EPHB3
Dostępne konstrukcje
WPB
Wyszukiwanie ortologów:
Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
, ETK2, HEK2, TYRO6, EPH receptor B3, EK2
Identyfikatory zewnętrzne
Wikidane
Receptor 3 efryny typu B jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen EPHB3 .
Funkcjonować
Receptory efryny i ich ligandy, efryny, pośredniczą w wielu procesach rozwojowych, szczególnie w układzie nerwowym. W oparciu o ich strukturę i relacje sekwencyjne, efryny dzielą się na klasę efryny-A (EFNA), która jest zakotwiczona w błonie za pomocą wiązania glikozylofosfatydyloinozytolu, oraz klasę efryny-B (EFNB), która jest białkami przezbłonowymi. Rodzina receptorów Eph jest podzielona na 2 grupy w oparciu o podobieństwo ich sekwencji domen zewnątrzkomórkowych i ich powinowactwa do wiązania ligandów efryny-A i efryny-B. Receptory efryny stanowią największą podgrupę rodziny receptorowych kinaz tyrozynowych (RTK). Białko kodowane przez ten gen jest receptorem dla członków rodziny efryny-B.
Interakcje
Wykazano, że EPHB3 oddziałuje z aktywatorem białka p21 MLLT4 i RAS 1 .
Dalsza lektura
Flanagan JG, Vanderhaeghen P (1998). „Receptory efryny i Eph w rozwoju neuronów” (PDF) . rok Wielebny Neurosci . 21 : 309–45. doi : 10.1146/annurev.neuro.21.1.309 . PMID 9530499 . S2CID 1278600 . Zarchiwizowane od oryginału (PDF) w dniu 2019-02-21.
Zhou R. (1998). „Receptory i ligandy z rodziny Eph”. Farmakol. Tam . 77 (3): 151–81. doi : 10.1016/S0163-7258(97)00112-5 . PMID 9576626 .
Posiadacz N, Klein R (1999). „Receptory Eph i efryny: efektory morfogenezy”. Rozwój . 126 (10): 2033–44. doi : 10.1242/dev.126.10.2033 . PMID 10207129 .
Dyrekcja Generalna Wilkinsona (2000). „Receptory Eph i efryny: regulatory przewodnictwa i montażu”. Int. ks. Cytol . Międzynarodowy Przegląd Cytologii. 196 : 177–244. doi : 10.1016/S0074-7696(00)96005-4 . ISBN 9780123646002 . PMID 10730216 .
Xu Q, Mellitzer G, Wilkinson DG (2001). „Role receptorów Eph i efryn w modelowaniu segmentowym” . Filoz. Trans. R. Soc. Londyn. B Biol. nauka . 355 (1399): 993–1002. doi : 10.1098/rstb.2000.0635 . PMC 1692797 . PMID 11128993 .
Dyrekcja Generalna Wilkinsona (2001). „Wiele ról receptorów EPH i efryn w rozwoju neuronów”. Nat. Wielebny Neurosci . 2 (3): 155–64. doi : 10.1038/35058515 . PMID 11256076 . S2CID 205014301 .
Böhme B, VandenBos T, Cerretti DP, Park LS, Holtrich U, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1996). „Adhezja komórka-komórka, w której pośredniczy wiązanie zakotwiczonego w błonie ligandu LERK-2 z receptorem związanym z EPH, kinaza zarodkowa człowieka 2, promuje aktywność kinazy tyrozynowej” . J. Biol. chemia . 271 (40): 24747–52. doi : 10.1074/jbc.271.40.24747 . PMID 8798744 .
Komitet ds. Efnomenklatury (1997). „Ujednolicona nomenklatura receptorów z rodziny Eph i ich ligandów, efryn. Komitet ds. Nomenklatury Eph” . komórka . 90 (3): 403–4. doi : 10.1016/S0092-8674(00)80500-0 . PMID 9267020 . S2CID 26773768 .
Bergemann AD, Zhang L, Chiang MK, Brambilla R, Klein R, Flanagan JG (1998). „Efryna-B3, ligand dla receptora EphB3, wyrażana w linii środkowej rozwijającej się cewy nerwowej” . Onkogen . 16 (4): 471–80. doi : 10.1038/sj.onc.1201557 . PMID 9484836 .
Hock B, Böhme B, Karn T, Feller S, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1998). „Tyrozyna-614, główne miejsce autofosforylacji receptora kinazy tyrozynowej HEK2, działa jako miejsce wielodokowania dla interakcji, w których pośredniczy domena SH2” . Onkogen . 17 (2): 255–60. doi : 10.1038/sj.onc.1201907 . PMID 9674711 .
