Białko wiążące oktamer nie zawierające domeny POU

Ten artykuł dotyczy ludzkiego genu kodującego białko. W przypadku innych zastosowań zobacz nono (ujednoznacznienie) .

NIE? NIE
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, NMT55, NRB54, P54, P54NRB, PPP1R114, MRXS34, domena inna niż POU, wiążąca oktamer, domena inna niż POU zawierająca oktamer wiążący
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcje molekularne Składnik komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Białko wiążące oktamer (NonO) zawierające domenę inną niż POU jest białkiem , które u ludzi jest kodowane przez gen NONO .

Białko NonO należy do rodziny białek behawioralnych/splicingu ludzkiego Drosophila (DBHS). Białka z rodziny DHBS obejmują ssaczy SFPQ (czynnik splicingowy, bogaty w prolinę i glutaminę; znany również jako PSF), NONO (białko wiążące oktamer zawierające domenę inną niż POU; znany również jako p54nrb) i PSPC1 (składnik paraspeckle 1; znany również jako PSP1) i bezkręgowców NONA (białko nie-przejściowe A) i Hrp65.

Interakcje

Wykazano, że NONO oddziałuje z SFPQ , SPI1 i receptorem androgenowym .

Funkcje

NONO bierze udział w wielu procesach jądrowych i wiąże się zarówno z DNA , jak i RNA .

Podobnie jak w przypadku wszystkich białek z rodziny DBHS białko jest opisane jako wielofunkcyjne białko jądrowe. Wykazano, że białko NONO bierze udział w wielu funkcjach biologicznych, w tym w splicingu pre-mRNA; aktywacja transkrypcji ; zakończenie transkrypcji; Odwijanie i parowanie DNA oraz utrzymanie prawidłowej zegara dobowego .

Zidentyfikowano, że NONO wiąże się z białkiem Rasd1 , w powstałym dimerze Rasd1 może działać w celu modulowania funkcji NONO w celu zmniejszenia ekspresji genów CREB , NR4A1 i Nr4A2 .

NONO wiąże się z SFPQ, tworząc heterodimer , który oddziałuje z białkiem MATR3 . Interakcja tych trzech białek może być częścią procesu w jądrze, który jest odpowiedzialny za zatrzymywanie RNA, które są wadliwe, jeszcze nie wystarczająco dojrzałe, aby można je było eksportować lub są zaprojektowane do zatrzymania w jądrze .

Lokalizacja genu

gen NONO , który znajduje się na nici dodatniej chromosomu X.

Rola w chorobie

Czerniak

Wykazano, że NONO ulega silniejszej ekspresji w liniach komórkowych czerniaka i próbkach tkanki czerniaka w porównaniu z normalnymi ludzkimi liniami komórkowymi i normalną tkanką skóry. Badania wykazały, że nokaut białka NONO z linii komórkowych czerniaka skutkuje zarówno zmniejszeniem tempa proliferacji komórek nowotworowych, jak i znacznym spadkiem potencjalnej migracji komórek nowotworowych.

Rak piersi

Badania nad rakiem piersi wykazały, że utrata lub zmiana NONO w połączeniu z utratą receptora estrogenowego hERα powoduje bardziej agresywne raki piersi, które wykazują zarówno wzrost wielkości guza , jak i przerzuty .

Niepełnosprawność intelektualna związana z kardiomiopatią niezbitą

Badania na ludziach i myszach wykazały, że mutacje zerowe NONO prawdopodobnie prowadzą do rozwoju rozpoznawalnej klinicznie niepełnosprawności intelektualnej z deficytami poznawczymi i afektywnymi. Później odkryto, że te patogenne warianty były również silnie związane z kardiomiopatią z brakiem zagęszczenia lewej komory , a czasem z anomalią Ebsteina .

Struktura

Podobnie jak w przypadku innych białek z rodziny DBHS, funkcje białek NONO rzadko działają samodzielnie i głównie tworzą homo- i heterodimery z innymi białkami DBHS w celu wykonywania różnych funkcji. Teoretyzuje się, że te dimery mogą pełnić różne funkcje, które są specyficzne dla typu komórki, w której się znajdują.

Spekuluje się, że to stan fosforylacji na NONO kieruje białkami w wielu różnych funkcjach w jądrze.

Specyficzność tkankowa

NONO znajduje się w jądrze większości komórek ssaków i jest głównie rozprowadzany w nukleoplazmie , można go również znaleźć w postaci skoncentrowanej w domenach subjądrowych znanych jako paraspeckle .

NONO zaobserwowano również w mózgu, zlokalizowane w cytoplazmie neuronów hipokampa , które są związane z granulkami transportującymi RNA . Jest również silnie wyrażany w tkance serca.

Odkrycie

Białko NONO zostało po raz pierwszy odkryte w 1993 roku przez naukowców z Cold Springs Harbor Laboratory . Ze względu na to, że białko zostało pierwotnie zidentyfikowane jako białko wiążące RNA, nazwano je p54nrb od białka wiążącego jądrowy RNA, 54 kDa.

