NLRP11
| Identyfikatory | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| NLRP11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| , CLR19.6, NALP11, NOD17, PAN10, PYPAF6, PYPAF7, rodzina NLR, domena pirynowa zawierająca 11, domena pirynowa z rodziny NLR zawierająca 11 | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| identyfikatorów zewnętrznych | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Wikidane | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Domena pirynowa z rodziny receptorów NOD-podobnych zawierająca 11 jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen NLRP11 zlokalizowany na długim ramieniu ludzkiego chromosomu 19q13.42. NLRP11 należy do podrodziny NALP, części dużej podrodziny gąsienic. Jest również znany jako NALP11, PYPAF6, NOD17, PAN10 i CLR19.6
Będąc członkiem rodziny genów białka receptora podobnego do NOD (NLRP) , koduje białko z N-końcową domeną śmierci piryny (PYD) i domeną hydrolazy trifosforanu nukleozydu ( NACHT ) oraz C-końcowymi powtórzeniami bogatymi w leucynę (LRR ) region. Gen ten reguluje kaspazy w prozapalnym szlaku transdukcji sygnału. Na podstawie badań innych członków rodziny genów NLRP o podobnych strukturach domen przewiduje się, że będzie stanowił część wielobiałkowego kompleksu inflammasomu.
NLRP11 ulega ekspresji głównie w komórkach odpornościowych, komórkach B, komórkach mieloidalnych i liniach komórkowych chłoniaka z komórek B. NLRP11 bierze udział w regulacji odpowiedzi zapalnych w komórkach ludzkich.
Rodzina NALP kontroluje cytokiny, reakcje zapalne, aktywację NF-κB oraz prawdopodobnie śmierć i przeżycie komórek.
Struktura
Gen ten koduje białko z N-końcową domeną śmierci piryny (PYD) i domeną hydrolazy trifosforanu nukleozydu (NACHT) oraz C-końcowym regionem bogatym w leucynę (LRR). Zawiera łącznie 14 LRR i 1033 aminokwasy.
Ewolucja
NLRP11 jest genem specyficznym dla naczelnych i nie występuje u myszy Badanie ewolucji NLRP związanych z reprodukcją ssaków wykazało, że NLRP11 jest częścią rodzinnego klastra genów, które duplikowały się przed dywergencją ssaków.
Funkcjonować
Lipopolisacharyd bakteryjny (LPS) jest endotoksyną, która może prowadzić do śmiertelnej posocznicy poprzez aktywację wrodzonej odpowiedzi immunologicznej. Cytoplazmatyczny LPS (cLPS) indukuje składanie inflammasomu, który zawiera kaspazy -4/5 u ludzi lub kaspazę-11 u myszy. NLRP11 służy jako receptor rozpoznawania wzorców dla cLPS i może powodować aktywację inflamasomu kaspazy-4 .
Istnieje również nowa rola NLRP11 w regulacji odpowiedzi zapalnych w komórkach ludzkich. U naczelnych NLRP11 służy również jako konserwatywny negatywny regulator sygnalizacji TLR. NLRP11 działa jako negatywny regulator IFN typu I i apoptozy indukowanej przez wirusy poprzez zakłócanie mitochondrialnego białka przeciwwirusowego (MAVS). Helikaza RNA zależna od ATP DDX3X jest nowym partnerem wiążącym NLRP11. NLRP11 stłumił pozytywny wpływ DDX3X na NLRP3 aktywacja kaspazy-1 za pośrednictwem inflamasomu. Badania sugerują również, że funkcja NLRP11 może odgrywać rolę w odporności wrodzonej. NLRP11 i DDX3X mogą stać się obiecującymi celami dla modulacji wrodzonych odpowiedzi immunologicznych.
