodę za najlepszy artykuł roku. W październiku 2010 został adiunktem w Instytucie Archeologii Naukowej w Tybindze. Od tego czasu kieruje w Instytucie grupą roboczą ds. paleogenetyki.

Latem 2014 roku ogłoszono, że Instytut Ekonomiczny im. Maxa Plancka w Jenie otrzyma inny mandat. Wraz z Russellem Grayem Krause został mianowany współdyrektorem nowego Instytutu Historii i Nauk im. Maxa Plancka od 1 lutego 2014 r. Jednocześnie Krause pozostaje honorowym profesorem na Uniwersytecie w Tybindze.

Badania

Krause koncentruje się na analizie genetycznej starożytnego DNA przy użyciu sekwencjonowania DNA. Jego zainteresowania badawcze obejmują ewolucję człowieka oraz historyczne patogeny i epidemie.

W 2010 roku Krause i inni z powodzeniem zrekonstruowali mitochondrialne DNA denisowianina z 30 miligramów sproszkowanego materiału z kości palca. Umożliwiło mu to wykazanie, że Denisowianie reprezentowali niezależną gałąź rodzaju Homo , która oddzieliła się od linii neandertalskiej 640 000 lat temu. Przyczynił się również do badań nad dziedzictwem genetycznym neandertalczyków, które wykazały, że neandertalczycy i współcześni ludzie mają ten sam „gen językowy” ( FOXP2 ), co sugeruje, że neandertalczycy również mieli zdolność mówienia.

Krause był członkiem międzynarodowego zespołu badawczego, który w 2011 roku zrekonstruował genom bakterii Yersinia pestis z próbek DNA pobranych z XIV-wiecznego cmentarza zarazy East Smithfield w Londynie, ustanawiając ostateczny dowód na to, że średniowieczna epidemia czarnej śmierci była spowodowana przez Y. pestis .

W czerwcu 2013 roku grupa Krause we współpracy z Instytutem Technologii w Lozannie opublikowała badania wykazujące, że bakteria trądu nie zmieniła się genetycznie od średniowiecza, a wszystkie bakterie trądu można na całym świecie przypisać wspólnemu przodkowi datowanemu na 4000 pne.

W 2017 roku zespół kierowany przez Krausego przeprowadził pierwsze wiarygodne sekwencjonowanie genomów zmumifikowanych osobników ze starożytnego Egiptu. Jednak, według własnego uznania zespołu w rękopisie, próbki mogły nie być reprezentatywne dla większości Egipcjan. Inne odkrycia haplotypów i PCR DNA wskazują na pochodzenie z Afryki Subsaharyjskiej we współczesnych populacjach egipskich. Ich badanie dotyczyło 90 osobników i ujawniło, że „bardzo przypominały one starożytne i współczesne populacje Bliskiego Wschodu, zwłaszcza w Lewancie, i nie miały prawie żadnego DNA z Afryki Subsaharyjskiej. Co więcej, genetyka mumii pozostała niezwykle spójna nawet po różne mocarstwa - w tym Nubijczycy, Grecy i Rzymianie - podbiły imperium.

W 2019 roku Krause i inni opublikowali analizę rozprzestrzeniania się Y. pestis podczas epidemii czarnej śmierci, która rozpoczęła się w Europie w 1347 roku. Wśród ustaleń stwierdzono, że XIV-wieczny szczep z regionu Samara w Rosji jest przodkiem czarnej śmierci. . Inne genomy z całej Europy w tym okresie były identyczne, co sugeruje szybkość rozprzestrzeniania się zarazy. Później co najmniej dwa odrębne klady wydaje się, że rozwinęły się w Europie. Jeden jest związany z wybuchami chorób w Niemczech i Szwajcarii w XV – XVII wieku naszej ery. Inny dotyczy epidemii w Londynie w XVII wieku i Marsylii w XVIII wieku. Sugeruje to, że choroba mogła pozostawać w stanie uśpienia w więcej niż jednym rezerwuarze choroby w Europie. Występowanie dżumy w Londynie i Marsylii może być również związane z podróżami morskimi. Nowoczesne szczepy Y. pestis , takie jak te znalezione na Madagaskarze w 2017 r., są bardzo podobne do rodowego szczepu czarnej śmierci. Poprawa higieny ludzi, zmniejszenie populacji czarnych szczurów i pcheł oraz zmniejszenie kontaktu ludzi z nimi prawdopodobnie przyczyniły się bardziej do ograniczenia przenoszenia choroby niż zmiany genetyczne.