Dalsza lektura

•   Shav-Tal Y, Zipori D (listopad 2002). „PSF i p54 (nrb) / NonO - wielofunkcyjne białka jądrowe” . Listy FEBS . 531 (2): 109–14. doi : 10.1016/S0014-5793(02)03447-6 . PMID 12417296 .
•    Zhang WW, Zhang LX, Busch RK, Farrés J, Busch H (luty 1993). „Oczyszczanie i charakterystyka heterodimeru wiążącego DNA o masie cząsteczkowej 52 i 100 kDa z komórek HeLa” . Dziennik biochemiczny . 290 (część 1): 267–72. doi : 10.1042/bj2900267 . PMC 1132410 . PMID 8439294 .
•   Hallier M, Tavitian A, Moreau-Gachelin F (maj 1996). „Czynnik transkrypcyjny Spi-1 / PU.1 wiąże RNA i zakłóca działanie białka p54nrb wiążącego RNA” . Journal of Biological Chemistry . 271 (19): 11177–81. doi : 10.1074/jbc.271.19.11177 . PMID 8626664 .
•    Peters U, Haberhausen G, Kostrzewa M, Nolte D, Müller U (październik 1997). „AFX1 i p54nrb: dokładne mapowanie, struktura genomowa i wykluczenie jako geny kandydujące na parkinsonizm dystonii sprzężonej z chromosomem X”. Genetyka człowieka . 100 (5–6): 569–72. doi : 10.1007/s004390050553 . PMID 9341872 . S2CID 35332593 .
•   Clark J, Lu YJ, Sidhar SK, Parker C, Gill S, Smedley D, Hamoudi R, Linehan WM, Shipley J, Cooper CS (październik 1997). „Fuzja genów czynnika splicingowego PSF i NonO (p54nrb) z genem TFE3 w raku brodawkowatym nerki” . Onkogen . 15 (18): 2233-9. doi : 10.1038/sj.onc.1201394 . PMID 9393982 .
•   Straub T, Grue P, Uhse A, Lisby M, Knudsen BR, Tange TO, Westergaard O, Boege F (październik 1998). „Czynnik splicingowy RNA PSF / p54 kontroluje aktywność DNA-topoizomerazy I poprzez bezpośrednią interakcję” . Journal of Biological Chemistry . 273 (41): 26261–4. doi : 10.1074/jbc.273.41.26261 . PMID 9756848 .
•   Karhumaa P, Parkkila S, Waheed A, Parkkila AK, Kaunisto K, Tucker PW, Huang CJ, Sly WS, Rajaniemi H (maj 2000). „Białko jądrowe NonO / p54 (nrb) jest nieklasyczną anhydrazą węglanową” . Journal of Biological Chemistry . 275 (21): 16044–9. doi : 10.1074/jbc.275.21.16044 . PMID 10821857 .
•   Straub T, Knudsen BR, Boege F (czerwiec 2000). „PSF / p54 (nrb) stymuluje„ przeskakiwanie ”topoizomerazy I DNA między oddzielnymi helisami DNA”. Biochemia . 39 (25): 7552–8. doi : 10.1021/bi992898e . PMID 10858305 .
•    Mathur M, Tucker PW, Samuels HH (kwiecień 2001). „PSF to nowy korepresor, który pośredniczy w swoim działaniu poprzez Sin3A i domenę wiążącą DNA jądrowych receptorów hormonów” . Biologia molekularna i komórkowa . 21 (7): 2298–311. doi : 10.1128/MCB.21.7.2298-2311.2001 . PMC86864 . _ PMID 11259580 .
•   Zhang Z, Carmichael GG (sierpień 2001). „Los dsRNA w jądrze: kompleks zawierający p54 (nrb) pośredniczy w zatrzymywaniu jądrowym RNA edytowanych swobodnie od A do I” . komórka . 106 (4): 465–75. doi : 10.1016/S0092-8674(01)00466-4 . PMID 11525732 .
•    Pavao M, Huang YH, Hafer LJ, Moreland RB, Traish AM (2001). „Immunodetekcja izoform nmt55 / p54nrb w ludzkim raku piersi” . Rak BMC . 1:15 . doi : 10.1186/1471-2407-1-15 . PMC 59838 . PMID 11710964 .
•   Andersen JS, Lyon CE, Fox AH, Leung AK, Lam YW, Steen H, Mann M, Lamond AI (styczeń 2002). „Skierowana analiza proteomiczna jąderka ludzkiego” . Bieżąca biologia . 12 (1): 1–11. doi : 10.1016/S0960-9822(01)00650-9 . PMID 11790298 .
•   Sewer MB, Nguyen VQ, Huang CJ, Tucker PW, Kagawa N, Waterman MR (kwiecień 2002). „Aktywacja transkrypcji ludzkiego CYP17 w komórkach kory nadnerczy H295R zależy od tworzenia kompleksu między p54 (nrb) / NonO, związanym z białkami czynnikiem splicingowym i SF-1, kompleksem, który również uczestniczy w represji transkrypcji” . Endokrynologia . 143 (4): 1280–90. doi : 10.1210/endo.143.4.8748 . PMID 11897684 .
•   Ohta S, Shiomi Y, Sugimoto K, Obuse C, Tsurimoto T (październik 2002). „Podejście proteomiczne do identyfikacji białek wiążących antygen jądrowy proliferujących komórek (PCNA) w lizatach komórek ludzkich. Identyfikacja kompleksu ludzkiego CHL12 / RFCs2-5 jako nowego białka wiążącego PCNA” . Journal of Biological Chemistry . 277 (43): 40362–7. doi : 10.1074/jbc.M206194200 . PMID 12171929 .
•    Emili A, Shales M, McCracken S, Xie W, Tucker PW, Kobayashi R, Blencowe BJ, angielski CJ (wrzesień 2002). „Splatanie i białka związane z transkrypcją PSF i p54nrb / nonO wiążą się z polimerazą RNA II CTD” . RNA . 8 (9): 1102–11. doi : 10.1017/S1355838202025037 . PMC 1370324 . PMID 12358429 .
•    Peng R, Dye BT, Pérez I, Barnard DC, Thompson AB, Patton JG (październik 2002). „PSF i p54nrb wiążą konserwatywną łodygę w U5 snRNA” . RNA . 8 (10): 1334–47. doi : 10.1017/S1355838202022070 . PMC 1370341 . PMID 12403470 .