USP9X
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| USP9X | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , DFFRX, FAF, FAM, MRX99, MRXS99F, peptydaza specyficzna dla ubikwityny 9, połączona z chromosomem X, peptydaza specyficzna dla ubikwityny 9 połączona z chromosomem X, | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatory zewnętrzne XLID99 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Prawdopodobna hydrolaza końca karboksylowego ubikwityny FAF-X jest enzymem , który u ludzi jest kodowany przez gen USP9X .
Funkcjonować
Gen ten należy do rodziny peptydaz C19 i koduje białko podobne do proteaz swoistych dla ubikwityny . Chociaż ten gen znajduje się na chromosomie X, unika inaktywacji X.
Wyczerpanie USP9X z dwukomórkowych zarodków myszy zatrzymuje rozwój blastocysty i powoduje wolniejsze tempo cięcia blastomerów, upośledzoną adhezję komórek i utratę polaryzacji komórek. Zasugerowano również, że USP9X może wpływać na procesy rozwojowe poprzez szlaki sygnałowe Notch , Wnt , EGF i mTOR . USP9X został rozpoznany w badaniach mysich i ludzkich komórek macierzystych obejmujących embrionalne, nerwowe i hematopoetyczne komórki macierzyste . Wysoka ekspresja jest utrzymywana w niezróżnicowanych komórkach progenitorowych i komórkach macierzystych i zmniejsza się w miarę postępu różnicowania. USP9X to gen kodujący białko, który jest bezpośrednio związany z mutacjami lub pośrednio z wieloma zaburzeniami neurorozwojowymi i neurodegeneracyjnymi. Trzy mutacje zostały powiązane z niepełnosprawnością intelektualną sprzężoną z chromosomem X poprzez zakłócony wzrost neuronów i migrację komórek. Zaburzenia neurodegeneracyjne , takie jak choroba Alzheimera, Parkinsona i Huntingtona, również zostały powiązane z USP9X. W szczególności USP9X bierze udział w regulacji fosforylacji i ekspresji białka tau związanego z mikrotulami , które tworzy patologiczne agregaty w chorobie Alzheimera i innych tauopatiach . Naukowcy stworzyli model z nokautem, w którym wyizolowali neurony hipokampa od samca myszy z nokautem USP9X, który wykazał 43% redukcję długości aksonów i arboryzacji w porównaniu z typem dzikim .
Interakcje
Wykazano, że USP9X wchodzi w interakcje z:
Zespół USP9X
Stwierdzono, że warianty genu USP9X powodują neurorozwojowy zespół USP9X zarówno u mężczyzn, jak iu kobiet. USP9X jest silnie konserwowany ewolucyjnie u ludzi i nie toleruje zmienności. Wynika to z ważnej roli enzymu USP9X, który odwraca ubikwitylację białek, zmniejszając w ten sposób degradację enzymatyczną i zwiększając żywotność tych białek. Będąc na chromosomie X, zespół USP9X objawia się inaczej u kobiet niż u mężczyzn. U kobiet utrata zmienności funkcji w jednej kopii genu skutkuje haploinsuficjencją . Dzieje się tak dlatego, że USP9X wymyka się zwykle ochronnemu procesowi inaktywacji X. W rezultacie nawet samice „ nosicielki ” wykazują ten syndrom.
Warianty znalezione u kobiet z zespołem USP9X obejmują całe lub częściowe delecje jednej kopii genu USP9X , jak również mutacje mis-sensowne lub małe mutacje delecji w ramce. Objawy u kobiet obejmują niepełnosprawność intelektualną , dysmorfię twarzy i zaburzenia językowe . Mniej powszechne objawy to niski wzrost , skolioza , polidaktylia i zmiany w uzębieniu . Kobiety mają szerszy zakres objawów niż mężczyźni, prawdopodobnie ze względu na większą różnorodność USP9X w porównaniu z mężczyznami. Inne objawy, które czasami występują u kobiet, ale rzadko lub nigdy u mężczyzn, to dysplazja stawu biodrowego , dysmorfia serca, problemy ze słuchem i nieprawidłowa pigmentacja skóry.
USP9X obserwowane u przeżywających samców powodują utratę funkcji tylko w procesach specyficznych dla mózgu, ponieważ całkowita utrata funkcji tego genu jest śmiertelna na etapie embrionalnym. Samce są hemizygotyczne pod względem tego genu, ponieważ posiadają tylko jeden chromosom X. Objawy obserwowane u dotkniętych chorobą mężczyzn obejmują niepełnosprawność intelektualną, problemy z językiem, mową, zachowaniem i wzrokiem oraz dysmorfię twarzy. Specyficzne nieprawidłowości mózgu obejmują istoty białej , cienkie ciało modzelowate i poszerzone komory .
Dalsza lektura
- D'Andrea A, Pellman D (1998). „Enzymy deubikwitynujące: nowa klasa regulatorów biologicznych”. Krytyk. Wielebny Biochem. Mol. Biol . 33 (5): 337–52. doi : 10.1080/10409239891204251 . PMID 9827704 .
- Andersson B, Wentland MA, Ricafrente JY, Liu W, Gibbs RA (1996). „Metoda„ podwójnego adaptera ”do ulepszonej konstrukcji biblioteki strzelb”. Analny. Biochem . 236 (1): 107–13. doi : 10.1006/abio.1996.0138 . PMID 8619474 .
- Yu W, Andersson B, Worley KC, Muzny DM, Ding Y, Liu W, Ricafrente JY, Wentland MA, Lennon G, Gibbs RA (1997). „Sekwencjonowanie cDNA na dużą skalę” . Genom Res . 7 (4): 353–8. doi : 10.1101/gr.7.4.353 . PMC 139146 . PMID 9110174 .
