Racemaza fenyloalaniny (hydrolizująca ATP)
| Racemaza fenyloalaniny (hydrolizująca ATP) | |||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
 Racemaza fenyloalaniny (hydrolizująca ATP), obraz z Protein Data Bank
| |||||||||
| Identifiers | |||||||||
| nr WE | 5.1.1.11 | ||||||||
| nr CAS | 37290-95-2 | ||||||||
| Bazy danych | |||||||||
| IntEnz | Widok IntEnz | ||||||||
| BRENDA | Wpis BRENDY | ||||||||
| ExPASy | Widok NiceZyme | ||||||||
| KEGG | Wpis KEGG | ||||||||
| MetaCyc | szlak metaboliczny | ||||||||
| PRYM | profil | ||||||||
| Struktury PDB | RCSB PDB PDBe PDB suma | ||||||||
| |||||||||
Enzym racemaza fenyloalaniny ( EC 5.1.1.11 , racemaza fenyloalaniny , racemaza fenyloalaniny (hydrolizująca trifosforan adenozyny ) , syntetaza gramicydyny S I ) jest enzymem działającym na aminokwasy i pochodne. Aktywuje zarówno stereoizomery L, jak i D fenyloalaniny, tworząc adenylan L-fenyloalanylu i adenylan D-fenyloalanylu, które są związane z enzymem. Te związane związki są następnie przenoszone do grupy tiolowej enzymu, po czym następuje konwersja jego konfiguracji, przy czym izomer D jest bardziej korzystną konfiguracją z dwóch, ze stosunkiem między dwoma izomerami 7 do 3. Reakcja racemizacji fenyloalaniny jest połączona z wysoce korzystną hydrolizą trójfosforan adenozyny (ATP) do monofosforanu adenozyny (AMP) i pirofosforanu (PP), termodynamicznie pozwalając na jego przebieg. Ta reakcja jest następnie kontynuowana przez dalszą hydrolizę PP do nieorganicznego fosforanu (Pi ) , zgodnie z zasadą Le Chateliera .
Inne nazwy
- racemaza fenyloalaniny
- racemaza fenyloalaniny (hydrolizująca trójfosforan adenozyny)
- syntetaza gramicydyny S I
Ścieżka
- Metabolizm fenyloalaniny
podłoże
- L – Fenyloalanina
Produkt
- D - Fenyloalanina
Kofaktor
- Fosforan pirydoksalu (aktywna forma witaminy B 6 )
Linki do choroby
Problemy z trawieniem fenyloalaniny (phe) do tyrozyny (tyr) prowadzą do gromadzenia się zarówno fenyloalaniny, jak i fenylopirogronianu w chorobie zwanej fenyloketonurią (PKU). Te dwa związki gromadzą się we krwi i płynie mózgowo-rdzeniowym, co może prowadzić do upośledzenia umysłowego, jeśli nie jest leczone. Leczenie polega na ograniczeniu diety do pokarmów, które zawierają phe lub związki, które mogą rozkładać się na phe. Dzieci w USA są pod tym kątem rutynowo badane po urodzeniu. Aby uzyskać więcej informacji, zobacz dotyczącą fenyloketonurii lub poniższy link.
Szybkie fakty
- Zakres pH = 7,2 – 8,6
-
Stosunek równowagi: L-Phe:D-Phe = 3:7 - Specyficzna aktywność: 0,019
Reakcja
| L - Fenyloalanina | Racemaza fenyloalaniny | D - Fenyloalanina | |
|
|
||
| ATP | AMP + PP | ||
|
|||
Związek C00079 w KEGG Pathway Database. Związek C00002 w KEGG Pathway Database. Enzym 5.1.1.11 w KEGG Pathway Database. Związek C00020 w KEGG Pathway Database. Związek C00013 w KEGG Pathway Database. Związek C00001 w KEGG Pathway Database. Reakcja R00686 w KEGG Baza danych ścieżek. Pathway MAP00360 w KEGG Pathway Database. Związek C00018 w KEGG Pathway Database. |}
Zobacz też
- Takahashi H, Sato E, Kurahashi K (1971). „Racemizacja fenyloalaniny przez racemazę fenyloalaniny zależną od trifosforanu adenozyny z Bacillus brevis Nagano”. J. Biochem . 69 (5): 973-6. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a129548 . PMID 5577156 .
- E. Conti; T.Stachelhaus; mgr Marahiel; Cegła P. (1997). „Strukturalne podstawy aktywacji fenyloalaniny w nierybosomalnej biosyntezie gramicydyny S” . EMBO J. 16 (14): 4174–4183. doi : 10.1093/emboj/16.14.4174 . PMC 1170043 . PMID 9250661 .
Linki zewnętrzne
- Białkowy Bank Danych 1amu [1]