LMO2
Dostępne konstrukcje
WPB Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory , RBTN2, RBTNL1, RHOM2, TTG2, tylko domena LIM 2,
identyfikatory zewnętrzne
LMO-2
Wikidane
Tylko domena LIM 2 ( podobna do rombotyny 1 ), znana również jako LMO2 , RBTNL1 , RBTN2 , RHOM2 , LIM Domain Only Protein 2 , TTG2 i T-Cell Translocation Protein 2 , jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen LMO2 .
Funkcjonować
LMO2 koduje bogate w cysteinę białko z dwiema domenami LIM , które jest wymagane do erytropoezy woreczka żółtkowego . Białko LMO2 odgrywa centralną i kluczową rolę w układu krwiotwórczego i jest wysoce konserwatywne.
Znaczenie kliniczne
Nieprawidłowa ekspresja LMO2 jest istotną cechą ostrej białaczki limfoblastycznej z komórek T z wieloma opisanymi mechanizmami aktywacji. Miejsce startu transkrypcji LMO2 znajduje się około 25 kb w dół od translokacji komórek T 11p13 (11p13 ttc), gdzie występuje pewna liczba translokacji specyficznych dla ostrej białaczki limfoblastycznej komórek T. Górny niekodujący element DNA jest również miejscem powtarzających się mutacji w ostrej białaczce limfoblastycznej komórek T , prowadząc do rekrutacji czynnika transkrypcyjnego MYB i znaczące wzbogacenie H3K27ac , a tym samym tworzenie nieprawidłowego wzmacniacza, który zwiększa ekspresję LMO2 Ponadto, nawracające i nabyte somatycznie mutacje intronu 1 LMO2 prowadzą do jego nadekspresji zarówno w ostrej białaczce limfoblastycznej z limfocytów T dorosłych, jak iu dzieci . Mutacje te wprowadzają nowe miejsca wiązania czynników transkrypcyjnych dla MYB, ETS1 i RUNX1 , umożliwiając tworzenie nieprawidłowego promotora, który kieruje ekspresją LMO2 .
Interakcje
Wykazano, że LMO2 wchodzi w interakcje z:
Dalsza lektura
Royer-Pokora B, Loos U, Ludwig WD (październik 1991). „TTG-2, nowy gen kodujący białko bogate w cysteinę z motywem LIM, ulega nadekspresji w ostrej białaczce T-komórkowej z t (11;14) (p13; q11)” . Onkogen . 6 (10): 1887–1893. PMID 1923511 .
Boehm T, Foroni L, Kaneko Y, Perutz MF, Rabbitts TH (maj 1991). „Rombotin rodziny bogatych w cysteinę onkogenów domeny LIM: różni członkowie są zaangażowani w translokacje komórek T do ludzkich chromosomów 11p15 i 11p13” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 88 (10): 4367–4371. doi : 10.1073/pnas.88.10.4367 PMC51660 . _ Identyfikator PMID 2034676 .
Boehm T, Spillantini MG, Sofroniew MV, Surani MA, Rabbitts TH (maj 1991). „Regulowana rozwojowo i tkankowo specyficzna ekspresja mRNA kodujących dwie alternatywne formy rombotyny onkogenu domeny LIM: dowód na ekspresję grasicy”. Onkogen . 6 (5): 695–703. PMID 2052354 .
Dong WF, Xu Y, Hu QL, Munroe D, Minowada J, Housman DE, Minden MD (listopad 1995). „Charakterystyka molekularna punktu przerwania translokacji chromosomu t (11;14) (p13; q11) z linii komórkowej KOPT-K1”. białaczka . 9 (11): 1812–1817. PMID 7475267 .
Osada H, Grutz G, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (październik 1995). „Związek erytroidalnych czynników transkrypcyjnych: kompleksy z udziałem białka LIM RBTN2 i białka palca cynkowego GATA1” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 92 (21): 9585–9589. doi : 10.1073/pnas.92.21.9585 PMC40846 . _ PMID 7568177 .
Sánchez-García I, Axelson H, Rabbitts TH (kwiecień 1995). „Różnorodność funkcjonalna białek LIM: domeny aktywacji końca aminowego w białkach onkogennych RBTN1 i RBTN2”. Onkogen . 10 (7): 1301–1306. PMID 7731680 .
Wadman I, Li J, Bash RO, Forster A, Osada H, Rabbitts TH, Baer R (październik 1994). „Specyficzne powiązanie in vivo między białkami bHLH i LIM zaangażowanymi w białaczkę z ludzkich komórek T” . Dziennik EMBO . 13 (20): 4831–4839. doi : 10.1002/j.1460-2075.1994.tb06809.x . PMC 395422 PMID 7957052 .
Valge-Archer VE, Osada H, Warren AJ, Forster A, Li J, Baer R, Rabbitts TH (sierpień 1994). „Białko LIM RBTN2 i podstawowe białko helisa-pętla-helisa TAL1 są obecne w kompleksie w komórkach erytroidalnych” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 91 (18): 8617–8621. doi : 10.1073/pnas.91.18.8617 PMC44657 . _ PMID 8078932 .