Hock B, Böhme B, Karn T, Yamamoto T, Kaibuchi K, Holtrich U, Holland S, Pawson T, Rübsamen-Waigmann H, Strebhardt K (1998). „Interakcja, w której pośredniczy domena PDZ, receptora kinazy tyrozynowej EphB3 związanego z Eph i białka AF6 wiążącego ras zależy od aktywności kinazy receptora” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 95 (17): 9779–84. Bibcode : 1998PNAS...95.9779H . doi : 10.1073/pnas.95.17.9779 . PMC 21413 . PMID 9707552 .
Ciossek T, Monschau B, Kremoser C, Löschinger J, Lang S, Müller BK, Bonhoeffer F, Drescher U (1998). „Interakcje receptor-ligand Eph są niezbędne do kierowania aksonami komórek zwojowych siatkówki in vitro” . Eur. J. Neurosci . 10 (5): 1574–80. doi : 10.1046/j.1460-9568.1998.00180.x . PMID 9751130 . S2CID 20470923 .
Adams RH, Wilkinson GA, Weiss C, Diella F, Gale NW, Deutsch U, Risau W, Klein R (1999). „Role ligandów efrynyB i receptorów EphB w rozwoju układu sercowo-naczyniowego: rozgraniczenie domen tętniczych / żylnych, morfogeneza naczyń i angiogeneza kiełkowania” . Geny Dev . 13 (3): 295–306. doi : 10.1101/gad.13.3.295 . PMC 316426 . PMID 9990854 .
Linki zewnętrzne
Przegląd wszystkich informacji strukturalnych dostępnych w PDB dla UniProt : P54753 (receptor efryny typu B 3) w PDBe-KB .
Działalność
Rozporządzenie
Klasyfikacja
Kinetyka
typy
angiopoetyna
Inhibitory kinazy: Altiratynib
CE-245677
Rebastynib
CNTF
EFG (ErbB)
FGF
FGFR1
FGFR2
Agoniści: Ersofermina
FGF ( 1 , 2 (bFGF) , 3 , 4 , 5 , 6 , 7 ( KGF ), 8 , 9 , 10 (KGF2) , 17 , 18 , 22 )
Palifermina
Repifermina
Selperkatynib
Sprifermina
Trafermina
Przeciwciała: Aprutumab
Aprutumab iksadotyna
FGFR3
FGFR4
Nieposortowany
HGF (c-Met)
IGF
IGF-1
Inhibitory kinazy: BMS-754807
Linzytynib
NVP-ADW742
NVP-AEW541
OSl-906
IGF-2
Przeciwciała: Dusigitumab
Ksentuzumab (przeciwko IGF-1 i IGF-2)
Inni
Produkty rozkładu/pochodne o nieznanym celu: Glypromate (GPE, (1-3)IGF-1)
trofinetyd
LNGF (p75 NTR )
Aptamery: Przeciw NGF: RBM-004
Receptory wabika: LEVI-04 (p75NTR-Fc)
PDGF
RET (GFL)
SCF (c-Kit)
TGFβ
Trk
TrkA
Negatywne modulatory allosteryczne: VM-902A
Aptamery: Przeciwko NGF: RBM-004
Receptory wabika: ReN-1820 (TrkAd5)
TrkB
Agoniści: 3,7-DHF
3,7,8,2'-THF
4'-DMA-7,8-DHF
7,3'-DHF
7,8-DHF
7,8,2'-THF
7,8,3'-THF
Amitryptylina
BDNF
BNN-20
Dezoksygedunina
Deprenyl
Diosmetyna
DMAQ-B1
HIOC
LM22A-4
N-acetyloserotonina
NT-3
NT-4
Norwogonina (5,7,8-THF)
R7
R13
TDP6
TrkC
VEGF
Inni
Dodatkowe czynniki wzrostu: Adrenomedulina
Czynniki stymulujące wzrost kolonii (zamiast tego patrz tutaj )
Czynnik wzrostu tkanki łącznej (CTGF)
Efryny ( A1 , A2 , A3 , A4 , A5 , B1 , B2 , B3 )
Erytropoetyna (zamiast tego patrz tutaj )
Izomeraza glukozo-6-fosforanowa (GPI; PGI, PHI, AMF)
Czynnik dojrzewania gleju (GMF)
Czynnik wzrostu pochodzący z wątrobiaka (HDGF)
Interleukiny / czynniki wzrostu komórek T (patrz tutaj zamiast)
Czynnik hamujący białaczkę (LIF)
Białko stymulujące makrofagi (MSP; HLP, HGFLP)
Midkina (NEGF2)
Czynnik stymulujący migrację (MSF; PRG4)
onkomodulina
Peptyd aktywujący cyklazę adenylanową przysadki mózgowej (PACAP)
Plejotrofina
Renalaza
Trombopoetyna (patrz tutaj zamiast)
Białka sygnałowe Wnt
Dodatkowe modulatory receptora czynnika wzrostu: Cerebrolysin (mieszanka neurotrofin)