Po infekcji wirusowej IFN typu I aktywuje NLRP11, a po aktywacji przemieszcza się do mitochondriów, aby oddziaływać z MAVS. NLRP11 degraduje TRAF6 przy użyciu MAVS w celu osłabienia produkcji IFN typu I i apoptozy indukowanej przez wirusy. NLRP11 działa jako negatywny regulator IFN typu I i apoptozy indukowanej przez wirusy poprzez zakłócanie aktywności sygnałosomu MAVS.
W ludzkich makrofagach NLRP11 jest niezbędnym składnikiem inflammasomu NLRP3. Najlepiej zbadaną cząsteczką czujnikową inflammasomu z rodziny NLR jest NLRP3, która zawiera domenę PYRIN na końcu aminowym (PYD), domenę NACHT wiążącą nukleotydy i domenę na końcu karboksylowym bogatą w leucynę (LRR). Wiązanie ATP jest wymagane do aktywacji NLRP3, domena NACHT NLRP3 zawiera aktywność ATPazy, a mutacja tego miejsca zmniejsza wiązanie ATP, aktywację kaspazy-1, produkcję IL-1, śmierć komórki, tworzenie kompleksów makrocząsteczkowych i jej związek z apoptozą białko podobne do drobinek zawierające CARD (ASC) .
Istnieje interakcja między NLRP11, NLRP3 i ASC. Aktywacja inflamasomu NLRP3 jest hamowana przez specyficzną delecję NLRP11, co prowadzi do hamowania polimeryzacji ASC, aktywacji kaspazy-1, a następnie uwalniania cytokin. Mutacje NLRP3, które powodują okresowy zespół związany z kriopiryną (CAPS), również wymagają NLRP11 do odpowiedzi inflammasomu. Badana jest złożona biologia inflamasomu , a rola NLRP11 w chorobach jest częściowo poznana.
Dalsza lektura
- Dowds TA, Masumoto J, Chen FF, Ogura Y, Inohara N, Núñez G (marzec 2003). „Regulacja sygnalizacji kriopiryny / Pypaf1 przez pirynę, produkt genu rodzinnej gorączki śródziemnomorskiej”. Komunikaty dotyczące badań biochemicznych i biofizycznych . 302 (3): 575–580. doi : 10.1016/S0006-291X(03)00221-3 . PMID 12615073 .
- Enjuanes A, Benavente Y, Bosch F, Martín-Guerrero I, Colomer D, Pérez-Alvarez S, et al. (grudzień 2008). „Warianty genetyczne w genach związanych z apoptozą i immunoregulacją są związane z ryzykiem przewlekłej białaczki limfocytowej” . Badania nad rakiem . 68 (24): 10178–10186. doi : 10.1158/0008-5472.CAN-08-2221 . PMID 19074885 .
- Baranzini SE, Wang J, Gibson RA, Galwey N, Naegelin Y, Barkhof F i in. (luty 2009). "Analiza asocjacji całego genomu podatności i fenotypu klinicznego w stwardnieniu rozsianym" . Genetyka molekularna człowieka . 18 (4): 767–778. doi : 10.1093/hmg/ddn388 . PMC 4334814 . PMID 19010793 .
- Grenier JM, Wang L, Manji GA, Huang WJ, Al-Garawi A, Kelly R i in. (październik 2002). „Funkcjonalne badania przesiewowe pięciu członków rodziny PYPAF identyfikują PYPAF5 jako nowy regulator NF-kappaB i kaspazy-1”. Listy FEBS . 530 (1–3): 73–78. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03416-6 . PMID 12387869 . S2CID 25023390 .
- Wang L, Manji GA, Grenier JM, Al-Garawi A, Merriam S, Lora JM i in. (sierpień 2002). „PYPAF7, nowe białko podobne do Apaf1 zawierające PYRIN, które reguluje aktywację NF-kappa B i przetwarzanie cytokin zależne od kaspazy-1” . Journal of Biological Chemistry . 277 (33): 29874–29880. doi : 10.1074/jbc.M203915200 . PMID 12019269 .