MED26

Identyfikatory
MED26
, CRSP7, CRSP70, podjednostka kompleksu mediatora 26
identyfikatorów zewnętrznych
ortologi
Gatunek Człowiek Mysz
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNA)

RefSeq (białko)

Lokalizacja (UCSC)
PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz
Med26
PDB 1wjt EBI.jpg
domeny n-końcowej i mysiego czynnika elongacji transkrypcji białka s-ii 3
Identyfikatory
Symbol Domena N-końcowa Med26
Pfam PF08711
InterPro IPR017923
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury
Podjednostka mediatora 26
Identyfikatory domeny środkowej
Symbol Med26_M
Pfam PF15694
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury
Identyfikatory
domeny C-końcowej
Symbol Med26_C
Pfam PF15693
Dostępne struktury białek:
Pfam   konstrukcje / ECOD  
WPB RCSB WPB ; PDBe ; WPBj
Suma WPB podsumowanie struktury

Mediatorem podjednostki transkrypcyjnej polimerazy RNA II 26 jest enzym , który u ludzi jest kodowany przez gen MED26 . Stanowi część kompleksu Mediator .

Aktywacja transkrypcji genów jest procesem wieloetapowym, który jest wyzwalany przez czynniki rozpoznające miejsca wzmacniające transkrypcję w DNA. Czynniki te współpracują z koaktywatorami, kierując inicjacją transkrypcji przez aparat polimerazy RNA II. Białko kodowane przez ten gen jest podjednostką kompleksu CRSP (kofaktor wymagany do aktywacji SP1), który wraz z TFIID jest niezbędny do skutecznej aktywacji SP1. Białko to jest również składnikiem innych wielopodjednostkowych kompleksów, np. białek związanych z receptorem hormonu tarczycy (TR-), które oddziałują z TR i ułatwiają działanie TR na matrycach DNA w połączeniu z czynnikami inicjującymi i kofaktorami.

Działalność

MED26 jest czynnikiem wydłużającym transkrypcję , który zwiększa ogólną szybkość transkrypcji polimerazy RNA II poprzez reaktywację kompleksów wydłużających transkrypcję , które zatrzymały transkrypcję . Czyni to poprzez rekrutację kompleksów zawierających ELL/EAF i P-TEFb do promotorów poprzez bezpośrednią interakcję z domeną N-końcową (NTD). MED26 NTD wiąże się również z TFIID, a TFIID i kompleksy elongacyjne oddziałują z MED26 poprzez nakładające się miejsca wiązania. MED26 NTD może działać jako przełącznik molekularny przyczyniający się do przejścia Pol II do produktywnego wydłużenia.

Trzy domeny strukturalne TFIIS są konserwowane od drożdży do człowieka . Około 80 reszt N-końcowych tworzy domenę interakcji białek zawierającą konserwatywny motyw, który został nazwany motywem LW ze względu na zawarte w nim niezmienne reszty leucyny i tryptofanu . Chociaż domena N-końcowa nie jest potrzebna do aktywności transkrypcyjnej , podobną sekwencję zidentyfikowano w innych czynniki transkrypcyjne i białka , które są głównie zlokalizowane w jądrze . Konkretne przykłady wymieniono poniżej:

  • MED26 (znany również jako CRSP70 i ARC70), podjednostka kompleksu Mediator, która jest wymagana do aktywności białka Sp1 wiążącego wzmacniacz.
  • Elongin A, podjednostka czynnika wydłużania transkrypcji, znanego wcześniej jako SIII. Zwiększa szybkość transkrypcji poprzez hamowanie przejściowej pauzy kompleksu elongacyjnego .
  • PPP1R10, jądrowa podjednostka regulatorowa fosfatazy białkowej 1, znana wcześniej jako p99, FB19 lub PNUTS.
  • PIBP, małe hipotetyczne białko, które może być białkiem wiążącym fosfoinozytyd .
  • IWS1, który, jak się uważa, działa zarówno w inicjacji transkrypcji , jak i wydłużaniu.
  • TFIIS, który ratuje polimerazę RNA II przed cofniętymi stanami pauzy.

Domena N-końcowa MED26 jest fałdem białkowym znanym jako domena N-końcowa TFIIS (lub TND). Jest to zwarta wiązka pięciu helis. Hydrofobowe reszty rdzeniowe helis 2, 3 i 4 są dobrze konserwowane wśród domen TFIIS, chociaż helisa 1 jest mniej konserwatywna.

Interakcje

Wykazano, że MED26 oddziałuje z MED8 , cyklinozależną kinazą 8 , POLR2A , MED12 i MED28 . Działa również synergistycznie, pośrednicząc w interakcji między REST (czynnik transkrypcyjny palca cynkowego typu Kruppela, który wiąże się z elementem wyciszającym RE1 o długości 21 pz, obecnym w ponad 900 ludzkich genach) a Mediatorem.

Ten artykuł zawiera tekst z domeny publicznej Pfam i InterPro : IPR017923

Dalsza lektura