Liaza pektynowa
| identyfikatory | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| liazy pektynowej | |||||||||
| nr WE | 4.2.2.10 | ||||||||
| nr CAS | 9033-35-6 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| Ontologia genów | AmiGO / QuickGO | ||||||||
| |||||||||
Liaza pektynowa ( EC 4.2.2.10 ), znana również jako pektoliaza , jest naturalnie występującą pektynazą , rodzajem enzymu rozkładającego pektynę . Jest produkowany komercyjnie dla przemysłu spożywczego z grzybów i używany do niszczenia pozostałości skrobi owocowej , znanej jako pektyna , w winie i cydrze . W hodowli komórek roślinnych jest stosowany w połączeniu z enzymem celulazą do wytwarzania protoplastów ścian komórkowych roślin .
Liaza pektynowa katalizuje następujący proces:
- Eliminacyjne rozszczepianie estru metylowego (1→4)-α- D -alakturonanu w celu uzyskania oligosacharydów z grupami 4-deoksy-6- O -metylo-α, -D -galakt-4-enuronozylowymi na ich nieredukujących końcach
Enzym ten należy do rodziny liaz , w szczególności liaz węglowo-tlenowych działających na polisacharydy.
Nomenklatura
Systematyczna nazwa tej klasy enzymów to (1→4)-6- O -metylo-α- D -galakturonan liaza . Inne powszechnie używane nazwy to:
- liaza endo-pektynowa,
- metylotranseliminaza pektynowa,
- transeliminaza pektynowa,
- pektoliaza,
- PL,
- PMGL,
- PNL i
- transeliminaza polimetylogalakturonowa.
Studia strukturalne
Pod koniec 2007 roku rozwiązano 3 struktury dla tej klasy enzymów o kodach dostępu PDB 1IDJ , 1IDK i 1QCX .
Zastosowania biotechnologiczne
Liazy pektynowe są jedynymi znanymi pektynazami zdolnymi do rozkładania wysoce zestryfikowanych pektyn (takich jak te występujące w owocach) na małe cząsteczki poprzez mechanizm β-eliminacji bez wytwarzania metanolu (który jest toksyczny), w przeciwieństwie do kombinacji PG i PE, które normalnie występują w produktach handlowych. Ponadto obecność niepożądanej aktywności enzymatycznej w komercyjnych pektynazach może być szkodliwa dla aromatu, ponieważ są one odpowiedzialne za wytwarzanie nieprzyjemnego lotnego posmaku. Istnieje wiele doniesień o klarowaniu soków owocowych przez liazy pektynowe.
Pektynaza alkaliczna nie nadaje się do stosowania w przemyśle spożywczym ze względu na kwaśne pH soków owocowych. Jednak mają bardzo duże zapotrzebowanie w przemyśle tekstylnym. Stosowane są do roszenia włókien roślinnych takich jak ramia , konopie siewne , juta , len i konopie . Pierwsze doniesienie na temat roszenia konopi siewnej (Crotalaria juncea) przez liazę pektynową wytwarzaną przez Aspergillus flavus MTCC 7589 zostało opublikowane w 2008 r., ale ten aspekt liazy pektynowej wymaga dalszych dogłębnych badań.
Dalsza lektura
- Albersheim P, Neukom H, Deuel H (1960). "Uber die Bildung von ungesattigten Abbauprodukten durch ein pekinabbauendes Enzym". Helv. Chim. Akta . 43 (5): 1422–1426. doi : 10.1002/hlca.19600430525 .
- Pickersgill R, Jenkins J (1997). „Dwie struktury krystaliczne liazy pektynowej A z Aspergillus ujawniają zmianę konformacyjną spowodowaną pH i uderzającą rozbieżność w szczelinach wiążących substrat liazy pektynowej i pektynowej” . Struktura . 5 (5): 677–89. doi : 10.1016/S0969-2126(97)00222-0 . PMID 9195887 .
- Kester HC, Visser J (1994). „Oczyszczanie i charakterystyka liazy pektynowej B, nowego enzymu pektynolitycznego z Aspergillus niger” . Mikrobiol FEMS. Lett . 120 (1–2): 63–68. doi : 10.1111/j.1574-6968.1994.tb07008.x .
- Mutenda KE, Korner R, Christensen TM, Mikkelsen J, Roepstorff P (2002). „Zastosowanie spektrometrii mas do oznaczania aktywności i specyficzności liazy pektynowej A”. Węglowodany. Rez . 337 (13): 1217–27. doi : 10.1016/S0008-6215(02)00127-1 . PMID 12110197 .
