Gen kodujący białko u gatunku Homo sapiens
KDM4C
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, GASC1, JHDM3C, JMJD2C, TDRD14C, bA146B14.1, demetylaza lizyny 4C
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Specyficzna dla lizyny demetylaza 4C jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen KDM4C .
Funkcjonować
Ten gen jest członkiem rodziny domen Jumonji 2 (JMJD2) i koduje białko z jedną domeną JmjC, jedną domeną JmjN, dwoma palcami cynkowymi typu PHD i dwiema domenami Tudora . To białko jądrowe należy do hydroksylaz zależnych od alfa-ketoglutaranu . Działa jako demetylaza specyficzna dla trimetylacji , przekształcając określone trimetylowane reszty histonowe w postać dimetylowaną. Aberracje chromosomowe i zwiększona ekspresja transkrypcyjna tego genu są związane z rakiem płaskonabłonkowym przełyku. Wyraźny spadek KDM4C stwierdzono podczas różnicowania serca mysich embrionalnych komórek macierzystych.
Organizmy modelowe
W badaniu funkcji KDM4C wykorzystano organizmy modelowe . Linia myszy z warunkowym nokautem , zwana Kdm4c tm1a (KOMP) Wtsi, została wygenerowana w ramach programu International Knockout Mouse Consortium — wysokowydajnego projektu mutagenezy mającego na celu generowanie i dystrybucję zwierzęcych modeli chorób do zainteresowanych naukowców.
Samce i samice zwierząt poddano standaryzowanemu badaniu fenotypowemu w celu określenia skutków delecji. Przeprowadzono dwadzieścia pięć testów na zmutowanych myszach i zaobserwowano dwie znaczące nieprawidłowości. Homozygotyczne zmutowane samce miały obniżony poziom hematokrytu i hemoglobiny , podczas gdy zwierzęta obojga płci wykazywały wzrost wielkości gruczołów łojowych .
Dalsza lektura
Yang ZQ, Imoto I, Fukuda Y, Pimkhaokham A, Shimada Y, Imamura M, Sugano S, Nakamura Y, Inazawa J (wrzesień 2000). „Identyfikacja nowego genu, GASC1, w amplikonie 9p23-24 często wykrywanym w liniach komórkowych raka przełyku”. Badania nad rakiem . 60 (17): 4735–9. PMID 10987278 .
Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (styczeń 2006 ). „Zróżnicowanie modulacji transkrypcji: identyfikacja i charakterystyka na dużą skalę przypuszczalnych alternatywnych promotorów ludzkich genów” . Badania genomu . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 PMID 16344560 .
Whetstine JR, Nottke A, Lan F, Huarte M, Smolikov S, Chen Z, Spooner E, Li E, Zhang G, Colaiacovo M, Shi Y (maj 2006). „Odwrócenie trimetylacji lizyny histonów przez rodzinę demetylaz histonów JMJD2” . komórka . 125 (3): 467–81. doi : 10.1016/j.cell.2006.03.028 PMID 16603238 . S2CID 14461740 .
Cloos PA, Christensen J, Agger K, Maiolica A, Rappsilber J, Antal T, Hansen KH, Helin K (lipiec 2006). „Przypuszczalny onkogen GASC1 demetyluje tri- i dimetylowaną lizynę 9 na histonie H3”. Natura . 442 (7100): 307–11. Bibcode : 2006Natur.442..307C . doi : 10.1038/natura04837 . PMID 16732293 . S2CID 2874903 .
Wissmann M, Yin N, Müller JM, Greschik H, Fodor BD, Jenuwein T, Vogler C, Schneider R, Günther T, Buettner R, Metzger E, Schüle R (marzec 2007). „Kooperacyjna demetylacja przez JMJD2C i LSD1 promuje ekspresję genów zależną od receptora androgenowego”. Biologia komórki przyrody . 9 (3): 347–53. doi : 10.1038/ncb1546 . PMID 17277772 . S2CID 26006234 .
Katoh Y, Katoh M (sierpień 2007). „Integratomika porównawcza JMJD2A, JMJD2B i JMJD2C: preferencyjna ekspresja JMJD2C w niezróżnicowanych komórkach ES” . Międzynarodowy Dziennik Medycyny Molekularnej . 20 (2): 269–73. doi : 10.3892/ijmm.20.2.269 PMID 17611647 .
Erhu Zhao, Jane Ding,.....Hongjuan Cui, Han-Fei Ding (2016). „KDM4C i ATF4 współpracują w transkrypcyjnej kontroli metabolizmu aminokwasów” . Raporty komórkowe . 14 (3): 506–519. doi : 10.1016/j.celrep.2015.12.053 . PMC 4731315 PMID 26774480 . {{ cite journal }} : CS1 maint: używa parametru autorów ( link )
Działalność
Rozporządzenie
Klasyfikacja
Kinetyka
typy
