prosapozyna

PSAP
Dostępne konstrukcje WPB Wyszukiwanie ortologów: Lista kodów identyfikacyjnych PDB
Identyfikatory
	, GLBA, SAP1, prosaposin, SAP2, PSAPD, PARK24
Identyfikatory zewnętrzne
Lokalizacja genu ( człowiek ) Chr. Zespół Początek Koniec
Lokalizacja genu ( mysz ) Chr. Zespół Początek Koniec
Wzór ekspresji RNA Błagam Człowiek Mysz (ortolog) BioGPS
Ontologia genów Funkcja molekularna Komponent komórkowy Proces biologiczny Źródła: Amigo / QuickGO
ortologi Gatunek Człowiek Mysz Entrez Ensembl UniProt RefSeq (mRNA) RefSeq (białko) Lokalizacja (UCSC) PubMed search
Wikidane
Wyświetl/edytuj człowieka Wyświetl/edytuj mysz

Prosapozyna , znana również jako PSAP , jest białkiem kodowanym u ludzi przez gen PSAP .

Ta wysoce konserwatywna glikoproteina jest prekursorem 4 produktów rozszczepienia: sapozyn A, B, C i D. Sapozyna to skrót od Sphingolipid A ctivator P r O [ S ]te IN s . Każda domena białka prekursorowego ma długość około 80 reszt aminokwasowych z prawie identycznym rozmieszczeniem reszt cysteiny i miejsc glikozylacji. Sapozyny AD lokalizują się głównie w lizosomalnym , gdzie ułatwiają katabolizm glikosfingolipidów z krótkimi grupami oligosacharydowymi . Białko prekursorowe istnieje zarówno jako białko wydzielnicze, jak i integralne białko błonowe i ma aktywność neurotroficzną .

Sapozyny A – D są wymagane do hydrolizy niektórych sfingolipidów przez określone hydrolazy lizosomalne.

Członkowie rodziny

• Sapozynę A zidentyfikowano jako domenę N-końcową w cDNA prosapozyny przed jej izolacją. Wiadomo, że stymuluje enzymatyczną hydrolizę 4-metyloumbelliferylo-β-glukozydu, glukocerebrozydu i galaktocerebrozydu .
• Sapozyna B była pierwszą odkrytą i okazała się niezbędna jako czynnik termostabilny do hydrolizy sulfatydów przez arylosulfatazę A. Jest znany pod wieloma różnymi nazwami, takimi jak białko aktywatora sfingolipidów-1 (SAP-1), białko aktywatora sulfatydu, aktywator gangliozydu GM ₁ , dyspersyna i niespecyficzne. Zaobserwowano, że ta konkretna sapozyna aktywuje wiele enzymów poprzez oddziaływanie z substratami, a nie z samymi enzymami.
• Sapozyna C była drugą odkrytą sapozyną i stymuluje hydrolizę glikocerebrozydu przez glikozyloceramidazę i galaktocerebrozydu przez galaktozyloceramidazę.
• Sapozyna D nie jest dobrze znana ze względu na brak badań w tym momencie. Zostało to przewidziane na podstawie sekwencji cDNA prosapozyny, podobnie jak sapozyny A. Stymulacja enzymatyczna jest bardzo specyficzna dla tej konkretnej glikoproteiny i nie jest do końca zrozumiała.
• GM2A (aktywator gangliozydu GM2) był postrzegany jako członek rodziny SAP i został nazwany SAP-3 (białko aktywatora sfingolipidu 3)

Struktury krystaliczne ludzkich sapozyn AD

• 

  Sapozyna A (​).

• 

  Sapozyna B (​).

• 

  Dimer sapozyny C w konformacji otwartej (​).

• 

  Sapozyna D (​).