Wilkinson DA, Neale GA, Mao S, Naeve CW, Goorha RM (styczeń 1997). „Elf-2, czynnik transkrypcyjny wiążący rombotynę-2: odkrycie i potencjalna rola w białaczce z komórek T” . białaczka . 11 (1): 86–96. doi : 10.1038/sj.leu.2400516 PMID 9001422 .
Mao S, Neale GA, Goorha RM (kwiecień 1997). „Rhombotin-2 onkogenu komórek T oddziałuje z białkiem wiążącym siatkówczaka 2” . Onkogen . 14 (13): 1531–1539. doi : 10.1038/sj.onc.1200988 PMID 9129143 .
Osada H, Grutz GG, Axelson H, Forster A, Rabbitts TH (kwiecień 1997). „Lmo2-tylko białko LIM tworzy kompleks białkowy z erytroidalnym czynnikiem transkrypcyjnym GATA-1” . białaczka . 11 (Dodatek 3): 307–312. PMID 9209374 .
Wadman IA, Osada H, Grütz GG, Agulnick AD, Westphal H, Forster A, Rabbitts TH (czerwiec 1997). „Białko LMO2 tylko LIM jest cząsteczką mostkową składającą się z erytroidalnego kompleksu wiążącego DNA, który obejmuje białka TAL1, E47, GATA-1 i Ldb1 / NLI” . Dziennik EMBO . 16 (11): 3145–3157. doi : 10.1093/emboj/16.11.3145 . PMC 1169933 PMID 9214632 .
Visvader JE, Mao X, Fujiwara Y, Hahm K, Orkin SH (grudzień 1997). „Białko Ldb1 wiążące domenę LIM i jego partner LMO2 działają jako negatywne regulatory różnicowania erytroidów” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 94 (25): 13707–13712. doi : 10.1073/pnas.94.25.13707 PMC28370 . _ PMID 9391090 .
Jurata LW, Pfaff SL, Gill GN (luty 1998). „Jądrowy interaktor domeny LIM NLI pośredniczy w homo- i heterodimeryzacji czynników transkrypcyjnych domeny LIM” . Journal of Biological Chemistry . 273 (6): 3152–3157. doi : 10.1074/jbc.273.6.3152 PMID 9452425 .
Kenny DA, Jurata LW, Saga Y, Gill GN (wrzesień 1998). „Identyfikacja i charakterystyka LMO4, genu LMO o nowym wzorze ekspresji podczas embriogenezy” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (19): 11257–11262. doi : 10.1073/pnas.95.19.11257 PMC 21629 PMID 9736723 .
Ono Y, Fukuhara N, Yoshie O (grudzień 1998). „Tylko białka TAL1 i LIM synergistycznie indukują ekspresję dehydrogenazy retinaldehydu 2 w ostrej białaczce limfoblastycznej komórek T, działając jako kofaktory dla GATA3” . Biologia molekularna i komórkowa . 18 (12): 6939–6950. doi : 10.1128/MCB.18.12.6939 . PMC 109277 PMID 9819382 .
Bach I, Rodriguez-Esteban C, Carriere C, Bhushan A, Krones A, Rose DW i in. (sierpień 1999). „RLIM hamuje aktywność funkcjonalną czynników transkrypcyjnych homeodomeny LIM poprzez rekrutację kompleksu deacetylazy histonowej”. Genetyka przyrody . 22 (4): 394–399. doi : 10.1038/11970 . PMID 10431247 . S2CID 22326394 .
Vitelli L, Condorelli G, Lulli V, Hoang T, Luchetti L, Croce CM, Peschle C (lipiec 2000). „Pentamerowy kompleks transkrypcyjny, w tym białko tal-1 i retinoblastoma, obniża ekspresję c-kit w normalnych erytroblastach” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (14): 5330–5342. doi : 10.1128/MCB.20.14.5330-5342.2000 . PMC85982 . _ PMID 10866689 .
Davenport J, Neale GA, Goorha R (listopad 2000). „Identyfikacja genów potencjalnie zaangażowanych w leukemogenezę indukowaną przez LMO2” . białaczka . 14 (11): 1986–1996. doi : 10.1038/sj.leu.2401913 PMID 11069036 .
Suma EY, Peng B, Yu X, Chen J, Byrne J, Lindeman GJ, Visvader JE (marzec 2002). „Białko domeny LIM LMO4 oddziałuje z kofaktorem CtIP i supresorem guza BRCA1 i hamuje aktywność BRCA1” . Journal of Biological Chemistry . 277 (10): 7849–7856. doi : 10.1074/jbc.M110603200 PMID 11751867 .
Linki zewnętrzne
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P25791 PDBe-KB .
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P25801 PDBe-KB .
