Afadin

AFDN
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, AF6, MLL-AF6, MLLT4, białaczka szpikowa/limfoidalna lub białaczka pochodzenia mieszanego; translokowany do, 4, afadyna, czynnik tworzenia połączeń przylegających,
zewnętrzne identyfikatory l-afadyny
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Afadyna jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen AFDN .

Funkcjonować

Afadyna jest celem Ras (patrz HRAS; MIM 190020), który reguluje adhezję komórka-komórka poniżej aktywacji Ras. Jest połączony z MLL (MIM 159555) w białaczkach spowodowanych przez translokacje t(6;11) (Taya i in., 1998). [dostarczone przez OMIM]

Interakcje

Wykazano, że Afadin wchodzi w interakcje z:

• gen BCR ,
• EPHB3 ,
• receptor F11 ,
• HRAS i
• LMO2 ,
• PZRL1 ,
• PVRL3 ,
• profilina 1 ,
• RAP1A ,
• RAP1GAP ,
• SORBS1 ,
• SSX2IP ,
• Białko ścisłego połączenia 1 i
• USP9X .

Dalsza lektura

•     Takai Y, Nakanishi H (styczeń 2003). „Nektyna i afadyna: nowi organizatorzy połączeń międzykomórkowych”. Journal of Cell Science . 116 (część 1): 17–27. CiteSeerX 10.1.1.321.6596 . doi : 10.1242/jcs.00167 . PMID 12456712 . S2CID 6465469 .
•    Saha V, Lillington DM, Shelling AN, Chaplin T, Yaspo ML, Ganesan TS, Young BD (listopad 1995). „Gen AF6 na paśmie chromosomu 6q27 odwzorowuje dystalnie do minimalnego regionu delecji w nabłonkowym raku jajnika”. Geny, chromosomy i rak . 14 (3): 220–2. doi : 10.1002/gcc.2870140311 . PMID 8589040 . S2CID 23752846 .
•   Bonaldo MF, Lennon G, Soares MB (wrzesień 1996). „Normalizacja i odejmowanie: dwa podejścia ułatwiające odkrywanie genów” . Badania genomu . 6 (9): 791–806. doi : 10.1101/gr.6.9.791 . PMID 8889548 .
•    Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Obaishi H, Wada M, Nishioka H, ​​Itoh M, Mizoguchi A, Aoki T, Fujimoto T, Matsuda Y, Tsukita S, Takai Y (październik 1997). „Afadin: nowe białko wiążące filamenty aktynowe z jedną domeną PDZ zlokalizowaną na kadherynowym połączeniu przylegających komórek” . Journal of Cell Biology . 139 (2): 517–28. doi : 10.1083/jcb.139.2.517 . PMC 2139800 . PMID 9334353 .
•   Joh T, Yamamoto K, Kagami Y, Kakuda H, Sato T, Yamamoto T, Takahashi T, Ueda R, Kaibuchi K, Seto M (październik 1997). „Chimeryczne produkty MLL z białkiem cytoplazmatycznym wiążącym Ras AF6 zaangażowanym w białaczkę t (6;11) (q27; q23) lokalizują się w jądrze” . Onkogen . 15 (14): 1681–7. doi : 10.1038/sj.onc.1201332 . PMID 9349501 .
•   Saito S, Matsushima M, Shirahama S, Minaguchi T, Kanamori Y, Minami M, Nakamura Y (kwiecień 1998). „Pełne polimorfizmy struktury genomowej DNA i alternatywne składanie ludzkiego genu AF-6” . Badania DNA . 5 (2): 115–20. doi : 10.1093/dnares/5.2.115 . PMID 9679199 .
•    Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (sierpień 1998). „Interakcja, w której pośredniczy domena PDZ, receptora kinazy tyrozynowej EphB3 związanego z Eph i białka AF6 wiążącego ras zależy od aktywności kinazy receptora” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 95 (17): 9779–84. Bibcode : 1998PNAS...95.9779H . doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552 .
•    Taya S, Yamamoto T, Kano K, Kawano Y, Iwamatsu A, Tsuchiya T, Tanaka K, Kanai-Azuma M, Wood SA, Mattick JS, Kaibuchi K (sierpień 1998). „Cel Ras AF-6 jest substratem enzymu deubikwitynującego fam” . Journal of Cell Biology . 142 (4): 1053–62. doi : 10.1083/jcb.142.4.1053 . PMC 2132865 . PMID 9722616 .
•    Mandai K, Nakanishi H, Satoh A, Takahashi K, Satoh K, Nishioka H, ​​Mizoguchi A, Takai Y (marzec 1999). „Ponsin / SH3P12: białko wiążące l-afadynę i winkulinę zlokalizowane na połączeniach przylegających komórka-komórka i komórka-macierz” . Journal of Cell Biology . 144 (5): 1001-17. doi : 10.1083/jcb.144.5.1001 . PMC 2148189 . PMID 10085297 .
