Pętla macierzysta 3 ′ UTR histonu
Pętla pnia 3′ UTR histonu | |
---|---|
identyfikatorów | |
Symbol | Histon3 |
Rfam | RF00032 |
Inne dane | |
typ RNA | Cis-reg |
Domeny | Eukariota |
IŚĆ | GO:0006398 |
WIĘC | SO:0000205 |
Struktury PDB | PDBe |
Pętla macierzysta 3′ UTR histonu jest elementem RNA zaangażowanym w nukleocytoplazmatyczny transport mRNA histonów oraz w regulację stabilności i wydajności translacji w cytoplazmie . MRNA genów histonów metazoanu nie ma poliadenylacji i ogona poli-A , zamiast tego przetwarzanie końca 3 'zachodzi w miejscu między tą wysoce konserwatywną pętlą łodygi a regionem bogatym w purynę około 20 nukleotydów downstream (element downstream histonu lub HDE). Pętla pnia jest związana przez białko wiążące pętlę pnia o masie cząsteczkowej 31 kDa ( SLBP - określane również jako białko wiążące spinkę do włosów histonów lub HBP). Wraz z U7 snRNA HDE, wiązanie SLBP zarodkuje tworzenie kompleksu przetwarzającego.
- Williams AS, Marzluff WF (luty 1995). „Sekwencja łodygi i sekwencji flankujących na końcu 3 'mRNA histonu są krytycznymi determinantami wiązania białka wiążącego pętlę łodygi” . Badania kwasów nukleinowych . 23 (4): 654–662. doi : 10.1093/nar/23.4.654 . PMC 306734 . PMID 7899087 .
- Zanier K, Luyten I, Crombie C, Muller B, Schümperli D, Linge JP, Nilges M, Sattler M (styczeń 2002). „Struktura spinki do włosów mRNA histonów wymagana do regulacji cyklu komórkowego ekspresji genów histonów” . RNA . 8 (1): 29–46. doi : 10.1017/s1355838202014061 . PMC 1370228 . PMID 11871659 .
- Zhang M, Lam TT, Tonelli M, Marzluff WF, Thapar R (kwiecień 2012). „Interakcja szpilki mRNA histonu z białkiem wiążącym pętlę łodygi (SLBP) i regulacja kompleksu SLBP-RNA przez fosforylację i izomeryzację proliny” . Biochemia . 51 (15): 3215–3231. doi : 10.1021/bi2018255 . PMC 3328597 . PMID 22439849 .