Struktura

Każda sapozyna zawiera około 80 reszt aminokwasowych i ma sześć równomiernie rozmieszczonych cystein, dwie proliny i miejsce glikozylacji (dwa w sapozynie A, po jednym w sapozynach B, C i D). Ponieważ sapozyny charakteryzują się ekstremalną stabilnością termiczną, obfitością wiązań dwusiarczkowych i odpornością na większość proteaz, zakłada się, że są to cząsteczki niezwykle zwarte i sztywno połączone wiązaniami dwusiarczkowymi. Każda sapozyna ma strukturę α-helikalną, która jest uważana za ważną dla stymulacji, ponieważ ta struktura jest maksymalna przy pH 4,5; co jest optymalne dla wielu hydrolaz lizosomalnych. Ta spiralna struktura jest widoczna we wszystkich (zwłaszcza w pierwszym regionie), ale przewiduje się, że sapozyna ma konfigurację arkusza β dzięki pierwszym 24 aminokwasom N-końca.

Funkcjonować

Prawdopodobnie działają poprzez izolację substratu lipidowego od otoczenia błony, czyniąc go bardziej dostępnym dla rozpuszczalnych enzymów degradujących . który zawiera cztery domeny sapozyny-B , dając aktywne sapozyny po rozszczepieniu proteolitycznym, oraz dwie domeny sapozyny-A , które są usuwane w reakcji aktywacji. Domeny sapozyny-B występują również w innych białkach, z których wiele jest aktywnych w lizie błon.

Znaczenie kliniczne

Mutacje w tym genie zostały powiązane z chorobą Gauchera , chorobą Taya-Sachsa i leukodystrofią metachromatyczną .