- Dias Neto E, Correa RG, Verjovski-Almeida S, Briones MR, Nagai MA, da Silva W, Zago MA, Bordin S, Costa FF, Goldman GH, Carvalho AF, Matsukuma A, Baia GS, Simpson DH, Brunstein A, de Oliveira PS, Bucher P, Jongeneel CV, O'Hare MJ, Soares F, Brentani RR, Reis LF, de Souza SJ, Simpson AJ (2000). „Sekwencjonowanie typu shotgun ludzkiego transkryptomu za pomocą znaczników sekwencji wyrażanych w ORF” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 97 (7): 3491-6. Bibcode : 2000PNAS...97.3491D . doi : 10.1073/pnas.97.7.3491 . PKW 16267 . PMID 10737800 .
- Noma T, Kanai Y, Kanai-Azuma M, Ishii M, Fujisawa M, Kurohmaru M, Kawakami H, Wood SA, Hayashi Y (2002). „Zależne od stadium i płci ekspresje Usp9x, sprzężonego z chromosomem X mysiego ortologa aspektów Drosophila Fat, podczas rozwoju gonad i oogenezy u myszy” . gen ekspr. Wzory . 2 (1–2): 87–91. doi : 10.1016/S0925-4773(02)00290-3 . PMID 12617843 .
- Murray RZ, Jolly LA, Wood SA (2004). „Enzym deubikwitynujący FAM lokalizuje się w wielu punktach transportu białek w nabłonku, gdzie wiąże się z E-kadheryną i beta-kateniną” . Mol. Biol. komórka . 15 (4): 1591–9. doi : 10.1091/mbc.E03-08-0630 . PMC 379258 . PMID 14742711 .
- Bouwmeester T, Bauch A, Ruffner H, Angrand PO, Bergamini G, Croughton K, Cruciat C, Eberhard D, Gagneur J, Ghidelli S, Hopf C, Huhse B, Mangano R, Michon AM, Schirle M, Schlegl J, Schwab M , Stein MA, Bauer A, Casari G, Drewes G, Gavin AC, Jackson DB, Joberty G, Neubauer G, Rick J, Kuster B, Superti-Furga G (2004). „Fizyczna i funkcjonalna mapa szlaku transdukcji sygnału ludzkiego TNF-alfa / NF-kappa B”. Nat. Biol komórkowy . 6 (2): 97–105. doi : 10.1038/ncb1086 . PMID 14743216 . S2CID 11683986 .
- Fu GK, Wang JT, Yang J, Au-Young J, Stuve LL (2004). „Okrężna szybka amplifikacja końców cDNA do wysokowydajnego klonowania częściowych genów z wydłużaniem”. Genomika . 84 (1): 205–10. doi : 10.1016/j.ygeno.2004.01.011 . PMID 15203218 .
- Rush J, Moritz A, Lee KA, Guo A, Goss VL, Spek EJ, Zhang H, Zha XM, Polakiewicz RD, Comb MJ (2005). „Profilowanie powinowactwa immunologicznego fosforylacji tyrozyny w komórkach nowotworowych”. Nat. Biotechnologia . 23 (1): 94–101. doi : 10.1038/nbt1046 . PMID 15592455 . S2CID 7200157 .
- Al-Hakim AK, Göransson O, Deak M, Toth R, Campbell DG, Morrice NA, Prescott AR, Alessi DR (2005). „14-3-3 współpracuje z LKB1 w celu uregulowania działalności i lokalizacji QSK i SIK” . J. Cell Sci . 118 (Pt 23): 5661–73. doi : 10.1242/jcs.02670 . PMID 16306228 .
- Kimura K, Wakamatsu A, Suzuki Y, Ota T, Nishikawa T, Yamashita R, Yamamoto J, Sekine M, Tsuritani K, Wakaguri H, Ishii S, Sugiyama T, Saito K, Isono Y, Irie R, Kushida N, Yoneyama T , Otsuka R, Kanda K, Yokoi T, Kondo H, Wagatsuma M, Murakawa K, Ishida S, Ishibashi T, Takahashi-Fujii A, Tanase T, Nagai K, Kikuchi H, Nakai K, Isogai T, Sugano S (2006) . „Zróżnicowanie modulacji transkrypcji: identyfikacja i charakterystyka na dużą skalę przypuszczalnych alternatywnych promotorów ludzkich genów” . Genom Res . 16 (1): 55–65. doi : 10.1101/gr.4039406 . PMC 1356129 . PMID 16344560 .
- Beausoleil SA, Villén J, Gerber SA, Rush J, Gygi SP (2006). „Podejście oparte na prawdopodobieństwie do wysokoprzepustowej analizy fosforylacji białek i lokalizacji miejsca”. Nat. Biotechnologia . 24 (10): 1285–92. doi : 10.1038/nbt1240 . PMID 16964243 . S2CID 14294292 .
- Mouchantaf R, Azakir BA, McPherson PS, Millard SM, Wood SA, Angers A (2006). „Swędzenie ligazy ubikwitynowej jest automatycznie ubikwitynowane in vivo i in vitro, ale jest chronione przed degradacją poprzez interakcję z enzymem deubikwitynującym FAM / USP9X” (PDF) . J. Biol. chemia . 281 (50): 38738–47. doi : 10.1074/jbc.M605959200 . PMID 17038327 .
- Olsen JV, Blagoev B, Gnad F, Macek B, Kumar C, Mortensen P, Mann M (2006). „Globalna, in vivo i specyficzna dla miejsca dynamika fosforylacji w sieciach sygnalizacyjnych” . komórka . 127 (3): 635–48. doi : 10.1016/j.cell.2006.09.026 . PMID 17081983 .