amoniak-liaza L-seryny
L -serynowo-amoniak-liaza | |||||||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
identyfikatory ludzkie | |||||||||
nr WE | 4.3.1.17 | ||||||||
Bazy danych | |||||||||
IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
PRYM | profil | ||||||||
Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
|
Enzym amoniakoliaza L -seryny (EC 4.3.1.17) katalizuje reakcję chemiczną
-
L -seryna = pirogronian + NH 3 (całkowita reakcja)
- (1a) L -seryna = 2-aminoprop-2-enian + H2O ( (
- 1b) 2-aminoprop-2-enian = 2-iminopropanian (spontaniczny)
- 1c) 2-iminopropanian + H 2 O = pirogronian + NH 3 (samorzutny)
Enzym ten należy do rodziny liaz , w szczególności liaz amoniakalnych, które rozszczepiają wiązania węgiel-azot. Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to amonia-liaza L -seryny (tworząca pirogronian) . Inne powszechnie używane nazwy to deaminaza serynowa , dehydrataza L-hydroksyaminokwasu , deaminaza L -serynowa , dehydrataza L -serynowa i hydroliaza L -serynowa (deaminująca) . Enzym ten uczestniczy w glicynie , serynie metabolizm treoniny i cysteiny . Wykorzystuje jeden kofaktor , fosforan pirydoksalu .
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 roku rozwiązano 4 struktury dla tej klasy enzymów o kodach dostępu PDB 1P5J , 1PWE , 1PWH i 2IQQ .
- Ramos F, Wiame JM (1982). „Występowanie katabolicznej deaminazy L -seryny ( L -treoniny) w Saccharomyces cerevisiae ” . Eur. J. Biochem . 123 (3): 571–6. doi : 10.1111/j.1432-1033.1982.tb06570.x . PMID 7042346 .
- Simon D, Hoshino J, Kroger H (1973). „ L -serynowa z wątroby szczura. Oczyszczanie i niektóre właściwości”. Biochim. Biofiza. Akta . 321 (1): 361–8. doi : 10.1016/0005-2744(73)90091-0 . PMID 4750769 .
- Suda M, Nakagawa H (1971). „ L -seryny (wątroba szczura)”. Metody Enzymol . 17B : 346–351. doi : 10.1016/0076-6879(71)17060-7 .
- Sagers RD, Carter JE (1971). „ L -seryny ( Clostridium acidiurica )”. Metody Enzymol . 17B : 351–356. doi : 10.1016/0076-6879(71)17061-9 .
- Robinson WG, Labow R (1971). „ L -seryny ( Escherichia coli )”. Metody Enzymol . 17B : 356–360. doi : 10.1016/0076-6879(71)17062-0 .