Zobacz też

• Domena białkowa sapozyny

Dalsza lektura

•    Gieselmann V, Złotogóra J, Harris A i in. (1995). „Genetyka molekularna leukodystrofii metachromatycznej” . Szum. Mutacja . 4 (4): 233–42. doi : 10.1002/humu.1380040402 . PMID 7866401 . S2CID 23519007 .
•   Schnabel D, Schröder M, Fürst W i in. (1992). „Jednoczesny niedobór białek aktywatora sfingolipidów 1 i 2 jest spowodowany mutacją w kodonie inicjacji ich wspólnego genu” . J. Biol. chemia . 267 (5): 3312–5. doi : 10.1016/S0021-9258(19)50733-5 . PMID 1371116 .
•    Hiraiwa M, Soeda S, Kishimoto Y, O'Brien JS (1993). „Wiązanie i transport gangliozydów przez prosapozynę” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 89 (23): 11254–8. doi : 10.1073/pnas.89.23.11254 . PMC 50528 . PMID 1454804 .
•   Rorman EG, Scheinker V, Grabowski GA (1992). „Struktura i ewolucja ludzkiego genu chromosomalnego prosapozyny”. Genomika . 13 (2): 312–8. doi : 10.1016/0888-7543(92)90247-P . PMID 1612590 .
•   Kondoh K, Hineno T, Sano A, Kakimoto Y (1992). „Izolacja i charakterystyka prosapozyny z mleka kobiecego”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 181 (1): 286–92. doi : 10.1016/S0006-291X(05)81415-9 . PMID 1958198 .
•    Holtschmidt H, Sandhoff K, Fürst W i in. (1991). „Organizacja genu ludzkiego białka aktywatora siarczanu cerebrozydu”. FEBS Lett . 280 (2): 267–70. doi : 10.1016/0014-5793(91)80308-P . Identyfikator PMID 2013321 . S2CID 38952277 .
•   Holtschmidt H, Sandhoff K, Kwon HY, et al. (1991). „Białko aktywatora sulfatide. Alternatywny splicing, który generuje trzy mRNA i nowo odkrytą mutację odpowiedzialną za chorobę kliniczną” . J. Biol. chemia . 266 (12): 7556–60. doi : 10.1016/S0021-9258(20)89483-6 . Identyfikator PMID 2019586 .
•   Hineno T, Sano A, Kondoh K i in. (1991). „Wydzielanie prekursora aktywatora hydrolazy sfingolipidowej, prosapozyny”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 176 (2): 668–74. doi : 10.1016/S0006-291X(05)80236-0 . Identyfikator PMID 2025281 .
•    Schnabel D, Schröder M, Sandhoff K (1991). „Mutacja w białku aktywatora sfingolipidów 2 u pacjenta z wariantem choroby Gauchera”. FEBS Lett . 284 (1): 57-9. doi : 10.1016/0014-5793(91)80760-Z . PMID 2060627 . S2CID 42681055 .
•    Zhang XL, Rafi MA, DeGala G, Wenger DA (1991). „Mechanizm insercji 33 nukleotydów w mRNA powodujący leukodystrofię metachromatyczną z niedoborem białka aktywatora sfingolipidów (SAP-1)”. Szum. Genet . 87 (2): 211–5. doi : 10.1007/BF00204185 . PMID 2066109 . S2CID 23791396 .
•   Fürst W, Schubert J, Machleidt W, et al. (1990). „Pełne sekwencje aminokwasowe ludzkiego białka aktywatora gangliozydu GM2 i białka aktywatora siarczanu cerebrozydu”. Eur. J. Biochem . 192 (3): 709–14. doi : 10.1111/j.1432-1033.1990.tb19280.x . PMID 2209618 .
•   Rafi MA, Zhang XL, DeGala G, Wenger DA (1990). „Wykrywanie mutacji punktowej w mRNA białka aktywatora sfingolipidów-1 u pacjentów z wariantem postaci leukodystrofii metachromatycznej”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 166 (2): 1017–23. doi : 10.1016/0006-291X(90)90912-7 . PMID 2302219 .
•    Kretz KA, Carson GS, Morimoto S i in. (1990). „Charakterystyka mutacji w rodzinie z niedoborem sapozyny B: wada miejsca glikozylacji” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 87 (7): 2541-4. Bibcode : 1990PNAS...87.2541K . doi : 10.1073/pnas.87.7.2541 . PMC 53725 . PMID 2320574 .
•   Nakano T, Sandhoff K, Stümper J i in. (1989). „Struktura pełnej długości cDNA kodującego aktywator sulfatydowy, Co-beta-glukozydazę i dwa inne homologiczne białka: dwie alternatywne formy aktywatora sulfatydowego”. J. Biochem . 105 (2): 152–4. doi : 10.1093/oxfordjournals.jbchem.a122629 . Identyfikator PMID 2498298 .
•   Rorman EG, Grabowski GA (1990). „Klonowanie molekularne cDNA ludzkiej ko-beta-glukozydazy: dowód na to, że cztery białka aktywatora hydrolazy sfingolipidowej są kodowane przez pojedyncze geny u ludzi i szczurów”. Genomika . 5 (3): 486–92. doi : 10.1016/0888-7543(89)90014-1 . PMID 2515150 .
•    Morimoto S, Martin BM, Yamamoto Y i in. (1989). „Sapozyna A: drugie białko aktywatora cerebrozydazy” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 86 (9): 3389–93. Bibcode : 1989PNAS...86.3389M . doi : 10.1073/pnas.86.9.3389 . PMC 287138 . PMID 2717620 .
•    Dewji NN, Wenger DA, O'Brien JS (1988). „Sekwencja nukleotydowa sklonowanego cDNA dla ludzkiego prekursora białka aktywatora sfingolipidów 1” . proc. Natl. Acad. nauka USA . 84 (23): 8652–6. doi : 10.1073/pnas.84.23.8652 . PMC 299604 . PMID 2825202 .
•   O'Brien JS, Kretz KA, Dewji N i in. (1988). „Kodowanie dwóch białek aktywatorów sfingolipidów (SAP-1 i SAP-2) przez to samo locus genetyczny”. nauka . 241 (4869): 1098–101. Bibcode : 1988Sci...241.1098O . doi : 10.1126/science.2842863 . Identyfikator PMID 2842863 .
•   Morimoto S, Martin BM, Kishimoto Y, O'Brien JS (1988). „Sapozyna D: aktywator sfingomielinazy” . Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 156 (1): 403–10. doi : 10.1016/S0006-291X(88)80855-6 . PMID 2845979 .
•   Dewji N, Wenger D, Fujibayashi S i in. (1986). „Klonowanie molekularne białka aktywatora sfingolipidów-1 (SAP-1), aktywatora sulfatazy sulfatydowej”. Biochem. Biofiza. Rez. Komuna . 134 (2): 989–94. doi : 10.1016/S0006-291X(86)80518-6 . PMID 2868718 .

Linki zewnętrzne

• Sapozyny w US National Library of Medicine Medical Subject Headings (MeSH)