Publikacje

  1. ^ Michael Bolus: Laudatio: Dr. Johannes Krause, Preisträger des Zwölften Tübinger Förderpreises Für ältere Ungeschichte und Quartärökologie zarchiwizował 2013-10-21 w Wayback Machine (PDF; 155 KB), In: Mitteiilungen Der Gesellschaft , Band 19, , S. 7–10.
  2. ^ Szary, Russell. „Russella Graya” . Instytut Antropologii Ewolucyjnej Maxa Plancka . Źródło 3 grudnia 2021 r .
  3. Wikimedia Commons znajdują się multimedia związane z Johannesem Krause . Instytut Antropologii Ewolucyjnej Maxa Plancka . Źródło 13 lipca 2022 r .
  4. ^ Ghosh, Pallab (22.12.2010). „Starożytni ludzie, nazwani„ Denisowianami ”, skrzyżowali się z nami” . wiadomości BBC . Źródło 2014-07-17 .
  5. ^   J. Krause, Q. Fu, JM Good, B. Viola, MV Shunkov, AP Derevianko, S. Pääbo (2010). „Pełny genom mitochondrialnego DNA nieznanego hominina z południowej Syberii” . Natura . 464 (7290): 894–897. Bibcode : 2010Natur.464..894K . doi : 10.1038/natura08976 . PMID 20336068 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  6. ^    J. Krause, C. Lalueza-Fox, L. Orlando, W. Enard, RE Green, HA Burbano, J.-J. Hublin, C. Hänni, J. Fortea, M. de la Rasilla, J. Bertranpetit, A. Rosas, S. Pääbo (2007). „Pochodny wariant FOXP2 współczesnego człowieka został udostępniony neandertalczykom” . Bieżąca biologia . 17 (21): 1908–1912. doi : 10.1016/j.cub.2007.10.008 . hdl : 11858/00-001M-0000-000F-FED3-1 . PMID 17949978 . S2CID 9518208 . {{ cytuj dziennik }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  7. ^ M. Inman (18 października 2007). „Neandertalczycy mieli ten sam„ gen języka ”, co współcześni ludzie” . Wiadomości National Geographic.
  8. ^ Kirsten I. Bos , Verena J. Schuenemann, G. Brian Golding, Hernán A. Burbano, Nicholas Waglechner, Brian K. Coombes, Joseph B. McPhee, Sharon N. DeWitte, Matthias Meyer, Sarah Schmedes, James Wood, David JD Zarabiaj, D. Ann Śledź, Peter Bauer, Hendrik N. Poinar , Johannes Krause (2011). „Projekt genomu Yersinia pestis od ofiar czarnej śmierci” . Natura . 478 (7370): 506–510. Bibcode : 2011Natur.478..506B . doi : 10.1038/natura10549    . PMC 3690193 . PMID 21993626 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  9. Bibliografia    Linki zewnętrzne . „Ukierunkowane wzbogacenie starożytnych patogenów dających plazmid pPCP1 Yersinia pestis od ofiar czarnej śmierci” . PNAS . 108 (38): E746 – E752. Bibcode : 2011PNAS..108E.746S . doi : 10.1073/pnas.1105107108 . PMC 3179067 . PMID 21876176 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  10. ^ VJ Schuenemann P. Singh TA Mendum B. Krause-Kyora G. Jäger KI Bos A. Herbig C. Economou A. Benjak P. Busso A. Nebel , H. Wu, GR Stewart, GM Taylor, P. Bauer, OY-C. Lee, HHT Wu, DE Minnikin, GS Besra, K. Tucker, S. Roffey, SO Sow, ST Cole, K. Nieselt, J. Krause (2013). „Porównanie całego genomu średniowiecznych i współczesnych Mycobacterium leprae”. nauka . 341 (6142): 179–183. Bibcode : 2013Sci...341..179S . doi : 10.1126/science.1238286 . PMID    23765279 . S2CID 22760148 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  11. ^   Wade, L. (2017). „Nareszcie DNA egipskiej mumii” . nauka . 356 (6341): 894. Bibcode : 2017Sci...356..894W . doi : 10.1126/science.356.6341.894 . PMID 28572344 .
  12. Bibliografia    Linki zewnętrzne Haak, S. Schiffels i J. Krause (2017). „Genomy mumii starożytnego Egiptu sugerują wzrost pochodzenia z Afryki Subsaharyjskiej w okresach post-rzymskich” . Komunikacja natury . 15694 : 15694. Bibcode : 2017NatCo...815694S . doi : 10.1038/ncomms15694 . PMC 5459999 . PMID 28556824 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
  13. ^ ab Vernimmen, Tim (30 października 2019). „Profilowanie sprawców dawnych plag” . Znany Magazyn . Przeglądy roczne. doi : 10.1146/poznawalny-102919-1 . Źródło 13 lipca 2022 r .
  14. ^ Spyrou Maria A .; Keller, Marcel; Tuchbatowa, Rezeda I.; Scheib, Christiana L.; Nelson, Elżbieta A.; Andrades Valtueña, Aida; Neumann, Gunnar U.; Walker, Don; Alterauge, Amelie; Carty, Niamh; Cessford, Craig; Fetz, Hermann; Gourvennec, Michał; Hartle, Robert; Henderson, Michael; von Heyking, Kristin; Inskip, Sarah A.; Kacki, Sacha; Klucz, Feliks M.; Knox, Elżbieta L.; Później chrześcijanin; Maheshwari-Aplin, Priszita; Peters, Joris; Robb, John E.; Schreiber, Jürgen; Kivisild, Toomas; Castex, Dominik; Losch, Sandra; Harbeck, Michaela; Herbig, Aleksander; Bos, Kirsten I.; Krause, Johannes (2 października 2019).     „Filogeografia drugiej pandemii dżumy ujawniona poprzez analizę historycznych genomów Yersinia pestis” . Komunikacja natury . 10 (1): 4470. Bibcode : 2019NatCo..10.4470S . doi : 10.1038/s41467-019-12154-0 . ISSN 2041-1723 . PMC 6775055 . PMID 31578321 .

Linki zewnętrzne

Wideo