•   Linnemann T, Geyer M, Jaitner BK, Block C, Kalbitzer HR, Wittinghofer A, Herrmann C (maj 1999). „Charakterystyka termodynamiczna i kinetyczna interakcji między domeną wiążącą Ras AF6 a członkami podrodziny Ras” . Journal of Biological Chemistry . 274 (19): 13556–62. doi : 10.1074/jbc.274.19.13556 . PMID 10224125 .
•    Takahashi K, Nakanishi H, Miyahara M, Mandai K, Satoh K, Satoh A, Nishioka H, ​​Aoki J, Nomoto A, Mizoguchi A, Takai Y (maj 1999). „Nektyna / PRR: podobna do immunoglobuliny cząsteczka adhezyjna komórek rekrutowana do połączeń przylegających na bazie kadheryny poprzez interakcję z Afadyną, białkiem zawierającym domenę PDZ” . Journal of Cell Biology . 145 (3): 539–49. doi : 10.1083/jcb.145.3.539 . PMC 2185068 . PMID 10225955 .
•   Yamamoto T, Harada N, Kawano Y, Taya S, Kaibuchi K (maj 1999). „Interakcja in vivo AF-6 z aktywowanym Ras i ZO-1”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 259 (1): 103–7. doi : 10.1006/bbrc.1999.0731 . PMID 10334923 .
•   Minaguchi T, Matsushima M, Saito S, Kanamori Y, Shirahama S, Okamoto S, Minami M, Taketani Y, Nakamura Y (kwiecień 1999). „Pełna sekwencja DNA i charakterystyka regionu bogatego w VNTR o wielkości 330 kb na chromosomie 6q27, który jest powszechnie usuwany w raku jajnika” . Badania DNA . 6 (2): 131–6. doi : 10.1093/dnares/6.2.131 . PMID 10382971 .
•   Quilliam LA, Castro AF, Rogers-Graham KS, Martin CB, Der CJ, Bi C (sierpień 1999). „M-Ras / R-Ras3, transformujące białko ras regulowane przez białko aktywujące GTPazę Sos1, GRF1 i p120 Ras, oddziałuje z przypuszczalnym efektorem Ras AF6” . Journal of Biological Chemistry . 274 (34): 23850-7. doi : 10.1074/jbc.274.34.23850 . PMID 10446149 .
•   Kawabe H, Hata Y, Takeuchi M, Ide N, Mizoguchi A, Takai Y (październik 1999). „nArgBP2, nowy neuronowy członek rodziny ponsyny / ArgBP2 / wineksyny, który oddziałuje z białkiem związanym z synapsą 90 / białkiem związanym z gęstością postsynaptyczną 95 (SAPAP)” . Journal of Biological Chemistry . 274 (43): 30914–8. doi : 10.1074/jbc.274.43.30914 . PMID 10521485 .
•   Shao H, Kadono-Okuda K, Finlin BS, Andres DA (listopad 1999). „Charakterystyka biochemiczna GTPaz Rit i Rin związanych z Ras”. Archiwa Biochemii i Biofizyki . 371 (2): 207–19. doi : 10.1006/abbi.1999.1448 . PMID 10545207 .
•    Asakura T, Nakanishi H, Sakisaka T, Takahashi K, Mandai K, Nishimura M, Sasaki T, Takai Y (październik 1999). „Podobne i zróżnicowane zachowanie między układami nektyna-afadyna-ponsyna i kadheryna-katenina podczas tworzenia i przerywania spolaryzowanego połączenia w komórkach nabłonka” . Geny do komórek . 4 (10): 573–81. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x . PMID 10583506 . S2CID 24023429 .
•   Miyahara M, Nakanishi H, Takahashi K, Satoh-Horikawa K, Tachibana K, Takai Y (styczeń 2000). „Interakcja nektyny z afadyną jest niezbędna do jej skupiania się w miejscach kontaktu komórka-komórka, ale nie do jej dimeryzacji cis lub interakcji trans” . Journal of Biological Chemistry . 275 (1): 613–8. doi : 10.1074/jbc.275.1.613 . PMID 10617658 .
•    Bouchard MJ, Dong Y, McDermott BM, Lam DH, Brown KR, Shelanski M, Bellvé AR, Racaniello VR (kwiecień 2000). „Wady morfologii jądra i cytoszkieletu oraz lokalizacji mitochondriów w plemnikach myszy pozbawionych nektyny-2, składnika połączeń przylegających komórka-komórka” . Biologia molekularna i komórkowa . 20 (8): 2865–73. doi : 10.1128/MCB.20.8.2865-2873.2000 . PMC85510 . _ PMID 10733589 .