SORBS1

SORBS1
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, domena CAP, FLAF2, R85FL, SH3D5, SH3P12, SORB1, sorbina i SH3 zawierająca 1
identyfikator zewnętrzny
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko CAP/Ponsin , znane również jako białko 1 zawierające domenę Sorbin i SH3, jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen SORBS1 . Jest częścią małej rodziny białek adaptorowych, które regulują adhezję komórek , sygnalizację czynnika wzrostu i tworzenie cytoszkieletu . Występuje głównie w sercu , mięśniach szkieletowych , wątrobie , tkance tłuszczowej i makrofagach ; w tkance mięśni poprzecznie prążkowanych jest zlokalizowany w costamere .

Struktura

CAP/Ponsin może istnieć jako trzynaście izoform o alternatywnym splicingu, w zakresie od 81 kDa do 142 kDa. Jest częścią rodziny białek adaptorowych, której częścią są również ArgBP2 i wineksyna . Białka te zawierają konserwowaną domenę homologii sorbiny (SOHO) i trzy domeny SH3 , a CAP/Ponsin ulega ekspresji w sercu , mięśniach szkieletowych , wątrobie , tkance tłuszczowej i makrofagach .

Funkcjonować

W mięśniach CAP / Ponsin odgrywa rolę w tworzeniu dojrzałych costamerów z ogniskowych kontaktów przypominających adhezję podczas składania aparatu kurczliwego , ponieważ nadekspresja CAP / Ponsin zakłóciła normalną morfologię kontaktu komórka-macierz. W mysim modelu wirusowego zapalenia mięśnia sercowego spowodowanego zakażeniem wirusem Coxsackie , CAP/Ponsin stabilizował produkcję przeciwwirusowego interferonu typu I i chronił przed apoptozą i cytotoksycznością. Wykazano również, że jest głównym regulatorem insuliny -stymulowana sygnalizacja i regulacja wychwytu glukozy poprzez nasilenie indukowanej insuliną fosforylacji i rekrutację CBL do kompleksu sygnalizacji tratwy lipidowej z udziałem flotyliny . Jego rola w makrofagów została wyjaśniona przez odkrycie, że u myszy z makrofagami z niedoborem SORBS1 w szpiku kostnym chroniła przed opornością na insulinę wywołaną dietą wysokotłuszczową i wykazywała zmniejszony stan zapalny . W komórkach niemięśniowych hamuje rozprzestrzenianie się komórek i ogniskowej adhezji , ponieważ jego knockdown za pośrednictwem siRNA spowodował zwiększoną aktywację PAK / MEK / ERK i migrację komórek.

Znaczenie kliniczne

pacjentów ze schyłkową niewydolnością serca ; efekt, który został przywrócony po mechanicznym rozładowaniu. Stwierdzono, że polimorfizm pojedynczego nukleotydu w SORBS1 jest związany z cukrzycą typu 2 i otyłością .

Interakcje

Wykazano, że SORBS1 wchodzi w interakcje z:

• CBL ,
• FLOT1 ,
• INPPL1 ,
• INSM1 ,
• MLLT4 ,
• PXN i
• Winkulina .

Dalsza lektura

•   Kioka N (listopad 2002). „[Nowa rodzina białek adaptorowych regulująca organizację cytoszkieletu i transdukcję sygnału - Vinexin, CAP / ponsin, ArgBP2]”. Seikagaku. The Journal of Japanese Biochemical Society . 74 (11): 1356–60. PMID 12510380 .
•   Ribon V, Herrera R, Kay BK, Saltiel AR (luty 1998). „Rola CAP, nowego, wielofunkcyjnego białka zawierającego domenę homologii Src 3 w tworzeniu włókien stresu aktyny i zrostów ogniskowych” . Journal of Biological Chemistry . 273 (7): 4073–80. doi : 10.1074/jbc.273.7.4073 . PMID 9461600 .
•    Asakura T, Nakanishi H, Sakisaka T, Takahashi K, Mandai K, Nishimura M, Sasaki T, Takai Y (październik 1999). „Podobne i zróżnicowane zachowanie między układami nektyna-afadyna-ponsyna i kadheryna-katenina podczas tworzenia i przerywania spolaryzowanego połączenia w komórkach nabłonka” . Geny do komórek . 4 (10): 573–81. doi : 10.1046/j.1365-2443.1999.00283.x . PMID 10583506 . S2CID 24023429 .
•   Nagase T, Kikuno R, Ishikawa KI, Hirosawa M, Ohara O (luty 2000). „Przewidywanie sekwencji kodujących niezidentyfikowanych ludzkich genów. XVI. Kompletne sekwencje 150 nowych klonów cDNA z mózgu, które kodują duże białka in vitro” . Badania DNA . 7 (1): 65–73. doi : 10.1093/dnares/7.1.65 . PMID 10718198 .
•    Hartley JL, Temple GF, Brasch MA (listopad 2000). „Klonowanie DNA przy użyciu rekombinacji specyficznej dla miejsca in vitro” . Badania genomu . 10 (11): 1788–95. doi : 10.1101/gr.143000 . PMC 310948 . PMID 11076863 .
•   Lebre AS, Jamot L, Takahashi J, Spassky N, Leprince C, Ravisé N, Zander C, Fujigasaki H, Kussel-Andermann P, Duyckaerts C, Camonis JH, Brice A (maj 2001). „Ataksyna-7 oddziałuje z białkiem związanym z Cbl, które rekrutuje do neuronalnych inkluzji wewnątrzjądrowych” . Genetyka molekularna człowieka . 10 (11): 1201–13. doi : 10.1093/hmg/10.11.1201 . PMID 11371513 .
•   Lin WH, Huang CJ, Liu MW, Chang HM, Chen YJ, Tai TY, Chuang LM (maj 2001). „Klonowanie, mapowanie i charakterystyka domeny ludzkiej sorbiny i SH3 zawierającej gen 1 (SORBS1): białko związane z c-Abl podczas sygnalizacji insuliny w linii komórkowej wątrobiaka Hep3B” (PDF ) . Genomika . 74 (1): 12–20. doi : 10.1006/geno.2001.6541 . PMID 11374898 .
•    Kimura A, Baumann CA, Chiang SH, Saltiel AR (lipiec 2001). „Domena homologii sorbiny: motyw kierowania białek do tratw lipidowych” . Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America . 98 (16): 9098–103. Bibcode : 2001PNAS...98.9098K . doi : 10.1073/pnas.151252898 . PMC 55379 . PMID 11481476 .
•   Lin WH, Chiu KC, Chang HM, Lee KC, Tai TY, Chuang LM (sierpień 2001). „Skanowanie molekularne ludzkiej sorbiny i genu zawierającego domenę SH3-1 (SORBS1): pozytywne powiązanie polimorfizmu T228A z otyłością i cukrzycą typu 2” . Genetyka molekularna człowieka . 10 (17): 1753–60. doi : 10.1093/hmg/10.17.1753 . PMID 11532984 .
•    Cowan CA, Henkemeyer M (wrzesień 2001). „Adapter SH2 / SH3 Grb4 transdukuje odwrotne sygnały B-efryny” . Natura . 413 (6852): 174-9. Bibcode : 2001Natur.413..174C . doi : 10.1038/35093123 . PMID 11557983 . S2CID 4313061 .
•    Liu J, Kimura A, Baumann CA, Saltiel AR (czerwiec 2002). „APS ułatwia fosforylację tyrozyny c-Cbl i translokację GLUT4 w odpowiedzi na insulinę w adipocytach 3T3-L1” . Biologia molekularna i komórkowa . 22 (11): 3599–609. doi : 10.1128/MCB.22.11.3599-3609.2002 . PMC 133825 . PMID 11997497 .
•    Xie J, Cai T, Zhang H, Lan MS, Notkins AL (lipiec 2002). „Czynnik transkrypcyjny palca cynkowego INSM1 ulega ekspresji podczas rozwoju zarodka i oddziałuje z białkiem związanym z Cbl” . Genomika . 80 (1): 54–61. doi : 10.1006/geno.2002.6800 . PMC 1237014 . PMID 12079283 .
•    Nakayama M, Kikuno R, Ohara O (listopad 2002). „Interakcje białko-białko między dużymi białkami: przeszukiwanie dwuhybrydowe przy użyciu funkcjonalnie sklasyfikowanej biblioteki złożonej z długich cDNA” . Badania genomu . 12 (11): 1773–84. doi : 10.1101/gr.406902 . PMC 187542 . PMID 12421765 .
•   Vandenbroere I, Paternotte N, Dumont JE, Erneux C, Pirson I (styczeń 2003). „Białko związane z c-Cbl i c-Cbl to dwaj nowi partnerzy SHIP2 zawierającej polifosforan inozytolu 5-fosfatazy SHIP2”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 300 (2): 494–500. doi : 10.1016/S0006-291X(02)02894-2 . PMID 12504111 .
•   Yang WS, Lee WJ, Huang KC, Lee KC, Chao CL, Chen CL, Tai TY, Chuang LM (kwiecień 2003). „Poziomy mRNA cząsteczki sygnalizującej insulinę SORBS1 w magazynach tkanki tłuszczowej kobiet bez cukrzycy” . Badania nad otyłością . 11 (4): 586–90. doi : 10.1038/by.2003.82 . PMID 12690089 .